目前骨折的治療分期方法存在分歧，出現三期治療、二期治療和一期治療的混亂局麵，這樣使骨折三期治療的地位麵臨嚴峻的挑戰，嚴重製約著骨傷科學的發展，而且目前多為臨床療效的觀察，尚缺乏係統的實驗研究。孫永生等為從分子生物學水平探討骨折三期治療的作用及其機製，觀察骨折三期治療與一期治療（把骨折愈合的全過程作為一期進行治療）愈合過程中，骨折局部FGF-2表達的影響。將168隻雄性SD大鼠隨機取6隻作為正常對照組，其餘SD大鼠雙脛骨上1/3段前部的中點造成2mm×1.5mm的缺損。術後隨機平均分為模型對照組、一期治療組和三期治療組，分別給予生理鹽水，加減肢傷一方、二方、三方綜合方以及加減肢傷一方、二方、三方藥物幹預，每組於不同的時間點分別處死6隻，取材，常規組織學檢查，免疫組織化學染色法（S-P法）檢測標本中的FGF-2，應用計算機圖像分析係統進行定量分析。結果：①缺損區內血腫細胞、炎性細胞、間充質細胞、成骨細胞、新形成骨細胞FGF-2表達呈強陽性，成熟骨細胞陰性或微弱陽性；②骨折後三組FGF-2表達陽性細胞數和平均光密度值均明顯增高，但是，中藥治療組顯著高於模型對照組（P＜0.05），三期治療組有高於一期治療組的趨勢，FGF-2表達高峰出現時間中藥治療組顯著早於模型組，三期治療組較一期治療組提前了80％。認為中藥治療能顯著促進骨折愈合過程中FGF-2的表達，三期治療明顯強於一期治療，說明對骨折進行三期辨證治療是合理和必要的。
近年來有關生長因子參入骨折愈合過程，以及對骨折後骨不連、骨折延遲愈合的影響引起較多學者的關注，血管內皮細胞生長因子（VEGF）已被證實能促進內皮細胞增殖和血管生成，從而在促進骨折愈合過程中起著重要的作用。桃紅四物湯是中醫傷科活血祛瘀法治療創傷骨折的基本方，曆代傷科專著所載治傷名方多根據骨折分期辨證原則由該方隨證加減化裁衍生。為此，熊輝等選用桃紅四物湯作為實驗藥物，觀察其對VEGF表達的影響及促進骨折愈合的作用，以探討該方促進骨折愈合的分子作用環節。具體方法：日本大耳白兔65隻隨機分成4組，3組分別行右側橈骨中段手術骨折造模後給予桃紅四物湯、炎迪寧片、蒸餾水灌胃，另l組為正常對照組，在骨折後7、15、21、35天攝取骨折部位X線片，同時取骨折斷端標本，4%多聚甲醛固定48小時，200g/L EDTA溶液微波脫鈣，采用免疫組化方法（ABC法）檢測骨痂組織中VEGF表達，並作計量對比分析。結果顯示桃紅四物湯幹預組VEGF表達量高於其他各組，並在第15天表達峰值後下降不明顯，同時使骨折局部血腫吸收加快，骨痂生長和塑形優於其他各組。提示：桃紅四物湯能提高骨折後骨痂中VEGF的表達，加速斷端血腫吸收和骨痂生長塑形，促進骨折愈合。
現外源性應用重組人堿性成纖維細胞生長因子（rhbFGF）在兔下頜骨骨折愈合中的影響得到關注。龔振宇等在兔下頜骨骨折動物模型中，以牛膠原蛋白Ⅰ型為載體，外源性應用rhbFGF於骨折局部。分別於術後1、2、4、8、12周時取材，采用免疫組織化學染色法（ABC法）進行增殖細跑核抗原（PCNA）及Ⅷ因子相關抗原（F8-RA）進行研究，並測定了骨痂中鈣離子的含量及標本的抗力性能。結果顯示：術後1、2周時rhbFGF治療組骨痂內PCNA陽性細胞比率明顯高於對照組（P＜0.05），術後1、2、4、8周時rhbFGF治療組骨痂內血管密度明顯高於對照組（P＜0.01），術後4周時FGF治療組骨痂鈣離子含量明顯高於對照組（P＜0.01），術後4、8周時rhbFGF治療組抗彎曲強度明顯高於對照組（P＜0.05）。提示rhbFGF在兔下頜骨骨折愈合過程起十分重要的促進作用。
