關於籌餉，由於海上用兵，官府和民間的資金儲備都已耗盡，然而靠著洋稅和商業稅收，每年有巨額的進款，得以支撐下去。雖有損失，也獲得了利益。這次日本違約挑釁，沿海各省奉旨嚴防，不能不從長計議，又由於輪船都調到福建海麵集結，各省的海口頓時失去了依靠。從前所設的炮台，有的地勢不利，有的樣式不對。還有人說，既然已經議和，重新設置炮台，會不會引起釁端呢？
要抓海防，應該萬分謹慎，多方考慮，三思而行。大家紛紛提出購買戰船、增置武器、增兵募勇，幸好目前還沒有戰事，我們還有時間計算經費是否足夠開支，局勢能否持久。
福建、廣東、江蘇、浙江、直隸與山東，以及孤懸海上的各島，凡可停泊輪船的地方，當然都應該逐步加以察勘，預先設防。不過，統籌七省的防禦，就好像一個人的身體，有氣隧、血海、筋脈、包絡、皮肉之分，也就有要害與非要害的區別。要害處應該嚴防，不大要緊的地方可以防而不嚴。天津有如腦袋和脖子；大江和三江入海之口猶如腰膂；關鍵的島嶼，如台灣和定海，則猶如左右手，可以保護頭項和腰脊，都必須加以嚴防，一天也不能放鬆警惕。其餘地方則可以視為髖髀，不能說無足愛惜，但也不必傾注全力去防守。
製造輪船，本來是因為沿海防不勝防，有了這種戰船，一日千裏，有警即赴，不會貽誤戰機，能夠以戰為防。但是五年隻造了十五艘船，不足以供海防全局之用。現在決定不撤福建船政局，就可以把購船的費用用來造船。
各式炮台，以西洋人的鐵製炮台最為堅固。其次就是磚砌的炮台，層層留有炮眼，頂上用鐵。磚厚兩尺，蓋成圓銳形。台身周圍用布袋裝沙，厚達五尺，加以保護。外麵挖掘寬三丈、深兩丈的濠溝就行了。磚炮台比鐵炮台費用少，功用相當。台上所安大炮，要對準船的來路，根據炮的射程來設計，要做到彈無虛發。炮床下麵要安裝活輪，隨時瞄準，也能省去移動的力氣。水麵開闊就安裝大炮，水麵狹窄就安裝小炮。
各個口岸的防禦設施，最好的莫過於普魯士的水雷。前年上海船政局有人告訴我，普魯士人顛（口旁顛）連（口旁連）己（口旁己）請求從福建船政局派出幾十名學生，隨他回國學造水雷。如果令他邀請師傅來福建，挑選學生就學，學成之後，就能鞏固海防，節省費用。
西洋人說，鐵甲戰艦足以製服輪船，而巨炮又可以擊破鐵甲。他們這番話的用意，大概是因為福建船政局造出了輪船，他們不服氣，向我們炫耀一番，表明他們有更好的東西。鐵甲船究竟有多麼厲害，我們就等著瞧吧。鐵甲戰艦購到後，加以察驗，隻要是必需的，多花一點錢也不可惜，如果沒有必要，則緩一步再議。
現在用兵缺乏軍餉，主要指望沿海各省提供，甘肅更是要依靠沿海省份。如果沿海各省由於本身要籌辦防務，急於自顧，紛紛提出停止支援西北，那麼西北有必須要打的仗，東南卻沒有可以指望的軍餉，大局怎麼能支撐下去呢？
諺語說：“扶起東邊，倒卻西邊。”海防的籌劃，應該從長久著眼。一開始就把全部家底鋪上去，不留餘地，如果今後商業稅衰減了，常規費用到哪裏去找？萬一島國侵略我們，天天都要調發部隊和軍餉，需用孔急，還有什麼辦法來應付呢？凡此種種，都要統籌合計，早訂計劃啊。
