為充分發揮區疾病預防控製中心作用，完善疾病預防控製體製建設，以區疾病預防控製中心新樓啟用為契機，調整了設置分散、服務對象單一的不合理的預防保健機構，將性病防治和結核病防治機構歸並區疾病預防控製中心，承擔起公共衛生、疾病預防控製和保健領域業務技術的服務與指導工作，形成綜合性預防保健機構。
進一步完善和規範了以區衛生監督所為主體的衛生監督執法體係，實現城市公共衛生的綜合管理和重心下移。根據本區實際需要，在衛生監督所原有44人的基礎上，采取公開招聘、擇優錄取的方法，從全區醫療機構中招收監督員21人，在應屆畢業生中招收3人，現有監督員68人。
為進一步理順監督執法機構和疾病預防保健機構的職能和關係，規範執法行為和技術服務行為，修改完善了《分工細則》，製定了《崇文區重大疫情應急處理預案》和《崇文區食物中毒事故處理預案》，定期召開協調會，隨時解決機構運行中出現的問題。在重大問題上，兩機構互相支持，密切配合，力爭達到同步前進、協調發展。
公共衛生與疾病防治全區甲乙類傳染病發病率137.21/10萬；丙類傳染病2729例，同比下降了54.89%。無野毒株引起的麻痹病例及狂犬病病例，無重大傳染病多發暴發疫情和重大食物中毒及生活飲用水汙染事件。
加強了對02、O157、流行性出血熱、艾滋病等傳染病的監測。從年初開始重點對外環境和食品中的02、O157進行了有計劃的監測采樣，及時處理水產品汙染事故，消毒麵積300多平方米，無急性腸道病例發生。
開放腸道門診9個，均於4月20日開診。全年共診治腸道門診4426人，其中本市3582人，外地844人，便培率99.53%。
結核病防治。全年共診治結核病208人次，新登記肺結核58例(包括本市及外地病人)，檢出菌陽111例，全部實行監化治療，監化率、統一化療方案使用率、首次查痰率均達到100%。完成了外來人口結核病控製課題研究，對105例進行了回顧性調查，在綜合醫院結核病人“歸口管理”工作中，收到綜合醫院報告卡197張，確診19例，同時不斷加大監督檢查力度。
性病防治。加強醫務人員專業知識培訓，在醫院、社區衛生服務中心開展多種形式的宣傳，在學校、社區、公共場所開展性病、艾滋病知識宣傳。對高危人群進行健康教育和監測，完成HIV監測500人份。
加大流感防治力度，做好對轄區59所中小學重點人群的流感預防工作，及時完成了流感監測和上報工作和流感疫苗接種月報工作。
計劃免疫。全年進行了5次查漏補種工作，全區共入戶調查外來兒童2150人，補種糖丸疫苗213人，新建接種卡205人，建證196人，其中零劑次兒童193人，無漏管現象。積極開展急性遲緩性麻痹病例主動搜索監測工作，監測113441例，無漏報。
四苗基礎免疫接種率保持了100%的高水平，無脊灰、白喉、乙腦病例發生。在保證完成消滅脊灰強化免疫活動和常規免疫工作的同時，積極開展麻風腮、流感新疫苗的接種。
感染防治。全年監測市、區級醫院12所，采樣1692件，合格1580件，合格率93.4%。監測聯合體醫院5家，采樣588件，合格560件，合格率95.2%。對轄區8所個體醫療診所采樣149件，合格116件，合格率77.8%。對25個托幼園所采樣608件，合格571件，合格率93.9%。完成鼠密度監測12次，233戶，合計3300夾日，捕鼠2種30隻，調查餐飲服務單位24家，209個房間，布粉塊675塊，陽性率2.67%；完成蟑螂密度監測12次，204家，布放粘板600塊，捕到蟑螂2種960隻；蚊指數監測72點次，捕蚊3種210隻；蠅指數168點次，捕蠅11種3559隻。
食品衛生。食品衛生經營單位共有3135戶，其中集體食堂229戶，飲食902戶，副食1639戶，飯店31戶，加工廠31戶，其他303戶。食品采樣8類，共監測3503件，合格3023件，合格率86.29%；餐飲工用具塗抹1961件，合格率86.28%。
繼續從“菜籃子”、“米袋子”等問題入手，通過查源頭、堵流通、清市場、抓大案、打窩點，深入開展食品專項打假鬥爭。全年共取締非法加工食品黑窩點16個，查獲並沒收銷毀各類假冒偽劣物品9.41噸，價值120多萬元。加強了對重點食品、重點單位、重點環節、重點人群的監督檢查，先後組織召開中小學校、建築工地、集貿市場及冷飲衛生工作會議，加強了對送餐企業、中小餐館的監督檢查，並與全區17個集貿市場負責人簽訂了責任書，根據食品消費季節特點，加大對旅遊黃金周、重大政治活動及開展整治市容市貌活動期間的食品衛生安全監督檢查和處罰力度，全年共監督12597戶次，合格12053戶次，合格率95.68%。行政處罰554起，立案23戶次，當場處罰521戶次，罰款266418元。按照北京市健康相關產品監督抽檢計劃要求，從4月開始進行了熟肉製品、糧油、調味品等監督檢查，保質保量地完成了監督抽檢任務。完成從業人員體檢19545人。
公共衛生。全區公共場所696戶，其中住宿業164戶，浴池43戶，美容美發業397戶，娛樂場所52戶，遊泳館8戶，商場28戶，其他行業4戶。
全區各類公共場所新審批監測26戶，1770件，合格1561件，合格率88.19%。複核衛生許可證監測6770件，合格6423件，合格率94.87%。經常性監測1658件，合格1612件，合格率97.23%。采遊泳池水132件，合格130件，合格率98.5%。采地麵水20件，合格率100%。采地下水12件，監測300項指標。采自來水180件，合格率100%。
全年公共場所監督1578戶次，二次供水監督339戶次，化妝品廠監督2戶次，共做出行政處罰287起，警告125起，罰款162起，金額147250元。專門舉辦公共場所、二次供水單位負責人培訓班。組織進行遊泳場館衛生安全檢查28戶次。完成從業人員體檢9102人。
勞動衛生。對全區41所廠礦企業進行調查，同時建立職業衛生檔案，其中21戶存在職業危害，關、停、並、轉、外遷7戶。共完成職業性危害作業場所監測11戶，共55件，合格42件，合格率76.36%；配合監督所完成本區幹洗店調查13戶，完成監測抽檢4戶，采樣14件，合格9件，合格率64.29%；全區共有醫用X光機37台，已監測24台，其中有3台新產品監測，共監測125點數，合格119點數，合格率95.2%；對放射個人劑量筆監測：應監測98人次，實測92人次，對個人大劑量核查2人次。
監督檢查有毒化學品用人單位20戶次，職業衛生監督105戶次，對全區40個工地的露天高溫作業、職業危害因素進行監督檢查指導並與工地負責人簽訂了職業衛生安全責任書。
學校衛生。進一步強化學校衛生監督，完善學校衛生基本情況檔案。完成學校衛生監督55校次，學校食堂及學生外供餐衛生監督348戶次，行政處罰10起，罰款7600元，監督頻次達400%，及時對處罰的學校進行複查，為確保學校食品衛生和飲用水安全，與全區36所學校食堂簽訂了食品衛生安全責任書，召開全區中小學責任人會議，進行法規培訓並提出要求。接待學校食堂衛生舉報7起，全部調查處理。