（1）濕邪犯上
濕邪犯於上部，主要病位在頭麵清竅、咽喉以及上焦肺及心包。葉氏所說：“濕與溫合，蒸鬱而蒙蔽於上，清竅為之壅塞，濁邪害清也”，指出了濕邪壅塞頭麵清竅的致病特點。此外，還有濕邪犯於上焦氣分而見身熱、頭脹、身痛、肢痛、胸悶不饑者；濕與溫合阻於肺口引起咽痛或咽喉欲閉者；濕熱或暑濕犯肺、肺氣失宣而致寒熱、咳嗽、喉痛、煩喘者；亦有因上焦氣化不宣而致二便失常、包括“溺阻”、“便閉”、“二便不通”者；還有因濕熱傷肺、濕鬱衛分、汗出不徹而發白者。
濕邪亦可蒙蔽清竅而出現神識昏蒙，但濕邪性質有所不同，臨床之證亦各異。有的為濕濁引起，症見四肢乍冷、自利、神倦不語或神呆、語言欲謇；有的為陽虛而濕熱內陷、蒙蔽心包；有的為暑濕內犯、內蒙清竅而出現發熱、目瞑、息短、神迷，如臨床見舌絳赤、齒板燥裂、鼻咽裂血、口瘡、耳聾、神識不慧、喉間痰鳴，則為濕熱或暑濕之邪化燥入營，內犯心包絡，與一般的濕蒙清竅者有所不同。
（2）濕阻中焦
濕邪的主要發病部位是在中焦脾胃。葉氏在診斷中尤其重視從舌苔來區別各類不同的證候表現。如葉氏所提出的“白厚而幹者”為胃燥氣傷；白苔絳底為濕遏熱伏；白苔不燥而悶極為脾濕盛；白苔黏膩，吐出濁厚涎沫，口必甜味者，為濕熱氣聚與穀氣相搏，困於脾土；白苔白如堿者，為胃中宿滯夾濁穢鬱伏；舌苔黃濁為有形濕熱或痰熱互結中焦；舌苔黑如煙煤隱隱而口渴煩熱者，為胃中燥熱；苔黑燥而中厚者為土燥水竭等。此外，葉氏還提出了濕邪在中焦可見脘痞、嘔惡、便溏等症狀，濕熱互結於中焦可見汗出熱解、繼而複熱或發黃疸等。
（3）濕在下焦
濕邪在下焦主要指濕邪阻於腸道或膀胱。濕邪在腸道可致大便溏或溏而不爽，濕邪在膀胱可出現小便不利、澀痛或溺閉等症狀。
濕邪亦可彌漫上、中、下三焦，引起水道不利，氣機鬱滯，其主要臨床表現為胸悶、脘腹痞脹、嘔惡、小便不利或短少、大便溏泄或不爽。
當濕熱或暑濕之邪完全化燥而進入營血後，其臨床表現與一般營血分病證相似，也可有舌絳、發斑、出血、化風痙厥等症狀。但有的時候，病雖已入營血，而濕濁之邪未盡，則其臨床表現略有不同，主要表現為舌上有膩苔，如葉氏說：“舌色絳而上有黏膩似苔非苔者，中挾穢濁之氣”，章虛穀也提出：“熱入於營，舌色必絳，風熱無濕者舌無苔，或有苔亦薄也；熱兼濕者，必有濁苔而多痰也。”
從其上討論可知，葉氏對濕邪為病的診斷極重視舌苔的變化，同時也結合患者的全身表現以綜合分析、判斷濕邪的性質、部位。
4.濕邪為病的治療
葉氏對於濕邪為病的治療提出了許多精辟的見解，並有相當豐富的治療內容，其中多數內容被吳鞠通收於《溫病條辨》之中。下麵就葉氏關於濕與熱相合致病，即濕熱性病邪致病的治療作一歸納和分析。
（1）治濕原則
1）濕熱相夾，當主祛濕對於濕熱為患者，葉氏強調應使濕不與熱相搏，使熱勢孤立，則其熱易祛。如說：“在表初用辛涼輕劑……挾濕加蘆根、滑石之流，或透風於熱外，或滲濕於熱下，不與熱相搏，勢必孤矣”。對於濕熱已入裏者，葉氏指出：“熱自濕中而來，徒進清熱不應”，“熱從濕中而起，濕不去則熱不除也”，“熱自濕中而出，當以濕為本治”等，都可看出葉氏對濕熱為患強調祛濕。
