迄今為止，大部分的海馬貿易都是用於傳統醫藥，除中國大陸、香港特別行政區、台灣省和世界各地的華人地區外，新加坡、馬來西亞及日本、韓國也都使用傳統中醫藥。傳統中醫藥對印度尼西亞的紮穆醫藥和菲律賓群島的民間醫藥，也頗有影響，如菲律賓人利用海馬醫治哮喘、心痛和過度活躍症，其醫療實踐與我們中醫藥對海馬的認識基本一致。
我國曆代醫家實踐證實，海馬在治療腎不納氣的虛喘方麵有卓越療效。什麼是腎不納氣的虛喘呢?芽虛喘，也即腎虛作喘，中醫學認為：腎有攝納肺所吸入的清氣，防止呼吸淺表的作用。如《類證治裁》一書所說：“肺為氣之主，腎為氣之根，肺主出氣，腎主納氣，陰陽相交，呼吸乃和。”若腎陽虛，則腎的納氣功能減退，攝納無權，則呼吸淺表，氣短作喘，上下不相續，惡寒足冷，甚則四肢逆冷，尺脈弱而無力，小便清長等。此即“腎不納氣”的虛喘。臨床表現為喘促日久，動則喘甚，呼多吸少，呼則難升，吸則難降，氣不多續，或形瘦神疲，跗腫，汗出肢冷，麵青唇紫，脈微細或沉弱；或見喘咳，麵紅煩躁，足冷，脈細數等。其主要發病機製是肺病及腎，肺腎俱虛，氣失攝納所致。治當補腎溫陽納氣，以引火歸元，接續真氣。海馬性溫，味甘微鹹，入腎經。補腎虛，溫腎陽，助腎氣，是一味溫腎壯陽，調氣和血，祛瘀生新的佳品。腎陽得補，腎氣充足，攝納有權，呼吸平穩，喘息自除。對於治療腎氣不足，氣不攝納所致的虛喘有奇效。《本經逢原》認為它“可代蛤蚧”用於哮喘。《藥材學》也記載它能“溫通任脈，用於喘息及久喘”。若治腎不納氣，動輒氣喘，呼多吸少，可用海馬單味研末吞服，每次３～６克，每日２次。也可用海馬配伍補骨脂、胡桃肉、全當歸、熟附子、狗腎、肉桂、人參、枸杞子等藥，以溫補腎陽，攝納腎氣，從而達到治療目的。例如治腎虛作喘，《青島中草藥手冊》記載：海馬３克，當歸６克，燉雞食或單用海馬焙黃研末，水衝服，治虛喘有奇效。《動物藥驗方集成》所載的“平喘煎”，用海馬５克，當歸１０克，水煎服，治療喘息，其效良驗。這些實踐經驗，均可提供我們用海馬治療虛喘的參考和借鑒。
用於遺尿有神效
遺尿症俗稱尿床，遺尿症的文獻記載，最早見於《靈樞》“膀胱不能約為溺”。唐代巢元方進一步充實了發病機製，在其《諸病源候論·遺尿候》中說：“遺尿者，此由膀胱虛冷，不能製約於水也。”一般認為，遺尿是由於腎氣未充，腎陽不足，膀胱虛冷，氣化功能失調，封藏無權，開合失司所致。腎司二便，腎陽不足，夜間陰盛時而陽更虛，火不攝水，故出現遺尿現象。現代醫家通過Ｘ線診斷，發現頑固性遺尿的患兒，有些與隱性脊柱裂有關，中醫學認為，腎主骨，腎虛則骨裂，使遺尿症與腎的關係進一步得到證實。遺尿症可分為小兒遺尿和成人遺尿兩種。
正常來說，成年人夜尿次數應在０～１次，除非睡前飲了較多的水，則另當別論。一般成年人的膀胱可容尿４００～５００毫升，而人體每小時流進膀胱的尿液，約為５０毫升，換言之，若睡前已排空膀胱中的尿液，至少８個小時後膀胱才再次脹滿，所以不應在睡夢中排尿。從中醫學的角度來說，遺尿或夜尿都歸咎於腎氣不足，以致收攝力減弱，不能製約水道，從而出現睡中異常遺尿。同時伴有神疲乏力，腰腿酸軟，記憶力減退或智力較差，小便清長，舌淡苔少，脈細等全身症狀。
相對成人遺尿而言，小兒遺尿則較為多見，嬰童時期，形體發育未全，髒氣未充，排尿自控能力尚未形成，一歲半開始兒童控製排尿的功能逐漸成熟，能在睡眠中感受到尿意而醒來排尿，學齡期有因白天遊戲過度，夜晚熟睡不醒，偶有睡中遺尿者，均非病態。但若是年齡超過３歲，夜間仍然在睡夢中尿床而不自知，或睡眠較深，不易喚醒，每夜或隔天發生尿床，每夜遺尿１～２次以上者可診為小兒遺尿。
引起小兒遺尿的原因有多種，中醫學認為本病的發生，多由於小兒體質虛弱和不良習慣所致，主要與腎、膀胱有關。腎為先天之本，主水，小便的排泄和貯存全靠腎陽之溫養氣化，若腎氣不足，下元虛寒，不能溫養膀胱，膀胱氣化功能失調，不能製約水道而遺尿。所以腎氣不固型小兒遺尿在臨床中最為多見，患兒多表現為睡中遺尿，甚則一夜數次，尿清而長，熟睡不易喚醒，醒後方覺。精神萎靡，自覺乏力，腰腿酸軟，記憶力減退或智力較差，舌淡苔白，脈細等。有些人認為，小兒遺尿無需治療，待其長大成人後自然會好。所以多被忽視而失於治療。如今，每個家長都希望自己的孩子健康、快樂地成長，隨著科技的發展和生活水平的提高，人們對生活質量的要求也越來越高。以往被忽略的疾病逐漸引起人們的重視，小兒遺尿證就是其中之一。