從第一支西南小藩的藩軍被長州人襲擊到退場以後，西南先行諸藩的藩軍都受到了毀滅性的打擊，但凡提前行動試圖占長州便宜的西南諸藩，都在長州的複雜地形中遭遇了來自長州民兵隊的打擊。就像說過的，民兵組織雖然有種種的不妥之處，但是民兵的範圍實在是太廣，長州境內此時不止奇兵隊在活動，由於幕府將要征伐長州的消息已經天下皆知，麵對無能的藩主，還有已經完全失敗的藩軍，長州的百姓在下級武士的帶領下自行組織起了大量的民兵組織，本來這些民兵組織不過是虛有其名，但是奇兵隊的勝利，給了這些非正規武裝一劑強心劑，有樣學樣，這些民兵武裝很快就學會了奇兵隊的作戰方式。偷襲這種作戰方式是最不需要學習的一種作戰方式，雖然說進過訓練的正規軍，在進行偷襲夜襲時，作戰效能，戰鬥結果會更高更好，但未經訓練的民兵不見得就比正規軍差，雖然這些民兵可能要花費更長的時間才能消滅同一個目標，可能民兵的損失也要比正規軍大，不過最後的結果都是消滅了敵軍，這樣就足夠了。
長州的民兵組織，三五成群麵對來自西南的敵人，總是在優勢地區形成優勢兵力，打擊敵軍。這些民兵組織和有支援的奇兵隊不同，他們大多沒有先進火器的支援，他們使用的武器就真實體現了一個落後國度的民兵所能有的裝備。由於刀狩令的一直存在，普通百姓失去了私自存有武器的可能，不過由於組織起這些民兵的大多都是下級武士，通過各種手段這些民兵還是得到了一定程度的武裝，武器包括一些長槍，弓箭，薙刀還有一些粗製濫造的武士刀，但是這些武器並不能夠確保發到每一個人的手上，沒有這些武器的人，隻能砍一根竹子削尖了做根竹矛了。這樣一來在麵對諸藩藩軍的時候這些民兵武裝顯然就不能取得裝備上的優勢了，但是人的智慧從來就不能小覷，沒有武器，但是他們有山，有林，有水。西南諸小藩的藩軍在進入長州的那一刻起就注定了他們失敗的結局，長州對於他們而言畢竟還是一個陌生的地方，何處有山，哪裏有水，樹在何方，他們都隻能沿著道路自己去確認。這麼一來他們就劣勢了，發現有水，煮水飲用，喝完腹瀉不止，或者駐紮在山岩下，或者樹林邊，結果被大火，或者落石弄了一個七零八散。
一旦這些藩軍陷入了這樣的境地，那些長州的民兵就會猛然間跳出來，趁你病，要你命，三下五除二的解決掉這些陷入慌亂的敵人。民兵組織的另外一個特點就是典型的通過敵人武裝自己，同時通過敵人學會戰鬥，很多民兵武裝越打越強最後一躍成為正規軍，當年百萬解放軍有多少是從民兵開始的，如今稱霸世界的美國人，一開始不過也隻敢叫自己快速民兵。民兵組織每消滅一次敵人就能從敵人那裏獲得更好乃至更先進的裝備武裝自己，每消滅一次敵人就能獲得一次寶貴的作戰經驗，能夠更加的適應戰場，熟悉戰場。最後一支民兵演化成一支正規軍這也不是不可能的，不過這個轉化很複雜，不是三兩句說變就變的，這裏麵還摻雜著很多其他的環節，這裏就暫不多說了。
西南諸藩的失敗，很快就通過水路和陸路傳達到了已經離開京都朝著長州進發的幕府軍大營。“怎麼可能，長州人這麼能打了？”大阪城，眾藩主傳遞著從德川家茂手上傳下來的戰報，每一個人看過以後都覺得不可思議。長州作為一個西南的雄藩確實不假，但是其藩主軟弱無能，其藩軍主力已經被消滅在了京都城，怎麼想來現在的長州都是一顆軟柿子了，可眼前的戰報清楚的告訴這些個大名，長州不僅沒能變成軟柿子反而變成了一顆硬的咯牙的石頭。德川家茂皺著眉頭，看著下麵驚訝不已的諸藩藩主問道：“有人能給我解釋一下這到底是怎麼回事麼？怎麼這麼多西南藩國都表示遭到了嚴重的抵抗，不能繼續出兵了？”底下的大名你看看我，我看看你，沒有人接茬，這茬畢竟不好接。