先是裁軍複員和罷郡縣之兵。
劉秀手下究竟有多少軍隊？不算賬還好，一算賬嚇一跳。刨除劉秀固有的部隊不算，光是受降過來的部隊，總人數至少便有一百四十餘萬人 ，如此龐大的軍隊數量，就算放到現在，也足以躋身全球前五之列。即使是太平盛世，如此龐大的軍隊養起來都嫌吃力，更何況是亂世初定、百廢待興？
裁軍複員，此前一直也在進行，東方掃平之後，始有大規模的遣返，健壯精銳則留，其餘老弱病殘，悉數遣歸鄉裏。
中央軍足以作戰，於是又罷郡縣之兵，詔曰：“今國有眾軍，並多精勇，宜且罷輕車、騎士、材官、樓船士及軍假吏，令還複民伍。”隻有中央軍，不設地方軍，此後便成為東漢的定製。
再是大量減省官吏。冗官閑職，一律廢除，又因人口劇減，撤並四百餘縣。一番精簡下來，帝國還是那個帝國，但劉秀的官僚隊伍，人數卻隻有王莽的十分之一。原來的水分之大，蠹蟲之多，可想而知。
以上兩條，一言以概之，大力削減吃公糧的人口。
再降稅賦，激勵生產。此前由於軍事需要，行什一之稅（即稅率為百分之十），此時則改回西漢舊製，三十稅一（即稅率為百分之三點三）。接著赦免囚徒，釋放奴婢，招攬流民，勸以農桑，增加貢獻公糧的人口。
又有祭祀孔子、興建太學諸舉，作文化複興之建設，不在話下。
再說回隗囂。在劉秀眼中，隗囂和公孫述是區別對待的。公孫述是敵人，而隗囂是同誌，而且是可以挽救的同誌。自始至終，隗囂從來沒有與漢軍為敵，而且多次幫助馮異擊敗公孫述，為朝廷立下大功。可以說，隗囂除了不肯親自入朝之外，沒有任何對不起劉秀的地方。
麵對這樣一個老好人，劉秀實在是下不了狠手。他總覺得，隻要再多一點耐心，加一些殷勤，早晚能把隗囂爭取過來，用不著雙方撕破臉，落得個兵戎相見。在他最困難的時候，隗囂都沒有背叛他，如今他已征服了帝國的大部，無論是人口、經濟、兵力，都占據絕對優勢，隗囂自然更加沒有理由背叛他。
劉秀信心滿滿，加緊發動對隗囂的外交攻勢。然而，似乎是老天故意作祟，離奇的外交事故接連發生。
先是劉秀遣衛尉銚期出使，滿載珍寶繒帛，前往隴西賞賜隗囂。銚期行至鄭縣，不承想，珍寶繒帛卻被盜賊偷了個精光，隻得怏怏返回洛陽。銚期是出了名的猛將，卻栽在一群名不見經傳的盜賊手上，豈不怪哉！
再有隗囂遣使者周遊入朝，來洛陽朝拜劉秀。周遊途經長安，順便造訪馮異的大營，一不留神，卻被仇家偷走了腦袋。豈不怪哉！
接連兩件怪事，仿佛不祥之兆，給和平解決隗囂問題蒙上了一層巨大的陰影。劉秀向來迷信，聞訊歎道：“我和隗囂之間，恐怕是很難如意了。”
而在公孫述這邊，趁著劉秀尚未對他用兵，決定先下手為強，派遣田戎與將軍任滿自江關出發，沿長江順流而下，試圖襲取荊州諸郡，結果遭遇岑彭迎頭痛擊，無功而返。
公孫述主動挑釁，劉秀麾下將帥借機群起上書，請願伐蜀。劉秀不忙表態，把將帥所上之書，滿滿裝了一車，遣使者送到隗囂處，美其名曰，伐蜀這麼大的事，必須先得征求隗大將軍的意見。
隗囂當然知道劉秀征求意見是假，試探他的忠誠是真。在隗囂的內心深處，他並不願意看到蜀國被滅，他的理想就是維持現狀，於是回書劉秀，滿篇借口，說什麼“關中甫定，三輔單弱，廢池喬木，猶厭言兵”，又說“劉文伯盤踞朔方，勾結匈奴，大為朝廷之憂”。總之一句話，伐蜀的時機尚不成熟。
劉秀接書大怒，都什麼時候了，你隗囂還抱有割據一方的幻想？看來對隗囂再也不能一味懷柔施恩，必須恩威並重，給他足夠的壓力才行。
劉秀於是命祭遵、耿弇、蓋延、王常、馬武、劉歆、劉尚諸將各率精兵，先期進發長安，與馮異會合。建武六年五月，劉秀也移駕長安，親自坐鎮。