左宗棠知道，朝廷財政遇到大難題了。西北有戰事，沿海防務也須加強。但是，國防資源十分有限啊。如何合理地分配國防資源，保證塞防與海防兩不誤，成了一個尖銳的矛盾。左宗棠清醒地看到了這一點，他努力不與海防建設爭奪資源，西北軍餉的籌集遇到了巨大的挑戰。
這個問題在11月5日正式提上了朝廷的議事日程。這一天，清廷決定加強海防。許多朝廷重臣卷入了海防與塞防孰輕孰重的爭論，左宗棠置身於爭論之外，而是企圖另辟蹊徑，為自己的部隊需求餉源。
東南各省不給西征軍提供軍餉了，西征軍能不能向洋人借款呢？11月12日，他向朝廷提出商借洋款三百萬兩的申請。
左宗棠能夠體諒海防的困難，別人卻未必能夠為他在西北用兵著想。12月10日，直隸總督兼北洋大臣李鴻章上奏，要求國防政策一邊倒，將重點全部放在東南海防，並提出裁撤已經出塞和尚未出塞的所有部隊，將西征軍的軍餉用於海防。
李鴻章顯然有失於偏頗，於是有人跟他唱對台戲。12月19日，湖南巡撫王文韶上了一個針鋒相對的折子。他說，隻要俄國人不能在西北得逞，列強就不會在東南沿海挑起戰端。他也要求國防政策一邊倒，不過方向相反，是全力注重西北。
糧台官司
左宗棠正為糧運殫精竭慮，忽然接到報告：後方發生了變故。
河州回民閔殿臣與馬占鼇有仇，突然號召部眾占據大東鄉，宣布反清。造反者攻打寧河軍營。沈玉遂輕敵深入，進兵失利。閔殿臣擁有十幾萬追隨者，乘勝進攻州城，沈玉遂和張仲春等部奮力抵禦。
左宗棠趕緊分撥留防部隊分守關隘，令劉錦棠火速從西寧出兵大河家口，趕赴前線。老湘軍勁旅一到，閔殿臣招架不住，企圖突圍，被駐防軍阻擋。交戰十天，閔殿臣失敗投降，被處以死刑。
緊接著，同治時期落下了帷幕。1875年1月12日，同治皇帝駕崩。由於慈禧的存在，朝廷的既定政策沒有為此撼動，各項決策都保持著連續性。
左宗棠不同意將西征糧台移到肅州，袁保恒隻得提出申請，將西征糧台轉移到巴裏坤。左宗棠的意見占了上風。巴裏坤處於南路和北路之間，在這裏設立糧台總局，距離前線部隊近了很多。
袁保恒提議先買古城和濟木薩的糧食，但他還留了一手，建議不足的部分仍然從南路調運。他還請求從舊部皖軍中抽調部隊護送糧運。
但是，袁保恒的意見還得通過左宗棠這一關。朝廷將袁保恒的請求發到肅州，征求左宗棠的意見。左宗棠這時已經有了新的想法。他派出的幾路調查組已經有了反饋：從歸化和包頭出發，取道射台與大巴，直達巴裏坤，有一條商旅通行的道路，可以購買和雇用運載糧食的駱駝。北邊有糧，又有運載工具，為什麼不到包頭辦糧呢？
左宗棠把知州陳瑞芝招來，麵授機宜，令他前往包頭試辦。
3月10日，左宗棠給朝廷寫奏章，又把景廉和袁保恒不切實際的想法狠批了一通。
糧台必須緊隨大部隊之後。巴裏坤距離各軍駐紮的古城和濟木薩等地，路程為七百多裏。袁保恒說，糧台應該移設巴裏坤，這就做對了。不過，巴裏坤產糧不多，去年金順在那裏采辦軍糧，隻買到七千多石。所以我早就說過，北路應該兼收烏裏雅蘇台和科布多一帶的新舊糧食。
