①血中膽固醇的一部分運送到組織，構成細胞膜的組成成分。
②膽固醇可脫氫生成7脫氫膽固醇，儲存於皮下，經紫外線照射可進一步轉化成維生素D3。
③膽固醇在肝髒可被氧化成膽酸，膽酸再與甘氨酸、牛磺酸結合，生成甘氨膽酸或牛磺膽酸等膽汁酸。膽汁酸的鈉鹽或鉀鹽隨膽汁經膽道排入小腸，可以促進脂類及脂溶性維生素的消化和吸收。
④膽固醇在腎上腺皮質細胞中可轉變成腎上腺皮質激素；在睾丸中可轉變成睾酮等雄性激素；在卵巢中可轉變成黃體酮等雌性激素。
體內大部分膽固醇在肝髒內轉變為膽汁酸隨膽汁排出，這是膽固醇排泄的主要途徑。一部分膽固醇也可以直接隨膽汁或通過腸黏膜進入腸道。進入腸道的膽固醇，一部分被重新吸收；另一部分則被腸道細菌還原，變成糞固醇隨糞便排出。膽固醇在體內的轉運歸納。
動物體內的脂類包括脂肪和類脂，它們在體內具有重要的生理功能，在血液中以血漿脂蛋白的形式進行運輸。當需要脂肪提供能量時，脂庫中的脂肪被水解為甘油和脂肪酸稱為脂肪動員。甘油轉變為α磷酸甘油，然後再脫氫生成磷酸二羥丙酮，可沿糖分解途徑進一步分解，或經糖異生途徑轉變為葡萄糖或糖原。脂肪酸活化為脂酰CoA後，在肉毒堿攜帶下進入線粒體，經過脫氫、加水、再脫氫和硫解四步反應，生成比原來少2個碳原子的脂酰CoA和1分子乙酰CoA，稱為一次β氧化過程。脂酰CoA經過多次β氧化過程，全部轉變為乙酰CoA（奇數碳原子脂肪酸還包括1分子丙酸）。在肌肉等組織中，乙酰CoA經過三羧酸循環徹底氧化分解為CO2和H2O，並釋放出能量；在肝髒中乙酰CoA則轉變為酮體，HMGCoA合成酶是此反應途徑的限速酶。肝髒中產生的酮體須運到肝外組織中利用，如果酮體的產生量大於消耗量，就會產生酮病。脂肪合成的直接原料是α磷酸甘油和脂酰CoA。α磷酸甘油可來自糖代謝的中間產物磷酸二羥丙酮；脂肪酸合成時以乙酰CoA為原料，乙酰CoA羧化酶是脂肪酸合成的限速酶。脂肪酸在胞液中合成，線粒體中的乙酰CoA通過檸檬酸——丙酮酸循環轉運入胞液，由NADPH供氫，在脂肪酸多酶體係催化下合成軟脂酸，合成反應不是β氧化的逆過程，二者之間有根本區別。動物體內脂肪的合成有兩條途徑：一條途徑是甘油磷酸二酯途徑；另外一條途徑是甘油一酯途徑。甘油磷脂在合成時需要甘油、脂肪酸（包括必需脂肪酸）、磷酸鹽、膽堿或膽胺、ATP和GTP等。膽固醇合成的原料是乙酰CoA，經複雜反應生成膽固醇，HMGCoA還原酶是該反應的限速酶。