由於奧馬爾在被綁架前已經有難民資格，所以米蘭檢方就向法院提出起訴，要求審判多名涉嫌非法綁架奧馬爾的中情局和意大利情報人員。2005年12月，米蘭司法機構曾對22名美國中情局特工發出歐盟逮捕令；2007年2月，米蘭司法機構決定對涉案的美國人和意大利人進行審判。11月4日，米蘭一家法院對這起案件進行缺席宣判，判處美國中情局駐米蘭站前負責人羅伯特·賽爾登·拉迪8年監禁，其他涉嫌的22名中情局特工均被判5年監禁；另有2名意大利情報人員也被判處3年監禁。法庭還裁定被告向奧馬爾和他的妻子分別支付145萬美元和75萬美元的賠償金。
不過在宣判時，這些美國被告們因美方拒絕引渡他們赴意大利受審而沒有到庭。他們既沒有遭到逮捕，也都沒有出庭接受審判。事後，意大利政府也沒有向美國提出引渡要求，意大利司法當局隻是將這23名缺席的美國籍被告視為在逃罪犯。米蘭負責這起案件的檢察官斯帕塔羅說，正在考慮向意大利政府申請國際逮捕令。如果申請被批準，被指控的美國特工隻要一離開美國本土，就麵臨遭到逮捕的危險。
這起綁架事件是發生在美國總統奧巴馬的前任小布什任內的“故事”。這是美國中情局特工秘密逮捕、遣送恐怖嫌疑人至第三國審訊時，第一次受到其他國家的司法審判；也是美國前總統小布什啟動“非常規引渡”後，首例美國反恐人員由此而獲刑。
當年“9·11”恐怖襲擊發生後，小布什曾批準了一個“非常規引渡”條例，允許中情局繞過美國司法體係，在全球範圍內綁架恐怖分子嫌犯並送往第三國審問，以方便實施酷刑逼他們招供。
盡管這次判決不會有什麼實際效果，但是這無疑會讓美國政府，特別是中情局感到非常尷尬，對中情局的新任局長帕內塔來說，無疑是一種挑戰。中情局的“反恐”日子已經不是那麼一路順風了。
本·拉登和伊朗“鈾濃縮”
不過上任一年以後，帕內塔還是在反恐中做出了一點點樣子——
英國《泰晤士報》2010年6月22日報道，美國已在非洲國土麵積最小、最不知名的國家之一開辟了新的反恐戰線，位於吉布提的法國前外籍兵團營地提萊蒙尼爾軍營正成為美國在索馬裏、也門、非洲之角展開打擊“基地”組織秘密行動的中心，中情局人員轉入直接作戰，在那裏追蹤鄰近國家的恐怖分子，並對他們實施無人機導彈攻擊行動。
提萊蒙尼爾軍營位於機場附近，人們可以在機場看到C-130運輸機、美國海軍陸戰隊直升機、美國陸軍人員。美國在提萊蒙尼爾軍營策劃實施了最具現代化的秘密戰爭，軍營裏的許多建築物其實隻是大型的集裝箱。900名美國軍人於2002年抵達，在提萊蒙尼爾軍營設有分站的中情局在那裏取得了初步的成功，用無人機的“地獄火”導彈擊斃了“科爾號”軍艦遇襲案疑犯卡埃德-哈裏提。中情局使用“捕食者”無人機還擊斃了與“基地”組織有聯係的阿希-阿亞羅，他被認為是“基地”組織索馬裏分支頭目。
目前駐提萊蒙尼爾軍營的美國軍人已有3000人，其中有一半屬於非洲之角聯合作戰特遣部隊，它的任務是與地區國家進行公開合作，以加強它們應對國內恐怖勢力的能力。
針對“基地”組織的秘密戰爭由中情局的準軍事部隊人員和軍方的特種部隊實施。布什總統啟動了這種由中情局和國防部聯手進行反恐戰爭的模式，奧巴馬政府則在非常秘密的情況下擴大了秘密戰爭。
美國打擊行動的一個關鍵目標是安瓦爾·奧拉基，他是首位被中情局列入打擊目標的美國公民。據說，他隱藏在也門，與“9·11”恐怖襲擊事件的一些劫機者和美國聖誕節未遂炸機案疑犯阿卜杜勒-穆塔拉布、胡德堡陸軍基地槍擊案疑犯哈桑有聯係。
中情局和特種作戰部隊小組的聯合行動已取得了一些明顯的戰果，其中最突出是去年9月對索馬裏南部的一次直升機空降襲擊行動，“基地”組織頭號疑犯、肯尼亞人薩利赫·納布漢和另外三名疑犯被直升機所發射的導彈擊中身亡。納布漢被認為參與襲擊了美國駐肯尼亞和坦桑尼亞大使館以及其他恐怖襲擊活動。
為了配合奧巴馬總統新的打擊目標，2010年6月27日，中情局局長帕內塔又在美國廣播公司的電視節目中說：“目前伊朗正在就是否製造核彈進行爭論，但他們顯然正在發展自己的核能力。我們認為他們現在擁有足夠製造兩件（核）武器的低濃縮鈾。”帕內塔還說：“他們必須將鈾完全濃縮才能製造出核武器。我們估計，如果他們決定製造核武器，完成鈾濃縮將需要一年時間。為了能夠使用核武器，還需要一年時間研製武器運載係統。”
聯合國安理會在6月9日曾就伊朗核問題通過了包含製裁內容的第1929號決議，決定對伊朗實行自2006年以來的第四輪製裁。此後，美國加大了對伊朗的製裁力度。美國政府在6月16日宣布對伊朗郵政銀行、伊朗伊斯蘭革命衛隊相關實體及個人、伊朗伊斯蘭共和國船運公司相關實體實施製裁。此外，美國國會參眾兩院還在當月24日通過對伊朗實施單方麵製裁的議案。
與此同時，帕內塔還對阿富汗塔利班叛亂和本·拉登的“基地”組織等問題進行了特別的“關注”。
2011年5月1日，帕內塔親自指揮了襲擊拉登的秘密軍事行動，並成功地將拉登和他的一名妻子、一個兒子擊斃。
這次成功的絕密行動使帕內塔和中情局風光無限。帕內塔自然也是前途無量。據悉，奧巴馬此前即已任命他為下任國防部長，而駐阿富汗美軍司令戴維·彼得雷烏斯將成為第二十任中情局局長。