機構設置中央機構編製委員會(2001)171號文件，調整事業單位名稱，本院第一名稱為北京航天總醫院(中國航天科技集團公司總醫院)。2002年12月27日，經北京市衛生局批準加掛北京航天總醫院。
2002年4月，經北京市衛生局批準為三級醫院。
在機構改革方麵，機關成立了4個部及4個辦公室，即：政治部、醫護質量部、綜合管理部、後勤保障部；院辦公室、紀檢監察辦公室、審計辦公室、工會辦公室。新設立了收費處、市場開發處、體檢中心、計算機中心。內、外科各專業組上升為一級科室，改革後共設有59個科室。
醫療工作門急診372202人次，其中急診41377人次，平均日門診1099人次。平均日急診113人次，急診搶救180人次，搶救成功160人次，成功率88.89%。入院6571人次，床位使用率54.46%；出院6650人次，床位周轉13.14次。
全年質控指標全部達標。出入院診斷符合率97.81%，住院手術1631人次，手術前後診斷符合率99.75%，手術後10天內死亡率1.10%，無菌切口感染率為零，院內感染率4.5%，無產婦死亡，門診處方合格率98%，門診3次確診率大於90%，住院病案甲級合格率95%，臨床病理診斷符合率100%。
全年開展新技術、新業務64項：心內科開展了永久心髒起搏器安裝；婦產科與麻醉科合作開展了腹腔鏡婦科手術、聯合麻醉用於分娩鎮痛等，與影像中心合作，開展了子宮動脈栓塞治療子宮肌瘤，產科開展了康樂待產和無痛分娩；影像中心介入室開展了頸動脈狹窄血管成形術；外科骨外專業開展了關節鏡、骨盆骨折內固定術、頸椎前路鋼板內固定術；泌尿外科開展了纖維輸尿管鏡下取石；普外開展了左半肝切除術、肝管空腸吻合術等；眼科開展了超聲乳化白內障摘除人工晶體植入術、視網膜脫離複位術；耳鼻喉科開展了支撐喉鏡下聲帶腫物切除術；兒科開展了口服安定預防驚厥、新生兒支架治療新生兒嘔吐等新療法；檢驗科開展了9項新試驗，用於急性心肌梗塞早期檢查的肌紅蛋白、肌鈣蛋白T、肌酸激酶同工酶MB(質量法)測定，用於反映凝血功能的凝血活酶時間測定，以及配套急診試驗，質控成績繼續保持北京市一級實驗室水平；功能檢查科開展了24小時動態血壓檢測；影像中心與呼吸內科合作開展了“利用CT支氣管鏡觀察中央型肺癌治療前後的變化”的課題；遺傳室開展了乙型肝炎病毒DNA項目的檢測等。
護理工作按三級醫院標準管理。全年各種治療護理590869人次，一級護理4408人次，合格率98.9%，參加搶救1893人次，各項質控指標均達到市衛生局的要求。護士繼續教育講課19次，護理考試及技術操作考核有2712人次參加，合格率99%。為330名護理人員進行了再注冊及為30年護齡人員頒發榮譽證書和紀念章。目前，已有護理本科學曆3人，護理大專學曆69人。
社區服務與預防保健全年門診谘詢54000人次，發放宣傳資料8000份，義務測血壓3840人次。配合東高地街道爭創文明示範社區工作，設立了社區呼叫係統，與友誼醫院建立了雙向轉診，完成了對轄區45歲以上人群肺癌高危人群的普查及35歲以上人群防癌普查工作，為本地區20名特困人員投入1840元進行了免費體檢。全年甲、乙類傳染病總發病率控製在1.27‰；計劃免疫五苗覆蓋率100%。完成了轄區267例精神病人的手冊更換，配合區精神衛生防治所完成了十六大期間重點病人的監管任務。
為航天大型飛行試驗任務先後派出26次醫護人員，32人次參加了試驗基地發射任務的醫療保健工作。職業病防治完成一院、二院、四院、五院等單位有害作業人員的體檢260餘人次，對有害作業現場檢測22個項目。
