糧食沒有了，藥品沒有了，淡水也快沒有了。整個巴丹半島上缺醫少藥，糧彈不足，疾病流行，士氣低落。絕望的情緒在美軍士兵中可怕地蔓延，也在菲律賓士兵中急劇擴散，於是，一首在第二次世界大戰中最動搖軍心的歌謠，在巴丹半島和科雷吉多爾島上流傳開來：
我們是巴丹的苦兵卒，
沒有爸，沒有媽，也沒有山姆大叔，
沒有嬸，沒有叔，沒有侄兒和侄女，
沒有槍，沒有彈，沒有飛機和大炮，
可是沒有人在乎！
軍心渙散、士氣低落到如此地步，麥克阿瑟縱有回天之力，也難以逃脫失敗的厄運。
1月20日晚上，身經百戰的日軍第16師團5000多名日軍借著月色發起了進攻。在一陣猛烈的炮火之後，日軍步兵端起刺刀進行敢死衝鋒。士氣低落的美菲聯軍無心戀戰，掉頭就跑，整個阿布凱防線立刻被衝得七零八落，漏洞百出。日軍轟炸機拚命轟炸潰退中的美菲部隊，使整個陣地上殘肢斷臂滿目皆是，屍橫遍野，血流成河。
到23日，阿布凱防線全線告急，無奈之下，麥克阿瑟下令向第二道防線撤退。
24日夜，深諳謀略的溫賴特將軍組織了一次虛張聲勢的進攻，趁日軍陷入混亂之際，他急率自己的殘兵敗將奪路狂奔，逃之夭夭。
看到巴丹半島日甚一日的嚴峻形勢，菲律賓總統怒不可遏。這位國破家亡的菲律賓老人憤怒地對身邊的美國顧問說：“你們像這樣張口歐洲，閉口歐洲，我受不了！現在，我和我的人民都在征服者的鐵蹄之下，而你們常吹牛的飛機軍艦到哪裏去了？美國為了一位遠房表親——歐洲的命運煩躁不安，卻全然不顧他的一個女兒——菲律賓在後房裏被人強奸！”
僥幸逃到第二條防線之後，麥克阿瑟的巴丹守軍經過艱苦奮戰才站住了腳。日軍由於戰線延長，後勤供應一時難以為繼，因此也暫時停止了進攻，重新開始調整部署。於是，兩軍又在叢林密布的巴丹中部隔壕對峙起來。
巴丹前線暫時歸於平靜，但這並不意味著麥克阿瑟和他的美菲聯軍的厄運已經過去。相反，日本人又運來了100多門重炮和數以萬計的士兵。他們也知道美國人缺少食品和淡水，士兵們已經餓得骨瘦如柴，連槍也快拿不動了。本間雅晴的意圖很明確，一邊對美菲軍保持正麵壓力，不使其得到喘息的機會，一邊急調生力軍上陣，並儲存足夠的武器彈藥。一旦萬事俱備，他認為取巴丹易如反掌。
與本間雅晴的躊躇滿誌相反，麥克阿瑟陷入了空前的憤怒和絕望之中。他像一頭被困的獅子，在自己的指揮所裏一籌莫展。華盛頓一次又一次令人失望的空口許諾，讓他和他的部隊的自信心受到了空前的打擊，他甚至覺得自己無顏再向士兵們解釋什麼。這些浴血奮戰的小夥子們，被人無情地拋棄了。
無論是美國人還是日本人，都明白巴丹的陷落隻是一個時間問題。為了不讓美國軍隊蒙羞，華盛頓和五角大樓作出了一個讓麥克阿瑟事後百口難辯的決定：任命麥克阿瑟為西南太平洋戰區司令，命其不日到澳大利亞上任。同時，晉升喬納森?溫賴特少將為陸軍中將，並命其接替麥克阿瑟的駐菲美軍總司令的職務。
3月11日夜晚，麥克阿瑟和他的夫人瓊及3歲的小兒子一起，乘坐一艘魚雷快艇悄悄地離開了科雷吉多爾島。在曆盡艱險穿過了日軍的幾道封鎖線之後，他和他的家人終於到達了澳大利亞。
麥克阿瑟的離開，是對困守巴丹的美菲軍士氣的一次致命打擊。因為他是美國在菲律賓的象征，他的離去，意味著菲律賓和近2萬名艱苦作戰的美軍士兵一起，被徹底地拋棄了。
1942年4月3日，在經過了精心的準備和部署之後，日軍對巴丹半島的南部發起了最後的，也是誌在必得的進攻。