袁保恒提出將糧台遷移到巴裏坤，先買古城和濟木薩的糧食，其次還要從南路調運。小袁又是在說瞎話。古城的糧食，早就被景廉訂購了，巴裏坤的糧食，金順已經訂購，額爾慶額購買糧食，已經從我這裏領過錢了，還用得著小袁來操心麼？現在小袁要從古城和濟木薩買糧運回巴裏坤，再發給景廉和金順，哪有這樣辦事情的？何況古城與濟木薩的糧食已經賣掉了，小袁還能買到什麼？
南路的涼州、甘州、肅州和安西，我剛剛訂購了十九萬石糧食，數量倒是不少，隻是因為現銀不夠，還有五萬多石買不回來。這些糧食，要供張曜和宋慶兩軍食用，金順留在安西和肅州的部隊，以及涼州、甘州和肅州的所有城防軍、護運隊，也都靠這些糧食養活。如果還要增加收購量，青黃不接的季節，農民已經無糧可賣了，確實很難辦到。
既然糧台移到了巴裏坤，就應該在北邊廣開門路，采運糧食，這是明擺著的道理。我通過廣泛的調查，發現從歸化、包頭到射台和大巴一帶，路程共有十幾站，從大巴到巴裏坤，路程為十六站。這一路上，產糧的地方太多了！有些地方雖然沒有轉運站，甚至沒有地名，但過去的商旅前往巴裏坤、古城和烏魯木齊，總是走這條路，湖茶私販，也是通過此路銷到古城，曆任總督奏明有案，小袁怎麼就不知道呢？
近日我的炮兵司令鄧增跟隨金順到了巴裏坤，向我報告：巴裏坤商業繁榮，商人絡繹不絕，棉價、布價和糧價與內地相近。商人們都是來自烏裏雅蘇台和科布多一帶，所走的道路，就是上麵我說的那條捷徑。物價低，就說明路程近，運費不高。景廉曾寫信給金順，說從包頭運來的糧食確實不少，可見他是說了實話。我已令歸綏道崇繕再一次落實情況，一麵派人攜帶二萬兩銀子前往試點，采運一批糧食，再決定是否大規模推行。
袁保恒卻不搞調研。他把糧台移到巴裏坤，眼睛卻盯著我這裏，還是指望從肅州把糧食運過去。現在他趕製大車，已經購買拉車的騾子三千頭，看來是擋也擋不住了。可是天山的山嶺上都是石頭，從來沒有過車的轍跡，若是一輛車行走，加上人力推拉，可能還能走過險關，可是運糧隊的糧車載重，一輛接一兩，要過天山，千難萬險，必定是過不去的。袁保恒要把車子和糧食從肅州運到巴裏坤，即便不辭險阻，不惜勞費，還是可以肯定，一粒糧食也運不到目的地。
這可不是危言聳聽啊。算一筆賬就清楚了。
從肅州經安西越過哈密，共有二十四站，路程雖然隻有二千二百多裏，但各站之間的間隔很長，還要經過許多戈壁。騾子和駱駝必須吃水草，人要有柴薪，前麵的轉運站還沒到，人畜就疲乏了，必須停下養息。就算日夜兼程，也要三十多天才能趕到巴裏坤。每頭騾子每天要吃八斤料，每輛車子一名車夫，口糧每天需要兩斤。蘭州以西不產料豆，喂養都用青稞、大麥和粟殼，牲畜的食品，就是人的食品。車行三十多天，每車運載的糧食最多不過六百斤，喂養兩頭騾子，就消耗掉五百幾十斤，車夫又消耗六七十斤，車上的糧食就吃光了，哪裏還有餘糧運到巴裏坤？就算到了巴裏坤，又拿什麼東西喂養騾子，給車夫發放口糧？這不是白白浪費糧食嗎？
