命曾布修《神宗正史》。
丙寅，罷五路經律通禮科。
丁卯，詔諸路使：“免役法依元豐八年見行條約施行。”
鄧溫伯言：“舊名潤甫，昨避高陳王諱，今請複舊名。”從之。
戊辰，同修國史蔡卞上疏言：“先帝盛德大業，卓然出千古之上，而《實錄》所紀，類多疑似不根，乞驗索審訂。重行刊定，使後世無所迷惑。”詔從之，以卞兼國史修撰。
己巳，遼除玉田、密雲流民租賦一年。
是月，知汝州蘇轍，降授左朝議大夫，徙知袁州。責詞略曰：“垂簾之初，老奸擅國，置在言路，使詆先朝，反以君父為仇，無複臣子之義。”中書舍人林希所草。老奸，蓋陰斥宣仁也。希典書命，自司馬光、呂大防、公著、劉摯等數十人之製，極其醜詆。一日，草製罷，擲筆於地曰：“壞盡名節矣！”
閏月，壬申，以陸師閔等二十三人為諸路提舉常平官。
癸酉，罷十科舉士法，從井亮采言也。
翟思言：“先帝正史，將以傳示萬世。訪聞秉筆之臣，多刊落事跡，變亂美實，以外應奸人誣詆之說。今既改命史官，須別起文，請降旨取《日曆》、《時政記》與今《實錄》參對。”從之。
甲申，以觀文殿學士安燾為門下侍郎。
以禮部侍郎孔武仲為寶文閣待製、知宣州。
乙酉，以工部尚書李之純為寶文閣待製、知單州，禦史劉拯言其為中丞時阿附蘇軾故也。
丙戌，虞策請複置天下義倉，每苗稅一石，出米五升，自來年為始，專充賑濟；從之。
貶通判杭州秦觀監處州茶鹽酒稅，以劉拯言其影附蘇軾、增損《實錄》也。
丁亥，詔神宗隨龍人趙世長等遷秩賜賚有差。
戊子，詔：“在京諸司所受傳宣中批，並候朝廷覆奏以行。”
癸巳，命知蘇州呂惠卿改知江寧府。
乙未，章惇入見，遂就職，命提舉修《神宗實錄》、《國史》。
戊戌，詔改隆祐宮曰慈德宮，前殿曰慈德，中曰仁明，後曰壽昌。
以黃履為禦史中丞。元豐末，履嚐為中丞，與蔡確、章惇、邢恕相交結，每確、惇有所嫌惡，則使恕道風旨於履，履即排擊之，時謂之“四凶”，為劉安世所論而出。至是驚複引用，俾報複仇怨，元祐正臣，無一得免矣。
帝之初即位也，程顥知扶溝縣，以檄至河南府，留守韓宗師問：“朝事如何？”顥曰：“司馬君實、呂晦叔作相矣。”又問：“果作相，當如何？”曰：“當與元豐大臣同。若先分黨與，它日可憂。”宗師曰：“何憂？”曰：“元豐大臣皆嗜利者，使自變其已甚害民之法，則善矣。不然，衣冠之禍未艾也。”至是其言乃驗。宗師，絳之子也。
庚子，遼賜西北路貧民錢。
五月，壬寅，罷修官製局。
甲辰，罷進士習試詩賦，專治二經。
遼主駐赤勒嶺。
己酉，詔以王安石《日錄》參定《神宗實錄》、《正史》。
初，安石將死，悔其所作，命從子防焚之，防詭以它書代。至是蔡卞即防家取以上之，因芟落事實，文飾奸偽，盡改元祐所修。
辛亥，劉奉世罷。
奉世為人，簡重有法度，常雲：“家世唯知事君，內省不愧作士大夫公論而已。得喪，常理也。譬如寒暑加人，雖善攝生者不能無病，正須安以處之。”時以章惇用事，力乞外。乃罷為真定府路安撫使，兼知成德軍。
