步法
步法同樣也是忍者所要具備的基本素質之一。日本諺語“躡手躡腳好似忍足”（抜き足差し足忍び足），正說明了步法對於忍者的重要。在所有的忍術秘訣中，都羅列了作為忍者獨特兵法的“步調十法”，正是教授忍者如何才能讓自己在潛入敵陣中時不發出腳步聲，即便是在屋頂、樹木等危險的地方仍然可以快速奔跑。同時，還有著被稱為“忍步”的獨特兵法，它教授忍者如何更加充滿效率地長途奔跑。這一係列有關步法的忍術，也同樣需要每天的不間斷修行才能被掌握。
拋開那些神乎其神的傳說和已經無從查考的曆史，忍者這些艱苦的基本素質修行，從現代的體育科學的觀點來看，對於一個正常人來說，究竟有著怎樣的意義呢？
腳力
首先，先來了解一下忍者們為了提高跑動速度和跳躍力而進行的修行。在提高跑動速度方麵，忍者通常都是這樣訓練的：在腰間綁上足以垂到地麵的長布，並在胸前貼上一個鬥笠。奔跑中，既要保持長布始終不落到地麵，也要保持鬥笠不掉在地上。這些都起到了讓忍者了解“自己的最高速度”和“能保持的最高速度”的作用。長布和鬥笠，都是眼睛可以感知的參照物，這樣可以讓訓練者隨時了解到自己目前的狀態。每天通過這樣反複的訓練，在奔跑能力提高的同時也能讓自己第一時間看到效果。
為了提高跳躍能力，忍者們種植一種很特殊的麻類植物。每天所要進行的修行，就是反複跳過自己種植的這種麻類植物。一般來講，麻類植物3—4個月長成4米左右，通過換算，每天約長3.3厘米。忍者所種植的這種麻類植物，則是以每天2厘米左右的速度生長。忍者正是通過這種堅持不懈的跳躍訓練，使自己的跳躍高度獲得理想的提升。不過，由於現代麻類植物大都禁止或限製種植，這種訓練也變得不太現實了。
視力
因為忍者大多是在夜晚執行任務，所以對於視力方麵的修行，大多以夜視方麵的訓練為主。即便是到了現在，忍者為了視力強化而展開的修行，也有著很強的現實意義。為了保持優秀的視力，忍者非常重視眼睛的休息。眼部肌肉的訓練是通過控製眼睛注視物品的焦點來進行的，這和現代醫學的視力複蘇練習有著異曲同工之妙。除此之外，忍者也十分注重通過食物營養的攝取來增強視力。
洞察力
為了獲得敏銳的洞察力，除了熟讀兵書之外，忍者還要反複進行實際演習。洞察力訓練，也正是在實際演練中通過對肉體反應的不斷磨煉來進行的。每個忍者都是實幹家，從不紙上談兵。忍者深知每一次任務的艱巨性，為確保任務的順利完成並提高自己的生存概率，隻有通過不間斷的實際演習，使得從肌肉到神經都時刻處於一種訓練有素的狀態，以應對各種突發的狀態。空手接鏢、空手奪刃、在睡著的狀態下一躍而起躲過劈過來的刀劍……現在民間流傳的許多忍者故事，都有類似描述忍者敏銳洞察力的情節。
記憶力
現代科學一般認為人的記憶分為“短期記憶”和“長期記憶”兩種。一般人對所接觸的事物的印記通常都是短期記憶，而當短期記憶被積累重複一次的話，短期記憶的一部分就會轉換為長期記憶。早在那個時代，忍者就已經熟知這方麵的知識。每個忍者都要經過特殊的記憶訓練，等到成長為一個合格的忍者的時候，對需要印記的事物達到過目不忘。聖德太子身邊的大伴細人，便是很好的例子。得益於他強大的記憶力，聖德太子才有了八耳皇子的美譽。另外，在麵對任務中實在難以印記的情報時，忍者會用刀具在身上以符號的方式印記信息。這也足見忍者對於主君的忠心了。
肺活量
人的肺活量，是由肺部橫膈膜的強度來決定的。橫膈膜擴展的強弱，決定了肺部積蓄空氣的空間大小。忍者對肺部強化訓練，不僅僅局限於通過傳統的肌肉練習，還通過調整呼吸方法來進行。一種被稱為“雙重呼吸”的特殊呼吸方法，既是忍者鍛煉肺部橫膈膜的重要方式，同時也是在劇烈運動中調節呼吸頻率的重要手段。
步法
提到忍者的步法，就不得不談起明治時代以前日本人的一種特殊行走步法。這種因和服的束縛而產生的被稱為“ナンバ走り”的步法，初次在體育領域中亮相時，受到了西方人很大的關注。不同於傳統的抬左腿動右臂、抬右腿動左臂的步法，“ナンバ走り”是左腿與左臂、右腿與右臂一同行動的一種獨特的步法。而這種步法，有著傳統走法沒有的優點。由於幾乎沒有腰部的運動，這種步法可以減少體力的消耗，姿勢也相對穩定，並且還具有活化腦細胞的作用。忍者特殊的忍步，正來源於此。基於“ナンバ走り”，忍步又拓展出了行走上減少負擔並可以隨時用腰部發力進攻的獨特步法。