監國魯元年丙戌正月己酉朔，王在紹興。遣原任天津參政柯夏卿（原注：號遯庵，黃岩人，進士）、太常少卿曹維才使閩中。以原任右庶子餘煌為兵部尚書，加右僉都禦史錢肅樂為兵部右侍郎。
二月，叛將張國柱掠餘姚，其部曲張邦寧掠慈溪。總兵陳梧敗於檇李，自乍浦浮海至餘姚，大掠；職方主事王正中方行縣事，集民兵擊殺之。閩中遣僉都禦史陸清源解餉十萬給浙東，方國安縱兵攫之，拘清源不遣（小腆紀年雲：字嗣白，平湖人，崇禎甲戌進士；為國安所殺。勝朝殉節諸臣錄雲：江防潰，投江死，國朝賜諡忠節），蓋馬、阮所構也（明季南略及紀年，並以為在錢塘江戰後）。
三月十九日，毅宗大祥；戶部主事（原作郎中，據第十八卷補傳正）董守諭請王哭臨，三軍縞素一日，從之。北兵決壩，放船入錢塘江。張國維嚴飭各營守汛，王之仁、鄭遵謙率水師襲戰，敗之（小腆紀年作是月朔日事）。平海將軍周鶴芝議乞師日本，黃斌卿止之。
四月，王正中率師渡海鹽，破澉浦城（小腆紀年作三月事）。
五月，兵部右侍郎錢肅樂棄軍之舟山。都督（鄞縣誌作總兵）陳謙奉使至閩中，為禦史錢邦芑所劾，被殺。加兵部右侍郎孫嘉績戶部尚書（據第六卷本傳，四字疑衍）、熊汝霖兵部尚書，並兼東閣大學士。尚寶寺卿朱大定、太仆寺卿陳潛夫、兵部主事黃宗羲、吳乃武、查繼佐等會師渡海劄潭山（南疆繹史作海壇山），以江上兵潰，乃還。
六月丙子朔，江上兵潰。方國安、馬士英等欲劫王投降，遣人守之；會守者病，王得脫，乃由江門出海，令保定伯毛有倫扈元妃、世子自定海出海（明季南略作五月二十八日事，小腆紀年作二十七日事）。大學士張國維、兵部尚書餘煌、禮部右侍郎（勝朝殉節諸臣錄作兵部左侍郎）陳函輝、通政使吳從魯（小腆紀年雲：字金堂，山陰人，萬曆丙辰進士，官通政司左參議）、大理（原作太仆，據第五卷本傳正）寺少卿陳潛夫、翰林院編修複儀（紀年以為唐藩遇害後死）、江西道禦史傅岩、兵部主事高岱、葉如〈艸恒〉（紀年以作汝〈艸恒〉，一作汝蘅）、原任山西僉事鄭之尹、諸生傅日炯、趙景麟等皆死之，方逢年、謝三賓、宋之普、方國安及馬士英、阮大铖等並降。寧國公王之仁泛海至金陵，死之。北兵破金華，大學士朱大典闔門死之。富平將軍張名振棄石浦，以舟師扈王出海，投肅虜伯黃斌卿；斌卿不納。永勝伯鄭彩至舟山，奉王入閩。叛將張國柱攻舟山，為水營將阮進所敗，劫元妃、世子去（以上三事，小腆紀年並係九月內）。
二十四日，大學士孫嘉績卒。
八月十一日，建寧陷，僉事倪懋熹死之。
二十七日，閩中陷，唐藩出奔汀州，為北兵所殺（按小腆紀年：唐藩名聿鍵，小字長壽，太祖九世孫。二十一日自延平出奔，二十四日大兵取延平及天興府，追殺於汀州之府堂，時二十八日也）。
九月，以兵科給事中張煌言為右僉都禦史（按小腆紀年，以明年正月進是職）。
十月丁酉，王發舟山。
十一月丙寅，王次廈門（南疆繹史稱中左所，亦名鷺門）。時鄭芝龍（小腆紀年雲：字飛皇，小字一官，福建南安縣石井人）已降北，令彩執王以降；彩不從。芝龍之子成功不肯隨父，複建義海上，而以廈門為營；然亦不欲奉王，改明年為隆武三年。於是鄭彩改次長垣，改明年為監國二年。海上遂有二朔。