十八年癸未，春三月，木華黎去世。夏天，在八魯彎川避暑。皇子術赤、察合台、窩闊台和八剌的軍隊都來會合，遂即平定西域各處城市，設置達魯花赤進行監督治理。
十九年甲申的夏天，宋朝大名總管彭義斌侵犯河北，史天倪與他在恩州交戰，打敗了他。這一年，太祖到東印度國，角端出現，於是班師。
二十年乙酉，春正月，回到行宮。二月，武仙在真定叛變，殺死史天倪。董俊手下的判官李全也在中山叛變。三月，史天澤向武仙發起攻擊，武仙逃走，收複真定。夏季六月，彭義斌以軍隊響應武仙，史天澤在讚皇防禦，將他捉住殺死。
二十一年丙戌，春正月，太祖因為西夏收留仇人亦臘喝翔昆以及不送質子，親自帶領軍隊去討伐。二月，攻取黑水等城。夏天，在渾垂山避暑。攻取甘、肅等州。秋天，攻取西涼府搠羅、河羅等縣，於是越過沙漠，到黃河九渡，攻取應裏等縣。九月，李全捉住張琳，帶孫郡王指揮軍隊將李全圍困於益都。冬季十一月庚申，太祖攻靈州，西夏派嵬名令公前來援救。丙寅，太祖渡過黃河攻擊西夏軍，取得勝利。丁醜，五星相聚，出現在西南，太祖屯駐在鹽州川。十二月，李全投降。授予張柔行軍千戶、保州等處都元帥之職。這一年，帛子窩闊台和察罕的軍隊包圍金南京，派遣唐慶前往金朝責問為什麼不交納每年進貢的錢物。
二十二年丁亥，春天，太祖留下一部分部隊攻打西夏王城，自己帶領軍隊渡過黃河攻打積石州。二月，破臨洮府。三月，破洮、河、西寧三州。派遣斡陳那顏攻打信都府，占領了。夏季四月，太祖到龍德，攻取德順等州，德順節度使愛申、進士馬肩龍戰死。五月，派唐慶等出使金朝。閏五月，太祖在六盤山避暑。六月，金朝派遣完顏合周、奧屯阿虎前來請求和好。太祖對群臣說：“我在去年冬天五星聚會時，已經許願不再殺掠，急促中忘記下詔書了。現在可以向中外發布告示，讓他們的使者也了解我的意思。”這個月，夏國王李日見投降。太祖到清水縣西江。秋季七月壬午，太祖身體不適。己醜，在薩裏川哈老徒的行宮去世。臨死前對身邊的人說：“金朝精銳部隊都在潼關，南邊有連綿的山脈可以據守，北邊有廣闊的黃河為界，很難迅速攻破。如果向宋朝借路，宋金是世代的仇敵，一定能答應我們的要求，於是我軍攻占唐、鄧，直搗金朝都城汴梁。金朝著急，必然從潼關征調軍隊。然而他們數萬軍隊，從千裏外前來援救，人馬疲乏，即使到了也不能打仗，我們一定能取得勝利。”說完去世。年66歲。葬於起輦穀。至元三年冬十月，追諡聖武皇帝。至大二年冬十一月庚辰，加諡法天啟運聖武皇帝。廟號太祖。在位22年。
太祖為人深沉，有偉大的誌向，用兵如神，所以能滅40國，並且平定西夏。他的奇勳偉跡很多，可惜的是當時沒有設置史官，可能不少事跡沒有記載下來。
繼往開來治天下——窩闊台
元太宗窩闊台，是太祖三子。母親是光獻皇後，出身於弘吉剌氏族。太祖討伐金朝平定西域時，以太宗攻占城池、開拓土地的功勞居多。太祖歸天時，太宗從霍博地方前來參加喪禮。
太宗元年(1229年)秋，八月二十四日，諸侯王和群臣在怯綠連河邊的曲雕阿闌地方舉行盛大的集會，太宗遵照太祖的遺詔在庫鐵烏阿剌裏即皇帝位。此時起，開始製定朝廷禮儀，皇族和貴戚都要向皇帝行叩拜禮。頒布“大劄撒”——即漢語“大法令”的意思。金朝派阿虎帶來向太祖的喪禮敬獻的禮物，太宗說：“你們的主子久不投降，使我們先帝在兵戎中歸天，我難道能忘記?禮物有什麼用呢！”拒絕禮物。便商議討伐金朝的問題。
太宗二年(1230年)秋，太宗親自領兵征伐南方。太宗三年(1231年)春，攻克鳳翔，進攻洛陽、河中等城市。攻占了它們。秋，因為高麗殺害了蒙古使臣，派撒禮塔領軍去討伐，攻占了四十餘城。高麗國王王派他的弟弟懷安公前來求降。撒禮塔按照定製設置官員，分別鎮撫各地，然後回國。
太宗四年(1232年)春，正月初七，太宗由白坡渡過黃河。正月初九拖雷渡過漢江，派信使來報告，太宗便下詔，命各軍前進。三月，太宗命令速不台等包圍金朝首都南京(開封)。
太宗五年(1233年)春，正月十五日，金朝皇帝逃奔歸德。二月，太宗來到鐵列都地方。詔令諸侯王商議討伐萬奴的事，立即命令皇子貴由及諸侯王按赤帶率領左翼軍討伐萬奴。夏，四月，速不台進軍到青城，崔立帶著金朝的皇太後王氏、皇後徒單氏及荊王從恪、梁王守純等來到蒙古軍營，速不台派人把他們送到太宗那兒，便進入了南京。六月，金朝皇帝逃奔蔡州，塔察兒率兵包圍了蔡州。秋，八月，核查登記中州的戶籍，共得73萬多戶。九月，虜獲萬人為奴。