科研與教育建立了與北京市醫療專家協作網。聘請北大醫院、友誼醫院、協和醫院、醫科院腫瘤醫院等醫院的專家教授來本院指導醫療工作，有45人次參加中華醫學會全國性學術會議。放射科的課題“經導管子宮動脈栓塞術治療子宮平滑肌瘤”，經臨床多例治療均獲成功。有9篇論文參加航天科技集團公司第十八屆醫學年會。總醫院第四屆青年科技論文36篇，其中ICU科張英醫師的論文榮獲第一研究院第八屆青年科技論文二等獎。《中國航天醫藥雜誌》全年出版6期，並入選中國學術期刊光盤版。輸血科獲得北京市臨床輸血先進單位一等獎。17名技術骨幹分別送到北京同仁醫院、友誼醫院、協和醫院、北大醫院、中日友好醫院等市內大醫院進修。學術講課36次，醫務人員參加短期培訓176人次，工人崗位培訓16人次。完成了繼續教育基地的申報工作，成為北京市豐台區多學科繼續教育基地，健全了學分登記製度。
信息工作為適應醫療保險對醫院計算機網絡工作的要求，與北京市醫療保險信息係統聯網。成立了電子閱覽室。
管理工作做到了“六無一良好”，即無醫療事故、無消防隱患、無交通事故、無刑事案件、無丟失被盜、無遲到早退，衛生良好。計量工作被北京市質量技術監督局授予醫用計量器具受檢率100%單位。無償獻血、計劃生育工作取得了滿分的好成績。全年節水9萬餘噸，保持了節水型達標單位。汽車隊全年出車3600多次，安全行駛30萬公裏。為職工辦了5件實事。重新對浴室進行了裝修；新建一排自行車棚；為新來大學生新建單身宿舍21間；為改善機關辦公環境配備了200餘台空調；為使病人、本院職工24小時喝上熱水，更換電茶爐36台。7月25日，對舊住院樓進行了改造，12月30日竣工。新建鋼結構房屋550餘平方米，改造了18套體檢病房。新建一座封閉式垃圾站，完成了汙水站的改造、鍋爐房煤改氣工程。保持了花園式單位的稱號。
精神文明建設開展了“以優良質量、優質服務、優美環境使患者滿意”的三優一滿意活動。為使此項活動得到社會各界的廣泛支持和監督，召開了本地區16個單位的監督員座談會，製定了《行風監督員職責》及《致行風監督員的一封信》。向門診病人和住院病人公示了服務措施和承諾。開設了便民藥房，新建100餘平方米的門診輸液大廳，購置了輸液打針轉椅，把服務落實在每一個環節和流程上，為體檢人員提供免費營養套餐，全程陪護體檢。在門診大廳安裝了液晶顯示屏，周六、周日及春節、元旦等節假日保證全天門診；門診醫護人員實行了提前半小時上班，救護車24小時在急診室門外等候，保證急診綠色通道24小時暢通無阻，實行所有劃價收費項目在收費窗口一次完成。全年收到表揚信306封，錦旗29麵，拒收禮金11150元。
紀念建黨81周年，舉辦了“七一”黨在我心中演講比賽，發展黨員9名，預備黨員轉正11名。團委在青年中開展了溫馨一句話征集活動，共征集到80多句，建議200餘條。工會堅持職業道德教育與職工切身利益相結合，舉辦了人才、道德講座，《醫療事故處理條例》知識競賽等。在參加第一研究院舉辦的建院45周年係列活動中，保齡球比賽榮獲團體第三名和集體總分第六名，俞國偉獲得男子青年組鉛球金牌；在市、區衛生局舉辦的《公民道德建設實施綱要》演講比賽中，禹冬梅榮獲豐台區決賽二等獎，趙惠榮獲北京市三等獎；在豐台區藥品衛生監督局舉辦的《藥品管理法》演講中，郭麗麗獲第一名。(胡全喜)航天中心醫院(海澱區玉泉路15號)
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事業概況職工872人，其中醫師275人，主任醫師9人，副主任醫師69人，中級職稱104人，初級職稱93人；護理人員295人，包括高級職稱1人，中級職稱87人，初級職稱207人；技師91人；藥師39人；行政後勤人員172人。