上午10時整，日軍炮兵陣地上萬炮齊吼，呼嘯的炮彈刮風般地砸向美菲軍的陣地。一時間，整個美菲軍防線上山崩地裂，硝煙蔽日，亂石橫飛。還沒等高喊著“萬歲”衝鋒的日軍步兵抵近前沿，許多美菲軍士兵就開始掉頭逃跑，把陣地拱手讓給了日軍。
麵對日本人猛烈的進攻，新任駐菲美軍司令官溫賴特中將要求他手下的兩位指揮官——瓊斯少將和愛德華?金少將努力抵抗。但是，兩位前線指揮官的看法讓他完全喪失了信心。
巴丹守軍司令愛德華?金少將說：“餓得奄奄一息的士兵們已無力戰鬥，除非他們可以馬上獲得食物。”
美菲軍第1軍軍長瓊斯少將更是直截了當：“任何努力都是毫無意義的，因為士兵們已經餓得拿不起槍來了。”
兩位將軍雖然沒有明言，但觀點卻是驚人的一致：再打下去無異於自殺！
客觀地說，麵對日軍的強大進攻，美菲聯軍是盡了力的，他們的表現可歌可泣，可圈可點。隻是，他們麵臨的敵人太強大了，自己又得不到絲毫的增援。在頑強抗擊了幾個月，並給予了日軍以重大殺傷之後，他們自己也傷亡慘重，無力再戰了。
4月9日清晨，巴丹守軍愛德華?金少將為了防止無謂的犧牲和殘暴的日軍可能進行的屠殺，為了不進一步激怒凶殘的日軍，他決定率部投降，以拯救幾萬部下的生命。
上午9點，金少將驅車來到日軍指揮部，把自己的佩槍解下來放在了日軍指揮官的桌子上。此舉意味著，在巴丹戰場上血戰百日，包括數千名美軍在內的約7.5萬名美菲聯軍，正式向日軍投降。
這是美軍曆史上繳械投降最龐大的隊伍，也是美軍有史以來的最大一次失敗。
遠在澳大利亞的麥克阿瑟痛苦地接受了這一殘酷的現實。在記者招待會上，他心情沉重地盛讚了巴丹守軍的功績：“沒有一支軍隊曾經以如此少的兵員裝備做出如此重大的貢獻，沒有比它最後經曆的考驗和苦難更能說明這一點。”
巴丹的陷落，意味著通向科雷吉多爾島的大門已經打開。唇亡齒寒，美國在菲律賓的最後一塊立足之地——科雷吉多爾島，也在劫難逃了。
科雷吉多爾島是美國人在遠東經營已久的一個軍事要塞。經過逐年的修築完善，到1941年12月太平洋戰爭爆發之前，已經成為一個現代化程度很高的要塞。除了各炮位、各種火器的掩體均為永備工事外，還建有大量的、相互關聯的坑道工事，內有高級的司令部辦公室、守備部隊的集結位置、醫院、軍需倉庫、汽油儲藏室、各種商店等，在主要的坑道內甚至還設有雙軌電車。島上構築有飛機場和四通八達的公路網。在主要防禦方向上修有可以快速機動兵力的鐵道、醫院、水塔、冷藏室和其他主要的生活設施及衛生設備等。在島上，原來擔任防守任務的是美軍陸戰第4團，他們擁有各種火炮56門，高射炮76門，並擁有防空作戰用的大口徑探照燈10具。在巴丹陷落之前，又有近2500名美菲軍官兵逃到科雷吉多爾島，從而使島上的防守兵力達到了近5000人。
對於科雷吉多爾島上完備、堅固的防禦體係，日本人早就有所耳聞。在攻陷巴丹半島最南端的馬利伯勒斯山之後，日軍就開始在山坡上構築重炮陣地，準備與守島美軍打一場炮兵大決戰。
好像本間雅晴將軍並不太急於攻下科雷吉多爾，他每天隻是命令重炮和轟炸機對島上的各種設施實施毀滅性的打擊，並沒有派兵登陸攻打的跡象。這種猛烈、殘酷的火力襲擊一直持續了將近一個月，使美軍的島上設施遭到了徹底的破壞，並使守島美軍的士氣遭到了沉重的打擊。
