不過文州城內水源匱乏，因為叛徒出賣，蒙軍得到了這個消息，便切斷了城外的水源。文州城斷水半個月後被攻破。城內守軍和百姓自殺、被殺的有數萬人。文州失陷後，蒙軍在蜀如入無人之境，一月之間連克成都等數城。這時，傳來伐宋中路軍主帥闊出身亡的消息。闊端無心再戰，在大肆擄掠之後，放棄成都，還軍陝西。宋嘉熙三年（1239年）八月，闊端命大將塔海率軍再次入蜀，複取成都。塔海率軍自新井（今四川南部縣）入蜀。他令士兵打起宋軍的旗幟迷惑敵人。宋軍沒有上當，殺出成都城迎戰。當部隊開出成都西門外時，士兵懼戰，四散奔逃，成都再度被克，重慶府等重地也相繼失陷。蒙軍在蜀屢進屢退，並沒有長期占據的打算。宋淳祐元年（1241年）十一月，蒙軍第三次入蜀作戰。成都守將陳隆之誓死不降，堅守數月。可他的部下動搖了決心，在一天深夜打開城門把蒙古軍放了進去。成都再克，蒙軍直逼漢州（今四川廣漢縣）。宋軍三千守城將士出戰，被蒙軍殺敗。蒙軍攻克漢州後，除在翌年攻下敘州（今四川宜賓縣），沒有大的進展。
蒙哥率軍入蜀作戰，自窩闊台以來，蒙軍曾三次入蜀作戰，都即取旋離，未作長留之備。蒙哥在其大包圍的戰略構想中，仍將入蜀作為主攻方向。
在控製雲南地區後，命先期入蜀諸軍築城守備，且耕且戰，變遊動戰法為穩紮穩打。宋寶祐五年（1257年）秋，蒙哥親率４萬人馬入蜀作戰。出征前，他對諸王諸將說：我的父、祖都成大業而享盛名，我也要這樣幹！蒙哥攻四川時，宋廷在蜀中的防禦有了不小的加強。從宋淳祐二年（1242年）開始，宋朝廷委派餘玠任四川安撫製置使和總領。餘玠總結了以往抗禦蒙軍的經驗，築成了青居、大獲、釣魚、雲頂、天生等１０餘城，皆固山為壘，棋布星分，為諸郡治所，屯兵聚糧為必守計.但四川宋軍隻有四、五萬戰鬥力很弱的部隊，朝廷也沒有調給其機動作戰的兵馬，因而在蒙哥的強攻之下，隻有招架之力。
蒙軍主力自六盤山（今寧夏南部）出發，三路並進。蒙哥親率一路入大散關（今陝西寶雞市西南）；蒙哥的異母胞弟末哥率領一路入米倉關（通過今陝西江中市西南川陝界米倉山的米倉道）；孛裏叉萬戶率軍入沔洲（今陝西勉縣）。主力軍入川後沿嘉陵江南下。寶祐六年（1258年）二月，蒙將紐璘率先鋒軍向成都進兵，擊敗宋劉整軍，攻克成都。十月，紐璘率軍進至渡馬湖（今金沙江畔），接應蒙哥所率主力部隊，隨後蒙哥渡嘉陵江至劍閣縣北，兩軍會合。蒙軍在此擊潰宋守隘軍，繼而進圍鵝頂堡（今昭化縣西南），守城宋將王仲出降。蒙哥率軍以半年多時間，攻克、降服了嘉陵江沿岸的幾個城寨，進圍合州釣魚城（今合川縣東）。另兩路入蜀蒙軍在川西、川東也攻城掠地，連連告捷。這樣，蒙軍即對川蜀之地，三分有其二了。
四川淪陷之後，當地百姓並沒有完全屈服，很快，蜀地就有人站了出來。其實從1276年開始，全國各地反抗元朝暴政的民間起義不斷。很多人都沒能在史書上留下名字。比如我現在所了解的這位陳頂驍。
陳頂驍，四川製置使陳隆之義子，在成都淪陷後，他在陳置使十八親隨的護衛下突圍而出。得知義父全家數百口被害後，悲憤異常，舉兵反元。陳隆之治理蜀地期間素有名望，很快，陳頂驍的麾下就聚集了無數熱血青年，其中有不少還是他的舊部。
得知陳隆之的義子舉兵，蒙軍震動，派出了萬餘人的部隊征剿。彼時，陳頂驍麾下兩千餘人，設伏大敗蒙軍。如此一來，百姓更是望風歸附。天下無敵的蒙軍竟然被區區兩千人擊敗了，蒙古大怒，誓要報仇。大軍舉旗殺來。陳頂驍明白自己力量有限，為了保存實力，他率軍進入了蜀地長江上遊。依靠對地理的熟悉繼續抵抗。
此地依山傍水，叢林密布，蒙古大軍的騎兵優勢蕩然無存，而又不識水性，一仗下來，損兵折將。見屢攻不破，蒙軍便放火燒山，大軍掩伏在山腳下，隻等義軍下山逃命便衝出來砍殺。但沒有想到，左等右等，都不見陳頂驍率軍出來。原來，陳頂驍采納了義父其中一位親隨的建議，汲長江之水來滅火。使得蒙軍口袋陣計劃落空。
這樣一來，蒙軍再也按捺不住了，他們將山的周圍圍得鐵桶一般。咆哮著開始衝鋒，陳頂驍驍勇善戰，充分利用了地利優勢，一次又一次擊垮了蒙軍的進攻。