一個感情容易衝動的人，當他發脾氣的時候，往往不顧一切。怎樣研究類似這種感情衝動呢？巴甫洛夫的女學生別茨波卡婭，使用閃爍的電燈光作為信號，對狗進行強烈的刺激，狗不僅分泌大量的唾液來回答這種刺激，而且還撲向電燈泡，狗在發脾氣呢I別茨波卡婭根據實驗和其他資料，寫出了她的博士論文，論文的題目叫《條件反射生理學的資料》。巴甫洛夫敏銳地看到了這篇論文的重要性：它是對大腦的初步探索。因此巴甫洛夫充分地肯定了這篇論文，並且決心維護它。
當時聚集在彼得堡的一些唯心主義科學家，決定利用他們在軍事醫學院的多數，企圖使這篇博士論文得不到通過，以此來打擊巴甫洛夫。1913年3月的一天，舉行了學位論文答辯，參加的人除醫學理事會的成員外，還有不少來賓，其中包括來自外國的科學家。
論文宣讀完畢，別茨波卡婭順利地通過了答辯。
但是，最後表決時，那些反對派除一個人放棄了原來的見解外，其餘的人全都投了反對票。這樣，別茨波卡婭的論文就被否定了。
對此，巴甫洛夫非常憤怒，他好不容易克製住自己的衝動，走向講台，冷靜地說道：
“先生們！在這裏進行著一種最不公平的勾當。你們或許認為，我將因此而受到損失，不，不會的，真正受到損失的，是反對客觀地研究大腦科學的敵人本身。
“此外，我要告訴你們，我不能再是你們理事會的會員了，我要退出學院。”
巴甫洛夫說完之後，憤怒地穿過人群向大門外走去。
巴甫洛夫退出軍事科學院這件事，當時便很快傳遍了各大學校園，這是對反動勢力的一次有力的打擊。
後來，隨著革命學生運動的高漲，學院當局不得不做出讓步，重新通過了別茨波卡婭的博士論文，並派出代表團，請求巴甫洛夫回到學院來。
巴甫洛夫勝利了，他重新站在了軍事醫學院的講台上。
曾經發生過這樣一件事，在巴甫洛夫的實驗室裏，有一位名叫斯納爾斯基的醫師，他常常在實驗室裏談論一隻叫瓦倫的狗。
瓦倫是他作研究用的，他對瓦倫一直十分喜愛。他對大家說，他的瓦倫有觀察力，有智意，能聯想，還說瓦倫有敏感性和懷疑性。也就是說，他認為狗也具有高級心理。
有一天，巴甫洛夫就這個問題發起了一場爭論。斯納爾斯基仍然堅持他的觀點，他認為：“如果要想理解和解釋狗為什麼流唾液，那麼，就不能忽略它的心理狀態。”他對自己的觀點解釋了一遍。
巴甫洛夫靜靜地聽完他的解釋後，開始向他發問：“請你告訴我，你是怎樣判斷狗的這些聯想的呢?”
接著，巴甫洛夫又引用了一次實驗結果來證明自己的觀點，駁斥對方毫無根據的胡說八道。
當斯納爾斯基的種種辯解都被巴甫洛夫一一駁斥之後，理屈詞窮的他麵帶著狡猾的微笑說：“這不僅僅是我自己的觀點，你自己，在+久以前也曾承認這種心理性分泌的，我現在還可以引用您的話，巴甫洛夫被他的狡辯激怒了，立刻打斷他的話說：“不要在這上麵費心了吧，這是一種最沒有力量的證據，隻有神學院才教導我們這樣，用引用權威的話來代替科學證據。你要對我引用巴甫洛夫的話，你們的巴甫洛夫錯了就是了。”
巴甫洛夫就是這樣喜歡辯論，但是，他始終堅持用“事實先生”來爭論的裁判。
同時，巴甫洛夫還有著博大的胸懷，勇於承認自己的過失，從不掩飾自己的錯誤。
阿遼沙和卡佳在巴甫洛夫重返軍事醫學院的那一年夏天，由小學升人中學。當得知巴甫洛夫已經回來時，他們便約好一起去看看老教授。
一天上午，正好教課的老師有事請假了，他倆飛快地來到了軍事醫學院。醫學院到底是大學堂，氣魄比他們的中學大多了。可是，他們並沒有在花草樹木之間逗留，一直向巴甫洛夫實驗室走去。實驗室裏的一位阿姨告訴他們：教授上課去了，他倆商量了一會兒，最後決定去聽聽教授是怎樣講課的。
他倆來到了教學大樓，打聽巴甫洛夫教課的課堂在哪兒？大學和中學不一樣，課堂不是固定的。總算運氣，他倆正好遇到一位去聽巴甫洛夫講課的女大學生，隨她一起進了課堂。這一次他倆沒有在最前排入座，而是在最後排坐下了。不一會兒，電鈴響了起來，教室裏坐滿了人，但一點兒聲音都沒有。這時，門開了，巴甫洛夫莊重地走上了講壇。突然不知誰叫了—聲，全體大學生都起立了。巴甫洛夫謙虛地用手示意請大家坐下，然後開始講起課來。阿遼沙和卡佳聽不明白教授講的是什麼，但是他們看到巴甫洛夫講話是極有精神的！教授是一個中等身材的人，方方的臉上有一對特別明亮的眼睛。他講話時，態度很嚴肅，很少見到他笑。每說一句話，差不多都要做手勢，這些手勢不但阿遼沙盯著看，那些大學生也在盯著看，巴甫洛夫的聲音既好聽又宏亮。