西北的轉運，一般適合用駱駝，因為駱駝吃得少，運得重，還能走過險地。駱駝在口內行走，吃的糧食不過三斤，白天放牧，晚上行走，可以節省草束。一個人可以管牽五頭駱駝，人的口糧也節省了。在口外行走，駱駝吃草不吃料，勞乏時隻要喂料一升，加鹽少許，又能恢複體力。所以關內外的部隊，都用駱駝而不用車。
袁保恒這個人真是不聽勸告啊。我早就告訴他，關外運糧，隻能用駱駝，不能用車，關內則要多用馱騾，少用車騾。天山沒有車路，關內的糧食難過天山。我還告訴他，買駱駝不如雇用駱駝，用官車不如用民車，已辦之車，隻可酌改州縣台車，以省喂養，但他至今還冥頑不靈，真是拿他沒有辦法！
現在車輛已經製成，采買的騍騾已經趕來，這時候，小袁才開始考慮拿什麼去喂養，還打算跑到肅州來辦理車運，又胡說什麼過去西路用兵，糧台都是設在肅州。他的依據是什麼呢？就是嶽鍾琪曾經用過兵車和糧車，黃廷桂曾分派車馱北過天山。小袁真是隻懂皮毛，不知內奧啊。嶽鍾琪的確用了兵車，但他是否成功了呢？他後來是否吸取教訓不用了呢？他的兵車過天山，也許是令士卒又推又拉，比較輕便，這些都無從詳考。
糧車的情況卻很清楚。嶽鍾琪在後麵的運糧隊抵達玉門布囊吉時，便下令停止前進。他知道車馱運糧太難太貴，便從巴裏坤派出三千人協助轉運。這件事，當時留下了記錄。由此可知，天山沒有車行的道路。袁保恒是一拍腦袋想當然啊。他想辦成不可能辦到的事情，於是拿過去的事情牽強附會，我真是看不懂他的心思。
從前西路用兵，皇上都派大員來到肅州和哈密辦理糧台，將糧食轉運給前敵部隊，他們的任務，都是籌集資金，調集車馱和駱駝。至於糧料和草束，必須根據前敵部隊的行蹤，尋找捷徑，計算費用，慎重地籌辦，才能辦好。道光六年，官軍征討張格爾，從北路向南路的阿克蘇推進，宣宗特意頒下十條手諭，指出肅州嘉峪關距離阿克蘇有五千多裏，在哈密設立總糧台是鞭長莫及，要求把烏魯木齊囤積的糧食運往阿克蘇，並在伊犁采買糧食，這樣就可以節省從內地轉運的費用。宣宗還指出，內地的軍械與火藥，不能從南路的吐魯番運到庫車，因為路途上有許多戈壁，應當改從北路越過冰嶺轉運阿克蘇。十分明顯，部隊在北路作戰，不應該從南路辦理轉運。
所以，袁保恒在遷移糧台之前，必須將烏裏雅蘇台、科布多及各地的運糧道路摸清楚，精心選擇，用買來的駱駝運輸北路的糧食，依次運到巴裏坤，等到巴裏坤的儲備充足時，袁保恒就可以直接去巴裏坤設立糧台，一麵仍然轉運北路的糧食，一麵派駱駝南下，裝運南路肅州的糧食。那時候，距離秋收已經不遠，采購糧食比較容易。肅州的車子是不能用於運糧去巴裏坤了，已經集結的車騾，喂養在這裏，派不上用場，實在可惜，可以分撥到蘭州拉車，或者撥給涼州、甘州、安西和肅州各地拉車。
袁保恒提出要派兵護送運糧隊，其實沒有必要。糧台應有衛兵和夫役，但為數不必過多。糧台設立以後，前敵部隊可到糧台領餉，不必由糧台運送。哈密現有張曜全軍駐紮，安西、肅州、甘州、涼州、蘭州、平涼以至陝西，處處有部隊駐防，本來就是為了保衛運輸,袁保可以隨時申請保護，一定不會誤事。何必再另調兵馬，浪費軍餉呢？
這份奏折，我會抄給袁保恒閱覽，如果他有不同意見，不妨跟我來爭辯，得出合理的結果。
