2006年6月，中國國際民間組織合作促進會與美國環保協會在北京發起了“綠色出行”活動，倡導公眾在選擇出行方式的時候，優先選擇對於環境影響最小的方式，以此來減少交通汙染、提高空氣質量和保障人體健康。2006年10月，“公共交通與綠色出行研討會”在北京召開。來自北京市交通管理部門、清華大學等學術機構以及國際著名環保組織的資深專家到會研討，為提高北京交通運營能力和改善空氣質量出謀劃策。
2007年6月，北京、香港、上海、南京、拉薩、濟南、西安、蘭州、天津、佳木斯、昆明、廈門、額爾古納、重慶、武漢、石家莊、南昌、南寧、廣州、鄭州20個城市的民間組織在北京發出“綠色出行聯合行動”的倡議，希望人們在出行的時候，盡量選擇人均耗能和排汙都比較低的公共交通，如騎自行車、步行等，長途出遊盡量選擇相對於飛機和汽車更加環保的火車作為交通工具。由此，“綠色出行”項目向全國推廣至20個主要城市。之後，祖國各地如火如荼地開展了豐富多彩的“綠色出行”活動，如：綠色健走、綠色騎行、綠色公交以及綠色出遊等。
2007年8月，由中國國際民間組織合作促進會、美國環保協會、北京產權交易所、北京環保宣教中心在北京市產權交易所共同發起了“綠色出行綠色奧運”活動。此次活動是在中國國際民間組織合作促進會和美國環保協會在2007年6月聯合全國20個城市共同開展的“綠色出行網絡”的基礎上，攜手北京產權交易所和北京市環境保護宣傳教育中心共同發起的。2007年10月，第七屆世界體育與環境大會通過了《關於體育與環境的北京宣言》，充分肯定了北京奧運會的環保工作，把“綠色出行”認定為能幫助北京奧運會降低溫室氣體排放的重要手段之一。
2008年2月，《北京市人民政府關於發布本市第十四階段控製大氣汙染措施的通告》，把“少開一天車”等綠色出行活動列為保障奧運空氣質量、倡導“碳中和”的重要公益活動內容，為實踐“綠色奧運”、應對全球氣候變化作出積極貢獻。奧運期間，實行了單雙號限行製。
2009年5月，上海市環境保護局、上海世博會事務協調局、美國環保協會共同舉辦了“世博綠色出行”啟動儀式暨新聞發布會。作為中國2010年上海世博會開園倒計時一周年係列活動之一，“世博綠色出行”活動旨在為世博會創造暢通的出行環境，傳播“綠色世博”的環保理念。“世博綠色出行”活動開展時間從2009年5月至2011年3月，分為“迎世博”、“世博會會期”和“後世博”三個階段。活動將推出“綠色出行網上計算器”、“綠色出行承諾卡”、“綠色出行穿越長三角”、“綠色出行遊世博”等豐富有趣的活動形式與公眾互動。2009年6月，上海市環境保護局、上海世博局和美國環保協會在上海市環境科學院共同舉辦了“2009世博綠色出行”研討會。專家在發言中總結了北京奧運會在環境和交通方麵的積極成果，討論了京滬兩地的地理環境差異，並對上海世博會期間的相關工作進行了展望和設想。
除了在中國進行的以上項目之外，美國環保協會還在中國倡導區域環境合作的主張。2004年6月，美國環保協會與國內多個部門和研究機構在合作開展環保領域的政策研究基礎上，在杭州召開“區域環境合作高層國際論壇”，倡議打破行政區劃，開展區域環境合作。會議發表《區域環境合作，全局科學發展》藍皮書，蘇、浙、滬三地通過《長三角區域環境合作宣言》。
2008年11月，第四屆區域空氣質量國際管理研討會在北京召開。來自中華人民共和國環保部、美國環境保護署、美國環保協會、美國自然資源保護委員會、歐盟環境總司、清華大學、中國環境科學研究院、環境保護部環境規劃院和地方環保局等有關人員參加了本次研討會。研討會討論了六大議題：區域空氣質量管理措施；政策支持及多領域合作機製；排汙權交易體係；交通、燃料、機動車汙染防治；空氣質量管理的技術層麵：顆粒物和臭氧；健康與環境影響的定量研究。