之後齊國被梁朝取代，在梁朝的天監九年（公元510年），梁武帝成為江南一帶的統治者，在他的領導下，人們才正式使用《大明曆》。但此時，距離祖衝之去世已經有十多年了。
祖衝之為了這部天文曆法，可謂嘔心瀝血，他最終沒能看到新曆法施行的一天。為了紀念祖衝之，中國紫金山天文台將新發現的“小行星1888”命名為“祖衝之小行星。”前蘇聯將在月球上發現的環形山命名為“祖衝之環形山”。
機械創造——指南車
指南車是用來指示方向的車子，車子中裝有木頭人。在車子開動之前，將木頭人的手指指向調整到正南方，這樣不論車子怎樣的轉彎，木人的手指頭始終指著南方不變。但是到了現代，指南車的製造方法早已經失傳，人們隻能根據留下來的古籍，大致地了解到，這種車子是利用齒輪的傳動來進行操控的。
曆史關於指南車的記載有很多，更早的要追溯到上古時期。相傳，上古時代，黃帝和蚩尤大戰，由於分不清方向，便製造指南車來辨別方向。但這隻不過是民間的神話傳說，不能當做曆史來看待。
根據文獻記載，三國時期的著名發明家馬鈞，他曾經做出過指南車，可惜，由於戰亂的緣故，指南車的製造方法失傳了。公元417年，東晉的大將軍劉裕，他發動了北伐戰爭，滅南燕，取道北魏，攻滅後秦，成就自東晉偏安江南以來，第一個北伐獲得成功的將領。在率軍接近後秦都城長安時，劉裕繳獲了一輛舊的指南車。可惜的是，車子裏麵的機械都已經損壞，不能再指向南方了，隻能在車子行動時，用手人工地轉動車上木人，才能讓它手指南方。再到後來，齊高帝蕭道成對指南車很感興趣，為了將車子複原，他聽聞祖衝之是機械方麵的大行家，所以下令祖衝之仿製指南車。
祖衝之根據留下來的文獻記載，他仔細分析了指南車的結構和機械原理，終於不辱使命，完成了指南車的製造。蕭道成聽聞車子造好，十分的高興，就派了自己十分器重的大臣僧虔、劉休二人前去試驗。兩人見識了祖衝之製造的指南車結構，指南車極其精巧，運轉靈活。祖衝之製造的指南車如傳說中的一樣了，不論他們怎樣的轉彎，車上木人的小手始終指著南方。祖衝之能夠根據有限的典籍，完成了一個早已失傳了的機械，兩位大臣對祖衝之敬佩的五體投地，後來，他們在齊高帝麵前對祖衝之讚不絕口。
祖衝之在製作指南車之前，曾經遇到了一個“對手”。當時，北朝來了一個名叫索馭驎的人，他在齊高帝麵前誇口，他說自己也能做出指南車來。齊高帝就命令兩人各自製作指南車，然後在皇宮內進行比賽。結果，祖衝之造好的指南車行動靈活，運轉自如。索馭驎做出的指南車卻“不聽使喚”，木頭人指的方向也不是南方。索馭驎羞憤難當，便將自己製作的指南車給砸毀，表示認輸。
祖衝之十分關注勞動人民的艱苦，他看到農民們做活都很吃力，就想著怎麼讓他們從繁重的勞作中解放出來。
在這之前，我國古代的勞動人民發明了舂米的水碓和磨米粉的水磨。西晉初年有一個名叫杜預的發明家，他和祖衝之一樣，有著根深蒂固的憫農思想，他發明了“連機碓”、“水轉連磨”兩大惠民工具。連機碓可以利用機械帶動好幾個石杵，一起一落的舂米，水轉連磨可以同時帶動八個水磨同時磨粉。
祖衝之認為，杜預的發明雖然很巧妙，但卻是治標不治本，隻是提高了對機械的使用，並沒有提高機械的性能。在杜預的基礎上，祖衝之進行了改進。他將水碓和水磨兩樣工具結合起來使用，這大大地提升了工作效率，同時還減輕了農民的負擔。祖衝之發明的東西深受老百姓的喜愛，他發明的便民工具，到現在，中國南方的一些村落還在使用。在水運交通上，祖衝之還發明了一種千裏船，雖然不能真的日行千裏，但日行百裏還是可以做到的，該船的航行原理是利用船輪激蕩流水，加上風力向前航行，大大地提升了我國水路航運。
公元500年，這位偉大的數學家、科學家走到了生命的盡頭，享年七十二歲。但他取得的成就至今被中國人稱頌，為了紀念祖衝之，郵政局曾經發行過祖衝之人物紀念郵票。