（二）科學合理調整和完善試點方案，積極穩妥地抓好試點工作
各地要在試點工作中堅持從實際出發，借鑒試點經驗，不斷調整和完善實施方案。具體方案如下：一是合理劃分合作醫療基金。各試點縣（市）要堅持以大病統籌為主的原則，中央和地方各級財政補助資金用於建立大病統籌基金，並逐步從農民個人繳費中安排不低於2元標準納入大病統籌基金，用於參加新型農村合作醫療農民的住院醫療費用報銷和當年未享受合作醫療報銷的農民健康體檢，個人繳費的其餘部分建立家庭賬戶，由個人用於支付門診醫療費用，家庭賬戶資金可結轉到下年度使用。
二是簡化報銷程序，方便群眾報銷。參合農民在縣內定點醫療機構住院發生的醫藥費用，可先由定點醫療機構初審墊付，再由定點醫療機構定期到縣（市）合管辦審核報銷。參合農民在縣級以上醫療機構住院發生的醫藥費用，參照在縣內定點醫療機構住院報銷的程序進行。縣（市）新型農村合作醫療辦公室要及時審核定點醫療機構墊付資金，保證定點醫療機構工作不受影響並正常運轉。
（三）認真做好基金封閉管理，安全運行
對農民個人繳費，應在自願參加並承諾的前提下，由鄉（鎮）農稅或財稅部門代收。各地也可探索一些符合農民意願的收費方式，盡可能讓農民自願。收費手續要健全、責任要分清，要讓農民有一種放心感。要注意做好五保戶、貧困戶等救助對象參加合作醫療的工作。合作醫療基金嚴格實行收支兩條線管理，確保專款專用，任何部門、單位和個人不得擠占、挪用，也不得用於平衡財政預算。縣級財政部門應在同級國有商業銀行開設“合作醫療基金財政專戶”，此專戶隻收不支，縣合管辦應在同級國有商業銀行開設“合作醫療基金支出專戶”，此專戶隻支不收。合作醫療基金必須全部用於參合農民醫藥費用支出，不得改變用途。代理銀行要按照縣級財政及合管辦的支付指令，及時、準確、便捷、高效、安全地辦理合作醫療基金的支付和結算業務，直接將資金轉入定點醫療機構的銀行賬戶。做到銀行管錢不管賬，經辦機構管賬不管錢，實現基金收支分離，管用分開，封閉運行。確保群眾真正受益。
（四）改善農村醫療衛生服務條件，提高醫療服務能力和服務水平
新型農村合作醫療不但要讓農民有錢看病，有地方看病，而且要引導農民合理醫療消費。這就要求必須加強農村醫療衛生服務體係建設和監管，完善縣、鄉、村醫療服務機構的服務功能，不斷提高服務質量，讓老百姓放心就醫。
一是要大力加強醫療衛生機構的基礎設施建設。各地和各有關部門要按照農村醫療衛生服務體係建設規劃，加大農村醫療衛生服務機構能力建設。最近國家又明確國債鄉鎮衛生院建設項目要重點保證新型農村合作醫療試點縣，這為我們加強農村醫療衛生基礎設施建設提供了良好的機遇。省級衛生、發改、財政等部門和各級政府要把握機遇，切實抓緊抓好這方麵的工作。特別是各級政府要集中財力辦好縣級綜合醫院、中醫院和鄉鎮衛生院，保證為農民提供公共衛生和基本醫療服務，對其餘醫療機構允許按市場規律運作，充分發揮現有醫療衛生資源的利用效率。
二是要積極推進農村衛生機構改革。今年內要完成鄉鎮衛生院的上劃工作，由縣級衛生行政部門按職責統一管理。要加快鄉鎮衛生院管理體製和內部運行機製的改革，鄉鎮衛生院要實行全員聘用製和績效工資製，要切實轉變服務模式，提高服務效率，降低服務成本，積極為參加新型農村合作醫療的農民提供較好的服務，不斷適應農民群眾日益增長的醫療衛生需求。最近，國家又將甘肅省列為全國城市對口支援農村的唯一試點省份，將選派一大批醫療人員到試點縣鄉鎮衛生院駐點開展幫扶工作，這必將對鄉鎮衛生院的改革和發展注入新的活力。此外，各地還要發揮中醫藥受農民歡迎的特色優勢，注重為農民群眾提供簡、便、廉、驗的中醫藥服務。
三是要大力推進鄉村衛生服務管理一體化工作。鼓勵縣、鄉、村衛生機構間開展縱向合作，使縣級醫療機構的技術服務向鄉鎮衛生院延伸，讓農民群眾得到“小病不出鄉，大病不出縣”就近方便的醫療衛生服務，減輕農民就醫的經濟負擔。
（五）堅持從實際出發，積極探索，力爭在製度建設上有所創新