後世有的醫家在此基礎上進而提出濕熱兼而致病者，可先予辛溫之劑化其濕，俟其化燥後再轉手清熱，此種見解雖有一定道理，但不無片麵之處。在臨床上可以化濕與清熱並施，究葉氏之原意亦並非先置熱邪於不顧而單祛其濕，而是在清熱之同時重視祛濕。
2）治濕重佐理氣
葉氏治濕注重調理氣機，因氣機流暢則水濕不易聚而為患，如葉氏對三焦濕邪的治療提出：“先論上焦，莫如治肺，以肺主一身之氣化也”。葉氏常用藥物有杏仁、瓜蔞皮、白蔻、川樸、陳皮等，均屬流氣化濕之品。
如濕邪兼具穢濁之性，葉氏多用芳香理氣化濕之品，如藿香、白蔻、鬱金等，即葉氏所說：“清熱開鬱，要佐芳香，以逐穢為法”。
在濕邪為病時，濕阻和氣滯亦是相互影響的。濕邪內阻可影響氣機流通，氣機鬱滯亦可致濕阻。因而濕邪得去，也有利於氣機的流暢，故葉氏說：“濕走氣自和”。
3）治濕應分三焦
葉氏對濕邪的治療要詳細地區分濕邪所在的上、中、下三焦部位，用藥法度井然。葉氏所說的邪在三焦而用杏、樸、苓等類，正是提示了濕邪在上、中、下三焦時分別采用的開上、宣中、導下之法。具體來看，濕邪在上焦者，主以宣化，治肺為主；濕在中焦者，主以運化，治脾為主；濕在下焦者，主以淡滲，治腎、膀胱為主。若濕邪遍布三焦，則以上各法可結合運用。此外，不論濕在上下，淡滲之法均可運用，如滑石、通草、茯苓等皆為葉氏所習用，此即“治濕之法，不利小便非其治也”。
4）治濕須顧陽氣
濕屬陰濁之邪，易損人體陽氣，加之在溫病過程中每多用苦寒之品，致陽氣更受損傷，因而葉氏強調治濕須顧護陽氣。他說：“如麵色白者，須要顧其陽氣，濕勝則陽微也。法應清涼，然到十分之六七，即不可過於寒涼，恐成功反棄，何以故耶？濕熱一去，陽亦衰微也。”在醫案中也提出：“藥必從喉入胃，然後四布，病所未得藥益，清陽先已受傷”，說明用藥不當極易損傷人體陽氣，於治療中就不應濫用寒涼。且濕邪之化亦多忌涼，過用寒涼，濕邪難祛，即吳鞠通所說的“濕為陰邪，非溫不解”。故葉氏治濕溫病案多為寒溫並用，既為清熱化濕所需，又可保護人體陽氣，不致寒遏傷陽。
（2）不同部位濕邪的治療方法
1）濕邪在表，主以宣表化濕葉氏對於風邪夾濕，或暑濕之邪犯於肌表而致寒熱頭痛、脘悶、身重、苔白膩者，常在淡豆豉、杏仁、桔梗、蘇梗等宣散外邪的解表藥中加入化濕之藥。常用者除了藿香、蔻仁等芳化之品外，還常用通草、蘆根、滑石、苡仁等滲濕之品。如屬感受暑濕於內而表有寒邪者，葉氏推崇香薷，認為其不僅辛溫發汗，且能泄宿水。
2）濕在上焦，主以宣氣化濕對於濕邪偏於上焦者，葉氏多用杏仁、苡仁、通草、蔻仁、滑石等宣化利濕之品，吳鞠通創三仁湯亦本於此。若屬暑濕之邪犯於上焦，多用西瓜翠衣、絲瓜葉、荷葉、綠豆、益元散、六一散、大豆黃卷等消暑化濕之品。