商毅當然知道，要打破目前的不利局麵，當務之及是扶植一支鄭氏餘勢力量，在福建起兵，牽製清軍的力量，這樣才能減少自己的後顧之憂，集中兵力投入到收複南京的計劃中。而鄭氏餘勢力量中，能夠扶植的，當然隻有鄭成功了。雖然鄭成功的性格中有不少缺點，但在抗清這一點上，是絕對堅定不移的。因此在鄭成功出使杭州之後，商毅也一直保持著和鄭成功的聯係，也就是為這一刻準備的。
不過在另一時空裏，在鄭芝龍被清軍挾持之後，鄭成功差不多花了近一年的準備時間，才開始正式出兵抗清，雖然取得了一些成果，但終於是因為鄭成功崛起的時間太晚，南眀的最好機遇，已經錯過了。
而現在己是七月中旬，跨海突襲，收複南京的計劃己經迫在眉睫，商毅也不可能等鄭成功慢慢的積攢力量，因此要利用自己的名望，幫助鄭成功，盡快擴充實力，整合鄭芝龍的餘部，讓他在短時間內俱備在福建和清軍作戰的實力。牽製清軍的兵力。
鄭成功雖然己經誓師起兵，但這時他手下兵不滿千，將不過數員，船不過三十餘艘，而且安平是彈丸之地，地方狹小，又無險可守，不能做為基礎，也可以說是萬事艱難。在這種情況下，商毅主動向鄭成功表示支持，並且原意給他提供物貨軍器錢糧，完全就是雪中送碳，而且鄭成功對商毅一向敬佩，因此對商毅更是感激萬分。
於是鄭成功也立刻給商毅回信，向商毅表示了自己的感謝之情。並且表示原意接受商毅的幫助。正好這時駐守南澳的陳豹也派人來向鄭成功表示效忠，並且願意把自己部下的三千餘眾的兵力全部都交給鄭成功指揮。
南澳是位於福建最南端，漳州府與潮州府交界的一個海島，麵積約在近五千平方公裏，而是距離陸地隻有三十餘裏的海路，和台灣隔海相望，進可攻，退可守，地曆位置十分優躍，一直都是南部沿海的總要島嶼。而陳豹是追隨鄭芝龍多年的舊部，為鄭氏十分忠心，而且在漳州府、潮州府沿岸一帶頗有名望。得到了他的幫助和支持，對鄭成功起兵，使鄭成功在起兵之初，不僅馬上擴大了兵力，而且有了一塊立足之地，起到至關重要的作用。
因此鄭成功也約請商毅，到南澳島來會麵。
收到了鄭成功的回信之後，商毅也十分高興，首先命先駐守台灣的沈壽嶽帶一個團的兵力，首先趕到南澳島，和鄭成功會麵。
這個時侯商毅已經向台灣移民三十餘萬，加上台灣本地的居民，和從日本掠帶過來的人口，總計在商毅治下的人口己經超過了四十萬，組成了大小數百個村落。而且和台灣的大部份土著都保持著良好的關糸，現在己經占據了台灣七成以上的土地，並且在北部地區，興建了基隆、宜蘭、新竹、桃源四座城市，還開墾了大量的良田，煤礦、鐵礦、金礦等，不僅完全實際了自己自足，而且還能支應浙江一部份物資，也呈現出十分興旺發達的景像，與荷蘭人統製的地區呈現出截然不同的樣子。
而原來駐守台灣的沈氏三兄弟中，沈壽崇早就被調理了台灣，現在出任第一軍第十師的師長，但沈壽嶢和沈壽嶽依然還留守台灣，一個擔任台灣海軍指揮官，一個擔任台灣陸軍指揮官，不過台灣的駐軍，都是隸屬於海軍部管轄。
現在台灣的駐軍有兩個正式的步兵團，另有兩個民兵團，區別在於步兵團是標準裝配步槍和火炮，而民兵團沒有裝配步槍和火炮，還是使用冷兵器，不過並沒有進行師、旅級的編製，而是統稱為台灣駐軍，另外還有戰船三十餘條，不過基本都是老式戰船，新船不足十艘。
因為台灣離南澳近，而且台灣駐軍反正閑著也沒事，因此商毅首先派台灣駐軍到達南澳島，作為自己的先行者，同時還給鄭成功送來了一批糧食。
現在糧食是鄭成功現在最缺少的物資, 得到這批糧食之後，也解決了鄭成功的一個大問題，於是有更多的人都投奔鄭成功，勢力也在迅速擴大起來。
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