癸醜，詔：“中外學官，非製科、進士、上舍生入官者，並罷。”
編類元祐群臣章疏及更改事條。
甲寅，殿中侍禦史郭知章言：“先帝辟地進壤，扼西戎之咽喉，如安疆、葭蘆、浮圖、米脂，據高臨下，宅險遏衝。元祐初，用事之臣委四寨而棄之，外示以弱，實生戎心。乞檢閱議臣所進章疏，列其名氏，顯行黜責。”惇等因開列初議棄地者自司馬光、文彥博而下凡十一人。惇奏曰：“棄地之議，司馬光、文彥博主之於內，趙昪、範純粹成之於外，故眾論莫能奪。若孫覺、王存輩，皆闇不曉事，妄議邊計者。至於趙昪、範純粹，明知其便，而首尾異同以傅會大臣，可謂挾奸罔上。夫妄議者猶可恕，挾奸者不可不深治。”帝以為然。
右正言張商英言：“先帝謂天地合祭非古。”詔禮部、太常詳議以聞。
以右正言上官均為工部員外郎。章惇方欲擅權，惡均異論，故罷均言職。尋以均權發遣京東西路刑獄。
戊午，遼有司言：“德勒諸部侵邊，統軍使出戰不利，招討使以兵擊破之。敦睦宮太師耶律安努及其子歿於陣。”
己未，以禮部侍郎楊畏為吏部侍郎。
初，呂大防既超遷畏，畏知章惇心複用，時惇居蘇州，有張擴者，惇妻之侄，畏托擴致意雲：“畏度事勢輕重，因呂大防、蘇轍以逐劉摯、梁燾輩；又欲並逐大防及轍，而二人覺之，遽罷畏言職。畏跡在元祐，心在熙寧、元豐，首為公辟路者也。”及惇赴召，百官郊迎，畏獨請間，語多斥大防。有直省官聞之，歎曰：“楊侍郎前日諂事呂相公，亦如今日見章相公也。”惇信畏言，故又遷吏部。
乙醜，尚書左丞鄧潤甫卒。潤甫首陳紹述，遂登政府。章惇議重謫呂大防、劉摯，潤甫不以為然，曰：“俟見上，當力爭。”無何，暴卒。
丁卯，嗣濮王宗暉卒。
是月，高麗國王運殂，遣使告於遼，遼遣蕭遵列等賻贈。
六月，知永興軍呂大防降授右正議大夫、知隨州，知青州劉摯落職，降授左朝議大夫、知黃州，知汝州蘇轍降授左朝議大夫、知袁州，以台諫交章論列故也。
來之邵等言知英州蘇軾詆斥先朝，甲戌，責授寧遠軍節度副使，惠州安置。
壬午，封高密郡王宗晟為嗣濮王。
癸未，以翰林學士承旨曾布同知樞密院事。
甲申，禮部言太學博士詹文奏乞除去王安石《字說》之禁，從之。
乙酉，詔知鄆州梁燾改知鄂州，知成德軍劉安世改知南安軍，管句西京崇福宮吳安詩監光州鹽酒稅，知虢州韓川改知坊州，權知應天府孫升改知房州，並落職降官；從左司諫翟思言也。
乙酉中書舍人林希言：“吏部侍郎、新除廬州王欽臣，傅會呂大防以致進用，豈可以侍從職名，寄之方麵！所有製詞，未敢撰進。”詔欽臣除集賢殿修撰、知和州。
詔崇政殿說書呂希哲守本官、知懷州，以劉拯言公著父子世濟奸邪故也。
丙戌，詔蔡確追複觀文殿學士，贈特進。
戊子，詔翰林學士兼侍講蔡卞充國史院修撰兼知院事。
辛卯，三省以監察禦史周秩所上二章進呈。讀至“向者有禦批，欲增隆皇太妃儀物，又如治平中議濮事。呂大防所以求去”，帝曰：“大防何嚐有言！今秩越次及之，是迎合也。”又讀至“邪說甚行，使天子不得尊其母”，帝曰：“此言，激怒也。如秩趨操甚狂，若置之言職，朝廷無安靜之理。”遂罷秩知廣德軍。
