雍正帝采取了以上措施後，一套完備的密折保密製度就形成了。從中可以看出，雍正帝不但在處理重大問題上能雷厲風行，而且在細枝末節上也是思慮周詳，謹慎而睿智。
政治作用，不可低估
雍正帝執政時期，密折製在政治生活中的作用是不可低估的。對此，雍正帝自己有一番夫子之道。雍正帝在《朱批諭旨卷首上諭》中寫道："朕受皇考聖祖仁皇帝付托之重，臨禦寰區，惟日孜孜，勤求治理，以為敷政寧人之本，然耳目不廣，見聞未周，何以宣達下情、洞悉庶務。而訓導未切，誥誡未詳，又何以使臣工共知朕心，相率爾遵道遵路，以繼治平之政績。是以內外臣工皆令其具折奏事，以廣諮取，其中確有可采著，即見諸施行，而介在兩可者，則或敕交部議，或密諭督撫酌奪奏聞。其有應行指示開導及戒勉懲儆者，則因彼之敷陳，發朕之訓諭，每折或手批數十言，或數百言，且有多至千言者，皆出一己之見，未敢言其必當，然而救人為善，戒人為非，示以安民察吏之方，訓以正德厚生之要，曉以福善禍淫之理，勉以存誠去偽之功，往複周詳，連篇累牘，其大旨不過如是，亦既殫竭苦心矣。"
雍正帝把朱批奏折的作用總結為兩點，一是邀上下之情，以便施政；二是啟示臣工，以利其從政。皇帝能否正確領導天下臣民，固然與個人素質的高下有關，同時也要看皇帝對天下臣民的了解程度和對官員的約束程度如何，否則皇帝即使有力氣也不知往何處使。而且禁城深邃，天下曠遠，深居簡出的皇帝要想不出門而盡知天下事，著實不容易。如何靜坐深宮，仍能最大限度掌控和約束官員，這確實是個大問題。而雍正帝確立的這種奏折製度，使這些極難解決的問題迎刃而解，為全麵了解地方、控製地方提供了有利條件。
推行密折製度還收到了許多另外的妙用。正如雍正帝所說："凡督撫大吏任封疆之寄，其所陳奏皆有關國計民生，故於本章之外準用密折，以題本所不能盡者，亦可於奏折中詳悉批示，以定行止。"這是雍正帝看到封疆大吏在陳奏政務時，因限於題本程式和保密性質的局限，很難如實全麵地彙報當地情況。這樣，皇帝就無法徹底了解臣下的隱衷和下邊的情況，皇帝的指示也因同樣的原因不能盡述，於是就會產生皇帝無從決策，下屬無力奉行的怪現象。為此，雍正帝才決定使用密折這種公文行式，使臣下和皇帝可以互相亮明觀點，然後雙方才能經過討論，決定對策。
密折作為君臣間的一種私人通訊方式，可以讓君臣無話不談：臣下獻議，皇帝先睹為快，可以周知庶務，通達下情，直接批上自己的意見；國家有所興榮，臣下有不同看法，也可以婉轉諫勸。密折製雖然隻是一種無形的文書製度，但它所產生的影響卻遠遠超出一般衙門的興廢。海外學者楊啟樵先生在《雍正帝及其密折製度研究》一書中，將密折作用歸納為三點：
（1）露章奏事，使一些奏事人有所瞻顧，密折奏事便使官員消除此等疑慮，可以激發官員上進，也可以使皇帝增廣見聞，洞悉庶務。
（2）在密折製度下，官員們互相牽製，互相監視。人人存有戒心，不敢過於妄為，對整飭官吏起到了相互監察的積極作用。
（3）密折奏事，君臣在一些重大興革上預先私下達成協議，使皇帝不同意辦的一些重大問題，臣下不致率爾公諸朝堂；臣下持異議的一些重要決策，皇帝也不致貿然決斷，雙方都有緩衝的餘地，這樣就能避免重大政見紛爭。
此外，密折製還造就了雍正帝這位以文采著稱的一代帝王。雍正帝在位13年，絕大部分時間和精力都消耗在親自閱批密折、處理庶務上。雍正帝13年如一日，惟日孜孜，一絲不苟，寫下了千萬餘字的奏折批文，堪稱世界奇文，數量之多是當今一些職業作家所可望而不可即的。另一方麵，密折製將文化提升到了一個新的高度，即做領導者必須要有文化，否則連批文都寫不好，怎麼去發號施令？雍正帝從批改密折中鍛煉出來的才智和思想影響了曆史，使這種帝王文化精神沿襲下來。
總之，密折的誕生使皇帝與官員如同對坐探討，而且不拘時地，皆可下達指示或交換意見。這可以說是在當時條件下的一種信息寬帶，它使雍正朝的地方事務治理更切合皇帝的旨意，大大提高了處理事務的效率。