為了能在骨質疏鬆症的病理機製以及臨床治療等方麵有進一步突破，廣大醫藥工作者開展了大量相關研究，有臨床研究，也有實驗研究；有發病機製的探討，也有中醫藥防治該病的基礎和臨床研究，許多研究已經深入到分子水平和基因水平。這些研究中運用免疫組織化學技術的文章不少，現舉若幹實例如下：
骨質疏鬆是由於骨吸收與骨形成失偶聯而致的骨量丟失和骨組織微細結構破壞為特征的全身性骨病。詳細機製尚不清楚，但局部細胞因子的作用越來越受到關注。細胞因子是一類由多種細胞產生並分泌到細胞外的糖蛋白分子，具有多種生物學功能。其中轉化生長因子βl（TGF-βl）、腫瘤壞死因子α（TNF-α）、白細胞介素-6（IL-6）與骨質疏鬆症關係密切。近年來眾多學者應用免疫組織化學方法，對相關細胞因子與骨質疏鬆症進行了研究，並取得了一些進展。劉詩榮等為了觀察中藥補腎方對去卵巢大鼠骨組織中TGF-βl及Fas的影響，通過切除Wistar大鼠雙側卵巢，複製骨質疏鬆症大鼠模型（假手術組僅摘除小段腸係膜），各組動物術後常規喂養3個月後，以補腎方為治療藥物，尼爾雌醇片為陽性對照，生理鹽水為陰性對照，分別給藥3個月後處死取材。應用免疫組化SABC法檢測骨組織中的TGF-βl和Fas抗原的表達情況。結果顯示：TGF-βl主要在成骨細胞的胞膜上和細胞質內表達，Fas抗原主要在破骨細胞的細胞質內表達。中藥組骨組織中TGF-βl及Fas抗原表達的陽性顆粒的實麵積、平均光度、陽性單位值較模型組明顯增高（P＜0.05）；而與雌激素組、假手術組比較則無明顯差異（P＜0.05）。提示補腎法能促進成骨細胞骨形成活性、抑製破骨細胞骨吸收活性，其作用機製之一可能是通過調控某些影響骨形成及骨吸收的局部細胞生長因子及凋亡基因（如TGF-βl、Fas）而達到的。
範宏斌等為了了解白細胞介素-6（IL-6）、腫瘤壞死因子-α（TNF-α）在骨質疏鬆症患者腰椎骨中的細胞定位、表達強度及其與骨密度（BMD）的關係。用免疫組織化學方法，分別以IL-6、TNF-α單克隆抗體對22例老年骨質疏鬆症患者腰椎椎板近關節突部鬆質骨組織中IL-6、TNF-α的表達水平進行檢測，並取20例骨密度正常者相同部位骨作對照。結果顯示：實驗組中IL-6、TNF-α表達呈強陽性，主要表達於成骨細胞和骨髓基質細胞，每高倍視野陽性細胞數分別為（107.9±42.6）個、（99.0±31.8）個；而對照組上述細胞表達呈弱陽性，每高倍視野陽性細胞數分別為（31.4±20.5）個、（28.5±17.1）個，兩組比較差異有顯著性（P＜0.01）。試驗組IL-6、TNF-α陽性細胞數隨BMD減低而增強（相關係數分別為r1＝-0.91，P＜0.01；r2＝-0.84，P＜0.01）。兩組骨細胞IL-6、TNF-α染色均為陰性。認為IL-6、TNF-α作為調節骨代謝的細胞因子在骨質疏鬆症的發病機製中起一定作用。