宋慈墓碑嘉熙三年（1239），宋慈53歲，任廣東提點刑獄（掌管刑法獄訟的官吏）。在這以前，那裏的官吏得過且過，積留了大量獄案。他一到任，便著手處理大批懸案積案，勘查現場，驗證材料。宋慈辦案嚴肅認真，執法如山，而且不畏權貴，決事果斷。經過八個月的檢察，他裁決了200多死囚犯人，昭雪了一批被屈打成招的冤命案，解決了一大批疑案、積案，懲處了一些貪贓枉法的基層執法獄吏。他的“雪冤禁暴”的事跡，為他在百姓中贏得了好名聲，群眾頌之為“清官”。
第二年，宋慈改任江西提點刑獄兼知贛州。每到農閑，這裏便有鹽販子武裝販鹽，騷擾江西、福建、廣東沿途州縣。宋慈嚴加懲治，使道路暢通、秩序安定，民心大服。此情呈報朝廷，受到重視，批準宋慈所行，下達浙江西部諸州縣，使其皆仿效執行。
淳祐元年（1241），宋慈知常州軍事，淳祐七年（1207），任直秘閣提點湖南刑獄。次年進直寶謨閣奉使四路，這些都是主管刑獄的官職。淳祐九年，拔知廣州、廣東經略安撫使（掌管一路之軍事行政）。
宋慈一生20餘年的官宦生涯中，先後四次擔任高級刑法官，後來進直寶謨閣奉使四路，也是“皆司皋事”，可見宋慈一生從事司法刑獄。長期的專業工作，使得他積累了豐富的法醫檢驗經驗。淳元年，宋慈任常州軍事期間，在工作之餘開始總結審案檢驗經驗，至任湖南提點刑獄那一年（1247），完成了《洗冤集錄》的編撰工作，並刊行於湖南憲治。淳九年（1249），宋慈去廣州任經略安撫使，在這年春天，忽感有頭眩之疾，不過他仍照常辦公。當地學宮舉行典禮儀式，宋慈仍親往主持，事後便染病在身，淳九年的三月七日在廣州任內去世。次年七月十五日，葬於福建建陽。
@@法醫界奉為圭臬的《洗冤錄》
北宋·人體正麵經穴總圖《洗冤集錄》也稱《洗冤錄》。它是我國古代著名的法醫學專著，是宋慈對當時傳世的屍傷檢驗著作加以綜合、核定和提煉，並結合自己豐富的實踐經驗而撰成的。
有宋以來，以印刷術、火藥和指南針的發明與應用為標誌，科學技術包括醫學都有了巨大的飛躍，醫學分科更加細密，如針灸、婦科、小兒科、外科都成為獨立的科目，官府和私人修纂各類診方、藥典等本草類著作亦蔚為大觀。雖然當時的“法醫學”並沒有獨立發展的空間和條件，但刑事案件的偵破實踐，又迫切要求對各類損傷進行嚴格的檢驗，並要求有人在這方麵進行理論性的總結和撰述。因此，在醫學進步的條件下，五代至宋，開始有學者關注刑名之學與傳統醫學的結合，並出現了宋人鄭克編纂的《折獄龜鑒》，桂萬榮編纂的《棠陰比事》等著作。而真正屬於法醫學的著述首先要數宋慈的《洗冤集錄》。
《洗冤集錄》是中國古代一部重要的法醫學著作，也是世界上最早的包含法醫學內容的專著。它總結了法醫學屍體外部檢查的經驗，對屍體現象作了大量的科學觀察和歸納，有不少結論是符合近代法醫學原理的。其中的一些方法和意見，即使在今天也具有啟發性。此外，宋慈在刑偵過程中非常重視證據，這在司法審判過程中是有著進步意義的。
《洗冤集錄》現存最早的版本為元刻本《宋提刑洗冤集錄》。內容自“條令”起，至“驗狀說”終，共5卷，53條，約7萬字。從目錄來看，本書的主要內容包括：宋代關於檢驗屍傷的法令；驗屍的方法和注意事項；屍體現象；各種機械性窒息死；各種鈍器損傷；銳器損傷；交通事故損傷；高溫致死；中毒；病死和急死；屍體發掘等等。
《洗冤集錄》是集宋慈以前外表屍體檢驗經驗之大成的著作。作者提出不能輕信口供，認為“告狀切不可信，須是詳細檢驗，務要從實”，對疑難案件尤“須是多方體訪，務令參會歸一，切不可憑一二人口說，便以為信”。北宋時期的針灸銅人他還提出檢驗官必須親臨現場，必須由其親自填寫的屍體檢驗原則。
對於驗屍的方法，宋慈總結了一整套比較合理的措施：驗屍前必須洗罨，先用皂角水洗屍，後用熱米醋、五倍子、白梅等作局部罨洗。因為這些物質內含醋酸、鞣酸，經處理，不僅能洗淨屍體皮膚上的髒汙，又可固定傷痕，便於觀察與檢驗。
驗屍時需要判明屍體現象，切勿將一些自然變化視作非正常死亡。書中已明確“屍斑”係早期屍變，由於人死後血行停止，血液墜積，在屍體的低下部位可以出現微赤色的“屍斑”。書中又翔實地描寫了屍體腐敗現象，指出首先在兩腋、胸前肉色微青泛出“屍綠”，其後口鼻內有惡汁流出，蛆出，遍體胖脹，口唇外翻，而眼突出，現“巨人顏貌”，皮膚脫爛，皰疹隆起，毛發脫落，遍身皮膚青黑。在“四時變動”篇中又指出因不同季節、氣候以及死者肥瘦老幼等不同情況，屍變速度也不一樣。這些記載與實際情況大體相符。
驗屍時尚需認識各種疾病致死的屍體現象，如斑疹傷寒死亡的屍體有紫紅斑；破傷風死亡的會口眼歪斜，手腳拳曲；凍死者麵色萎黃，兩腮紅，口有涎沫；餓死者渾身黑瘦硬直，牙關緊閉，手腳俱伸等。檢驗者不僅要考察屍體現象，還需查問生前情況。這些經驗都是十分寶貴的。《洗冤集錄》對各種屍傷的檢驗，搜羅了許多豐富的臨床經驗，具有相當的醫學水準，是本書中最精彩的部分。
《洗冤集錄》對於自縊、勒死、溺水、外物壓塞口鼻死等機械性窒息也都有出色的論述。縊死者可見唇口黑，麵帶紫赤色，若繩索勒喉上則舌抵齒不伸出，若勒喉下則舌尖出齒門二至三分，死者口吻兩角及胸前有吐出之涎沫，兩腳尖垂下，腿上、肚下及小腹部有屍斑，大小便失禁等。書中對於索溝的特點作了準確的描述。一般自縊者索痕沿耳後發際，並在腦後分八字，索痕不相交。如取側臥或俯臥位自縊者，索溝經過不同。索溝的深度因腳是否到地、死者的肥瘦以及繩索的粗細等不同而出現不同的索痕。如繩帶纏繞頸上兩遭，則有上下兩道索痕，上一道繞過耳後入發際，下一道平繞頸部。如縊死後被人移屍別處，也可見兩道索痕，舊痕紫赤有血瘀，死後移屍索痕隻白色無血瘀。如被人勒死後假作自縊，頸下索痕交過，繩索多纏繞數周。如被人隔物勒死，則繩索不交，但繩索平過喉下及頸部，與自縊者不同。另外，凡“被勒時爭命，屍身四畔，或沿身上下有磕擦著痕”。並指出，自縊者縊溝不周頸，這些記載與現代法醫學的原理與內容完全一致。