己亥，遼禁邊民與蕃部為婚。
秋，七月，庚子朔，遼主獵於赤山。
丙辰，張商英言呂希純於元祐中嚐繳駁詞頭不當及附會呂大防、蘇轍事，帝曰：“去冬以宮中缺人使令，因召舊人十數輩，此何係外廷利害，而範祖禹、豐稷、文及甫並有章疏，陳古今禍福以動朕聽，希純等又繳奏爭之，何乃爾也！”安燾對曰：“聞文及甫輩上書，亦為人所使。”帝曰：“必蘇轍也。”會中書舍人林希言呂希純嚐草宣仁皇後族人遷官誥，有曰“昔我祖妣正位宸極”，其言失當，及變亂奉祀禮文、薦牙盤食等數事，乃詔落希純職，知亳州如故。
丁巳，三省言：“範純仁、韓維朋附司馬光，毀訕先帝，變亂法度，純仁複首建棄地之議，滋養邊患。”詔純仁特降一官。
初，章惇請謫純仁，帝曰：“純仁持議公平，非黨也，但不肯為朕留耳。”惇曰：“不肯留，即黨也。”帝勉從惇請。
是日，追奪司馬光、呂公著等贈諡，貶呂大防、劉摯、蘇轍等官，詔諭天下。
元豐末，神宗嚐謂輔臣曰：“明年建儲，當以司馬光、呂公著為師保。”及公著卒，呂大防奉敕撰《神道碑》，首載神宗語，帝又親題其額。及章惇、蔡卞欲起史禍，先於《日曆》、《時政記》刪去“以司馬光、呂公著為師保”語，又請發光、公著塚，斫棺暴屍。三省同進呈，許將獨不言。惇等退，帝留將問曰：“卿不言，何也？”將曰：“發塚斫棺，恐非盛德事。”帝曰：“朕亦以為無益公家。”遂寢其奏。會黃履、張商英、周秩、上官均、來之邵、翟思、劉拯、井亮采，交章言光等畔道逆理，未正典刑，大防等罪大罰輕，未厭公論，凡十九疏。章惇悉以進呈，遂詔追光、公著贈諡，毀所立碑，奪王岩叟贈官，貶大防郢州居住，摯蘄州，轍筠州。曾布密疏請罷毀碑事，不報。
蘇頌方執政時，見帝年幼，諸臣太紛更，常曰：“君長，誰任其咎邪？”每大臣奏事，但取決於宣仁，帝有言，或無對者。惟頌奏宣仁，必再稟帝，有宣諭，必告諸臣以聽聖語。及言者劾頌，帝曰：“頌知君臣之義，無輕議也。”又曰：“梁燾每起中正之論，其開陳排擊，盡出公議，朕皆記之。”由是頌獲免，而燾與外祠。
初，李清臣冀為相，首倡紹述之說，以計去蘇轍、範純仁、亟複青苗、免役法。及章惇相，心甚不悅，複與為異。惇貶司馬光等，又籍文彥博以下三十人，將悉竄嶺表。清臣進曰：“更先帝法度，不能無過，然皆累朝元老，若從惇言，必大駭物聽。”帝然之。戊午，詔曰：“司馬光、呂公著、呂大防、劉摯等，各以等第行遣責降訖。至於射利之徒，脅肩成市，盍從申儆，俾革回邪，推予不忍之仁，開爾自新之路。今後一切不問，議者亦勿複言，所有見行取會《實錄》修撰官以下及廢棄渠陽砦人，自別依敕處分。”
來之邵、劉拯等乞複免役錢法。
是月，準布諸部侵遼之倒塌嶺，盡掠西路群牧馬去，東北路統軍使耶律實埒以兵追及，盡獲所掠而還。
遼太子洗馬劉輝上書言：“西邊諸蕃為患，士卒遠戍，中國之民疲於飛挽，非長久之策。為今之務，莫若城於鹽濼，實以漢戶，使耕田聚糧，以為西北之費。”言雖不行，識者韙之。