4月30日，山東省主席沈鴻烈指使山東泰安專員秦啟榮部在山東博山泰和地區襲擊八路軍山東縱隊第三支隊，慘殺指戰員400餘人，製造了博山慘案。6月11日，河北省保安司令、民軍總指揮張蔭梧率部襲擊冀中深縣八路軍後方機關，慘殺400餘人，造成深縣慘案。6月12日，駐湘鄂邊楊森第二十七集團軍總司令部派特務營包圍新四軍駐平江通訊處，將參謀塗正坤及通訊秘書吳賢眾殺害，夜半又將八路軍少校副官羅梓銘等6人活埋，造成平江慘案。9月25日，鄂東遊擊總指揮程汝懷調第一七二師圍攻新四軍獨立遊擊第五大隊後方機關，慘殺幹部、戰士五六百人，製造鄂東慘案。11月11日，河南確山縣縣長許公超采取突襲方式，率部圍攻竹溝鎮新四軍第八團留守處，慘殺未及撤退的新四軍傷病員、家屬及當地民眾200餘人，並將留守處財物搶劫一空。從1939年底至1940年春，國民黨頑固派掀起了抗戰時期的第一次反共高潮。
在國民黨第一次反共高潮中，陝甘寧邊區、山西地區、冀南豫北地區是國民黨軍隊重點進攻的地區。在陝甘寧邊區，1939年5月，國民黨在邊區周圍修築了五道封鎖線，西起寧夏，南沿涇水，東至黃河，綿延千裏。其中，寧夏和陝甘邊境，由寧夏的馬鴻逵、馬鴻賓部隊負責；綏南、陝北及晉西北邊境地區，由鄧寶珊、高雙成、馬占山等部負責；胡宗南部主力在黃河西岸，經陝西的秋林鎮、宜川、洛川、宜君、同官（今銅川縣）、耀縣、口頭鎮、淳化、旬邑，接甘肅的寧縣、西峰鎮、鎮原，入寧夏境，經固原、黑城鎮至同心城，北麵與寧夏的馬家軍部隊銜接，構成一條長達700餘華裏的封鎖線。在封鎖線上，碉與碉之間相接，母碉與子碉進行縱深配備，並通過鐵絲網、鹿砦向外延伸。除進行軍事封鎖外，胡宗南還配合地方行政係統，對邊區實行政治上的封鎖與破壞。1939年12月，胡宗南部襲占了陝甘寧邊區的淳化、旬邑、正寧、寧縣、鎮原五座縣城。國民黨對陝甘寧邊區的軍事及經濟封鎖，給邊區軍民造成了空前的困難。
在山西，閻錫山以執行冬季攻勢為名，於1939年12月1日令山西青年抗敵決死隊第二縱隊向同蒲路靈石、霍縣境內破襲。當二縱準備執行破擊命令時，閻錫山事先部署的部隊在日軍配合下，圖謀夾擊消滅第二縱隊。第二縱隊識破閻錫山的陰謀，斷然拒絕執行命令。閻錫山即誣決死二縱隊叛變，下令以重兵"圍剿"。12月3日，閻錫山部隊向隰縣、孝義地區決死二縱及八路軍晉西獨立支隊發動大規模進攻。12月7日，決死二縱隊奮起自衛，雙方發生激戰，晉西事變爆發。閻錫山軍隊先後殺害隰縣、蒲縣、石樓、永和、洪洞等抗日縣政府和犧盟會幹部及晉西支隊後方醫院傷病員千餘人。與此同時，閻錫山還命令部隊進攻晉西北抗日決死隊第四縱隊和八路軍彭紹輝八旅；又勾結日偽軍夾攻上黨地區抗日決死隊第一、第三縱隊和附近的八路軍；在陽城、晉城、沁水、高平、長治、陵川等地摧殘抗日民主政權和救亡團體，屠殺共產黨人和人民群眾。
在晉南豫北地區，1939年底，石友三第三十九集團軍所部向冀南地區進攻；1940年春，第九十七軍等部進攻八路軍總部所在地太行區。
麵對國民黨頑固派發動的反共軍事摩擦，中國共產黨進行了有理、有利、有節的鬥爭。早在1939年2月10日，中共中央向全黨發出《關於河北等地摩擦問題的指示》，明確提出對國民黨的無理進攻，必須反擊，決不能輕言讓步。6月7日，中共中央在《關於反對投降危險的指示》中，要求全黨準備自己、準備群眾、準備輿論，給一切投降陰謀和叛變行為以堅決的鬥爭。6月10日，毛澤東發表《反對投降活動》一文，指出，必須用一切努力反對投降和分裂。7月7日，中共中央在《為抗戰兩周年對時局宣言》中，提出"堅持抗戰，反對投降；堅持團結，反對分裂；堅持進步，反對倒退"三大政治口號，動員全黨和全國人民為克服國民黨的投降反共逆流，。爭取時局好轉而鬥爭。9月16日，毛澤東在和中央社、《掃蕩報》、《新民報》三記者談話中，痛斥了國民黨頑固派反共活動的罪行，宣布"人不犯我，我不犯人；人若犯我，我必犯人"的自衛原則。12月23日，中共中央發出《對時局指示》，要求八路軍、新四軍準備對付局部突然事變；在華北、西北、中原一帶，凡遇軍事進攻，在有理有利條件下堅決反抗之，極大發揮自己的頑強性，絕不輕易退讓。25日，朱德、彭德懷等通電全國，曆數國民黨製造的一個又一個反共摩擦事件，反對槍口對內進攻邊區。