原文血弱氣盡，腠理開，邪氣因入，與正氣相搏，結於脅下。正邪分爭，往來寒熱，休作有時，默默不欲飲食。髒腑相連，其痛必下，邪高痛下，故使嘔也。小柴胡湯主之。服柴胡湯已，渴者，屬陽明也。以法治之。
(機理)97條對96條作了解釋，說明已病五六日，厥陰主氣之日，其人正氣不足，即血弱氣虛（盡應是虛），其所主之腠理開，邪因此內陷與正氣相搏，髒氣尚可禦邪，故留於少陽之分。脅下者，少陽、厥陰經往來之地。少陽之上，相火主之。少陽主升清陽，今邪從外入，入則阻清陽之升。清陽者，少火生氣也，其氣從肝出，鬱則易化風。今被外邪阻則鬱陽在胸脅難出，故證見胸脅苦滿，滿為窒塞，似脹非脹。清陽被鬱則陽不出，不出則惡寒；陽久鬱則化火，少陽化火則為風火，風鬱久必宣發，風行陽散則發熱汗出。陽散則邪重聚而阻，阻而複始，故休作有時。少陽為木，心為火，木本生火，鬱陽之風火上合心火，則有口苦、咽幹、目眩、心煩、喜嘔、默默不欲飲食之證，黃芩苦寒可清之。木本疏土，陽鬱則疏泄失職，水穀之津難升，於是水濕易化為痰飲，故以半夏辛、溫，燥濕降逆；柴胡苦、平，能解鬱升陽，清陽升則邪外出，上焦火散，中焦濕痰降化，則胸脅苦滿，往來寒熱等證可去，故以之為君。
清陽之鬱本正氣不足，人參扶三焦之氣以托邪外出，和甘草、生薑、大棗補中氣以滋化源，使邪去不複。雖然如此，人們的體質不同，其證仍有許多變化，所以加減之法亦多。若其人上焦之熱本盛，少陽之鬱火易與之相合故煩，去半夏、人參恐增上焦之火。上焦熱盛則煉津為痰，故加全栝蔞甘、寒，以祛熱痰則煩止。若其人中上焦之陽素盛，與鬱陽合，則心煩、喜嘔且渴，故去辛、溫之半夏，加人參、天花粉以清熱、益氣、生津。若其人中、上焦之陽素不足，鬱則氣停為水飲，水不化氣則小便不利；水氣上攻則心悸，故去黃芩之苦、寒，防止傷陽，加茯苓四兩以去停水。若鬱氣與停水結於脅下，則痞硬，故去大棗之壅滯，加牡蠣以破結利水。若其人肝血不足，鬱則肝氣難升而偏盛，肝氣入腹，木來乘土，則腹中痛，故去黃芩之苦、寒，防其化燥傷血，加白芍以柔肝，肝血足則氣舒緩而痛止。外有微熱，口不渴，為外邪未進入少陽，說明其人陽氣尚好，且內無邪熱，故去人參之補，恐戀邪，加桂枝以解表。兼咳者，為少陽鬱陽不升，肺中陰寒盛，其津化為飲，故加幹薑與半夏相合，溫肺化飲，加五味子以佐之，防溫化太過。去大棗、人參、生薑是為了防止飲邪與之相戀。少陽被鬱之陽散而仍渴者，當是風火已與陽明燥氣相合，可依法治之。97條的髒腑相連，其痛必下，邪高痛下，故使嘔，是指的少陽氣血已弱，邪入三焦陽鬱不升。肝經之支夾胃上行，上焦鬱則肝氣不條暢，胃氣難降而攣痛，且逆嘔。少陽經氣從上向下行，鬱則上焦邪甚，故脅痛。少陽之腑邪影響相表裏之肝，肝失條暢必使胃氣難下，故攣痛而氣逆嘔惡。邪在少陽之位，痛在胃中，故仍以小柴胡湯治之。
原文得病六七日，脈遲，浮弱，惡風寒，手足溫。醫二三下之，不能食而脅下滿痛，麵目及身黃，頸項強，小便難者，與柴胡湯，後必下重。本渴，而飲水嘔者，柴胡不中與也，食穀者噦。
(機理)六七日為過經，陰盡陽將複之時，脈遲，浮弱為陽氣本不足，外邪不盛，惡風寒當以畏寒為主。手足溫，說明陽氣有自複的可能。庸醫不知脈法，以手足溫為陽盛，故二三次攻下。結果胃陽傷而不能食，且使脾虛肝鬱，血不養肝，濕從風化。脅下滿痛為肝鬱；中陽傷而濕阻，清陽難升，膽汁泛溢，則麵目及身黃；頸項強為脾虛濕滯，濕從風陽上騰；小便難為脾虛不利水，濕從風化而不下行。醫不識此，以脅下滿痛為少陽證，誤與小柴胡湯。小柴胡湯和少陽，本質是攻少陽之鬱火，此病為肝血虛，風陽上升，得湯則少陽之陽被殺，風陽力少難升，三焦筋膜因陽氣升少而弛縱，腸失收澀，故肛門重墜，與痢之裏急後重相似。渴而飲水嘔者，停水為患。當以五苓散治之。醫見其嘔，以為是小柴胡湯證。與之則傷少陽之清陽，加之停水本是脾與膀胱之陽不足而成，於是中焦陽氣衰少，食穀不能運化。穀氣欲升，少陽無力，膈肌虛寒被穀氣衝擊則痙攣，故食穀則呃逆。噦，即呃逆。
原文傷寒四五日，身熱惡風，頸項強，脅下滿，手足溫而渴者，小柴胡湯主之。
(機理)傷寒四五日未過經，所以未經誤下。身熱、惡風、頸項強為太陽病之本證；脅下滿為鬱陽已內陷少陽；手足溫而渴，說明裏之鬱熱盛，故可以小柴胡湯加減，解表、升陽、散鬱熱則愈。小柴胡湯加減仍為小柴胡湯，故原文隻言小柴胡湯主之。此可以加桂枝、栝蔞實，去半夏。
原文傷寒，陽脈澀，陰脈弦，法當腹中急痛，先與小建中湯，不差者，與小柴胡湯主之。小建中湯方：桂枝三兩（去皮）甘草三兩、大棗十二枚、芍藥六兩生薑三兩、飴糖一升前六味，以水七升，煮取三升，去滓，內飴糖，更上微火，消解，溫服一升，日三服。嘔家不可用建中湯，以甜故也。
(機理)陽脈澀者浮取也，為衛陽不足，外邪易乘，有惡寒之證，故名曰傷寒。陰脈弦者重取也，為在裏，為筋膜因寒收斂之象，腹中痙攣故急痛。治當溫中緩急，小建中湯以桂枝、生薑之辛、溫，得白芍、飴糖之緩斂，走內而不達於表，溫中散寒；再得飴、芍、草、大棗緩急柔肝則痛止。中陽已建，寒急已解，而腹中仍痛者，脈弦為中陽雖複，陽鬱不升，故與小柴胡湯和解少陽，少陽和清陽升，木不乘土，則腹痛止。嘔家為胃不和，氣逆難降。小建中飴、甘、棗俱甘緩，壅滯中氣，使胃氣更難降，故不可用建中湯。