左宗棠已經把事情講得十分透徹，但是景廉那幫人是榆木腦袋，就是想不通。左宗棠的奏折遞上去不久，景廉就上奏說，北路烏裏雅蘇台和科布多等城十分寒冷，沒有糧食可以采買。巴裏坤和古城是新收複的地區，條件很差，必須靠關內接濟，才能避免出師久無戰功。左宗棠說軍糧隻能運到哈密，那麼金順所部還有十幾營駐紮肅州與安西，加上張曜和宋慶兩軍，勢必無法前進。防守後路，怎麼用得上這麼多兵力？所以，請朝廷仍然令左宗棠將後路糧運台站，按照既定方針籌劃，不要推諉。
科布多、烏裏雅蘇台大臣額勒和布等人，也讚成景廉的說法。
負責西征的大臣們對於軍糧的籌運意見分歧，吵得慈禧的頭都大了。朝廷的大臣們也拿不出統一的意見。於是上諭隻好放空炮，仍然責成左宗棠切實籌辦，力任其難。
擰不過左大人的大腿
負責西征的大臣們正在為軍糧籌運爭吵，李鴻章幹脆來個釜底抽薪。他在奏複海防條議時，把話說得十分露骨：西征這麼困難，取消西征行不行？新疆那個地方，咱們中國不要了！
且看李中堂是怎麼說的。
新疆各域，自從乾隆年間才歸入中國的版圖，沒有戰事的時候，每年都需要二百多萬兩銀子做軍費。我們白白收了幾千裏廣闊的領土，而增加了千百年的費用，本來就不值了。何況新疆北接俄羅斯，西界土耳其、天方、波斯各國，南近英屬印度。如今形勢不同了，就算勉圖收複了，將來也絕對守不住。我從外國的新聞紙上看到，喀什噶爾的回民首領剛剛接受土耳其的封號，還與俄、英兩國立約通商，已經與各大國勾結一氣，不單單是伊犁被俄國占據而已。根據現在的情況來看，俄國一定會先蠶食，英國必然分享利益，都不願中國得誌於西方，而中國目前的力量，實在不能兼顧西域。部隊疲憊了，財力匱乏了，還可能發生別的變故。
曾國藩生前有過暫棄關外、專清關內的提議，的確是老成謀國的見解啊。現在朝廷雖然派出將領出師，但兵力和餉力都無法支撐。是不是密令西路各部的統領，隻要嚴守現有的邊界，不必急圖進取？一麵招撫伊犁、烏魯木齊、喀什噶爾等地的回民首領，允許他們自立部落，就跟雲南、廣西、四川的苗族與瑤族的土司，以及越南和朝鮮一樣，隻要承認屬我們管就行了。
這樣一來，盡管俄國和英國都想兼並中國，也不至於屢煩兵力，自為經久之道。何況新疆不收複，不會傷害肢體的元氣；但是海疆不防，便是心腹大患啊。隻要掂量一下，就能知道輕重了。此議果定，已經出塞及尚未出塞各軍，可撤則撤，可停則停，節省出來的軍餉，立刻撥給海防。
李鴻章提出不要新疆，把慈禧都嚇了一跳。這還得了？祖宗打下的基業，說不要就不要了？
3月10日，清廷給左宗棠下了一道密諭，讓他統籌全局。海防怎麼辦？塞防怎麼辦？關外的兵事和糧運究竟應該怎麼辦？左卿啊，這許多令人頭痛的問題，究竟應該如何辦理，你一定要想出好法子，快快奏上來。
慈禧告訴左宗棠：有人提出要放棄西域。慈禧沒有點出李鴻章的名字，隻說“有人奏”。慈禧也陳述了反對派的觀點。“又有人奏”，海疆的戰患，不會無緣無故而起，西北軍務勝了，海疆就不會受到侵擾，西北軍務敗了，海疆就會堪憂。所以，朝廷應該全力注重西征。