這裏有幾個概念必須澄清，冠狀動脈CT不能完全等同於冠狀動脈造影，冠狀動脈造影觀察到的是血管腔，而冠狀動脈CT觀察到的不僅有管腔還有管壁，因而冠狀動脈CT可以提供更多的信息。
冠狀動脈CT是篩查冠心病的手段之一。不是所有待診斷患者都要做造影，正確的做法應該還是從臨床來到臨床去。症狀、心電圖、超聲心動圖都是初步的篩查，對於初步篩查為高危的患者可行冠狀動脈CT檢查，運動試驗並沒有從歐洲心髒病學會（ESC）/美國心髒學會（AHA）《2011 ACS抗凝治療指南》中消失，但其作用非常有限，敏感性差，最主要是缺乏缺血定位的能力。冠狀動脈CT能夠勝任一般的篩查工作，冠狀動脈CT正常者沒有必要做冠狀動脈造影。
應用冠狀動脈CT最容易診斷的是軟斑塊。對於小斑塊臨床隻需要藥物治療即可，如服用阿司匹林和他汀類藥物。臨床上越來越多見的是多處纖維軟斑塊，狹窄程度在70%左右，臨床上沒有任何症狀，對這樣的患者是否需要進行介入治療還不得而知，但需要密切觀察和強化藥物治療。急性冠狀動脈綜合征患者尤其是近期突發心絞痛者是最危險的，最容易發生突然變化，同時也是最容易治療的患者，這些患者行CT檢查通常顯示為冠狀動脈的高度狹窄和巨大軟斑塊。
在某些情況下不需要預擴張可直接植入支架，但這樣具有很大的盲目性，如果支架不能膨脹則後果不堪想象，在某些情況下即使做了預擴張有時也不一定能充分膨脹，進退兩難的情況時有發生，這種情況下通過CT可以對冠狀動脈病變的性質作出一定的估計。軟斑塊具有較低的CT值，可以非常可靠地認定支架會很輕易地擴開。