由於他們的捍衛，最終扭轉了學術界不利於達爾文和他的進化論思想的形勢，初步確立了進化論在學術界的地位。幾年以後，連達爾文的反對派也開始明白，達爾文的進化論對於自然科學的許多領域的發展具有重大的意義。後來，連教會也改變了態度，宣稱過去的爭論純屬誤會。
這位說人是猴子變來的人，最終贏得了極高的榮譽。歐美10幾個國家、70多個科學研究和學術機構先後授予他各種稱號，他還獲得英國皇家勳章和開普勒勳（xūn）章，這對一個英國科學家來說是一種極大的榮譽。
不過，關於人是猴子變來的這樣的論點，在以後幾年中還是常引發一些小笑話，有這樣一則故事：有一天，達爾文受邀赴宴。宴會上，他恰好和一位年輕貌美的女郎坐在一起。“達爾文先生，”女郎帶著戲謔戲謔（xuè）：用有趣的引人發笑的話開玩笑。的口吻向科學家提出疑問，“聽說您斷言，人類是由猴子變來的，我也屬於您的論斷之列嗎？”
“那當然囉！”達爾文彬彬有禮地答道，“不過，您不是由普通的猴子變過來的，而是由長得非常迷人的猴子變來的。”
達爾文獲得了各種獎章。在他生日的時候，他收到了特殊的禮物。他不斷地捐贈金錢，支持科學事業和幫助親友。
達爾文晚年時已譽滿天下，金錢富足，但他視金錢名譽為身外之物，從不放棄科學研究。他的《物種起源》被譯成了53國文字，在全世界傳播。他獲得的獎章、獎金多得無以計數。
1867年普魯士“功勳騎士團”授予他騎士稱號，達爾文笑著對朋友說：“我已經被封為騎士了，但是，我認為這算不了什麼。”
英國女皇要授予達爾文爵士稱號，可是，達爾文根本不予理睬。
在各種榮譽麵前，使達爾文感到“極大的滿足”的禮物隻有兩件。
1877年2月12日，是達爾文68歲的生日。這一天，他收到了寄自國外的兩份特殊禮物：兩本精美的相冊。一本相冊內有154位科學家的照片和他們的生日祝詞；另一本相冊內則有217位觀察家和博物學家的照片。
看著這兩份別致而情意深厚的禮物，達爾文感到特別激動。他坐在椅子上，一邊翻閱，一邊自言自語道：“這是我曾經得到的最高的榮譽，我非常感謝他們。”
“這份珍貴的禮物一定要好好保存。”達爾文轉過身來對愛瑪說，“我馬上寫信給兩位發起人，向他們，並請他們向每一位惠（huì）贈者轉達我對他們的感激和謝意。”
愛瑪也為達爾文受到那麼多國外科學家的熱愛和尊敬感到高興。愛瑪知道，十幾年來，達爾文獲得了許多獎勵，但從來沒像今天這樣激動過。他把同行科學家的理解和尊重，看得比獲獎更珍貴。
達爾文懷著感激的心情拿起筆來，給兩位發起人寫信致謝。
達爾文曾繼承了父親10萬英鎊的遺產，但他在家庭費用方麵一直十分節儉，依然在簡陋簡陋：（房間、設備等）簡單粗陋：不詳細。的顯微鏡下進行科學研究工作，利用別人來信的空白處或反麵作草稿紙。
有人說達爾文像個守財奴，可他卻一貫助人為樂，慷慨大方。他在一生的最後20年裏，不斷地捐贈大筆款項，支持科學事業或者接濟（jǐ）朋友、親友。
達爾文的晚年是在病痛中度過的，但是，他仍舊完成了幾部著作。在最後的日子裏，他一直在和病魔作抗爭。
達爾文寫完《物種起源》後，又先後有幾部著作問世，包括《蘭花的傳粉》、《人類的起源及性選擇》等。這些書都他在忍受著疾病的折磨下完成的。
1881年10月10日，達爾文的最後一部著作——《經過蚯蚓作用的土壤的形成》，簡稱《論蚯蚓》出版了。
達爾文在1882年去世後，他的遺體被安葬在倫敦威斯敏斯特教堂墓地，與牛頓的墓在一起。這說明，他的偉大發現已被人們普遍承認了。他為人類科學事業做出了不可磨滅的貢獻。