5月3日夜，一艘美國潛艇冒著危險，悄悄地靠上了科裏吉多爾島，接走了13名美軍醫院的女護士。目送潛艇悄悄地潛航之後，溫賴特將軍向麥克阿瑟發出了一封緊急電報，聲明島上的淡水僅夠5天之用，整個局勢正在趨於絕望。
5月5日深夜，本間雅晴將軍驅車來到巴丹半島的拉第港口，目送著一批批的登陸艇趁著夜色向科雷吉多爾島撲去。就在登陸艇即將靠岸的時候，信心十足的本間下達了對科雷吉多爾的總攻擊令。
瞬間，日軍密集的炮火落在了科島東端的突出部上，炮彈爆炸時發出了強烈的火光，像一朵朵綻放的花團，在黑色的夜空中閃爍。日軍突擊隊員冒著守軍發射的猛烈火力，奮力攀登著嶙峋的山岩，並首先在科雷吉多爾島的尾部搶灘登陸。
6日淩晨1點，又一股日軍在科島的蒙克角強行登陸成功，切斷了科島的東部。
1時30分，設在鄧維爾附近的美軍最大的炮兵陣地被日軍攻破。
2點10分，源源不斷的日軍從科島東部的登陸場湧上了科雷吉多爾島。
7點鍾天亮之後，日軍的坦克、炮兵開始登陸，並以更加猛烈的火力支援登陸場上的戰鬥。守島的美菲軍雖然英勇抵抗，浴血拚殺，但終因實力懸殊，再加上缺少必要的反坦克火器，因此根本無力抵擋日軍坦克的橫衝直撞。隨著戰鬥的發展，守軍手中的陣地在一步一步地丟失。
經過6日白天的一天血戰，美軍陸戰4團傷亡慘重，不得不放棄了科島的前沿陣地，撤向位於馬林塔山的主陣地。
6日23時30分，日軍又從島的西端碼頭地區登陸，與前一夜的登陸部隊呈頭尾夾擊之勢，從東西兩個方向掃蕩守島美軍，並逐漸將其壓迫至美軍的最後一個堡壘——馬林塔隧道。
7日晨，守島美軍被迫從東西兩頭撤進了馬林塔隧道，隨即，跟蹤追擊的日軍悄然而至，包圍了兩個壘著沙袋的隧道口。
此時此刻，溫賴特將軍已經完全陷於絕望了。隧道內擁擠不堪，大批的傷員和赤手空拳的非戰鬥人員阻塞於隧道內，再戰鬥下去幾乎是不可能了。
看到那些跟隨自己浴血奮戰一百多天，而今卻是傷痕累累的勇敢而忠誠的部屬，溫賴特將軍為不能帶領他們擺脫苦難而感到羞愧。他知道日本乃至日本軍隊在中國大陸所犯下的種種大屠殺暴行，如果再這樣毫無意義地打下去，勢必會給殘忍的日軍屠殺這些傷員以口實。不！不能再打下去了，再也不可能有什麼奇跡出現了。他不能因為自己的自尊心和榮譽感，而把自己忠心耿耿的部下推向死亡，他必須做出選擇。
在經過痛苦的思考和激烈的思想鬥爭之後，臉色蒼白的溫賴特將軍在部下們眼含熱淚的注視之下，向身邊的參謀輕輕地說：“請你去告訴日本佬，我們將馬上停火。”
說完，溫賴特將軍拿出他珍藏的一麵星條旗，並告訴軍官們，要銷毀他們身上的證件和國旗。隨後，星條旗在火中化為了灰燼。
溫賴特將軍默默地舉手敬禮，眼角溢出大顆大顆的淚珠，跟著敬禮的士兵們也都淚流滿麵，泣不成聲。
在燒毀國旗和密碼之後，溫賴特將軍懷著絕望而沉痛的心情，向羅斯福總統發出了最後一封電報：
我以心碎的心情，哀傷地，但是問心無愧地低首向閣下報告，今天我必須為馬尼拉這幾個要塞島嶼安排投降條件……人的耐力是有限度的，而這個限度早已超過多時了。既然已無解救的希望，我認為，結束無謂的流血和犧牲是我對祖國和對我英勇的將士的責任。
如果您同意的話，總統先生，請轉告國民，我的將士們和我本人已經做到了作為人所可能做到的一切，我們堅持了美國和美國軍隊的最優秀的傳統。
願上帝祝福您，保佑您，引導您和全國走向最後的勝利。
我即將懷著十分哀傷，但是仍為我英勇的部下感到驕傲的心情，去會見日軍指揮官。再見了，總統先生。