段祺瑞的“四大金剛”中，傅良佐同徐樹錚的關係本來還算不錯，但自從傅良佐湖南兵敗，徐樹錚每每見到他，都以一副瞧不起的麵孔指責他“沒用”，傅良佐惱羞成怒，兩人反目。因為徐樹錚的驕橫和自以為是，皖係內部事實上已經分裂。
皖係勢力在內訌中已經走到了分裂的邊緣，一直磨刀霍霍的直係也沒有放鬆行動的腳步。1919年12月，馮國璋病死，直係中第二號人物曹錕因為實力最強，逐漸成了本係的首領。而曹錕的政治主張開始也跟段祺瑞一樣，堅持走“武力統一”的路線，對段祺瑞的小算盤倒真沒有太多察覺。但曹錕從一個賣布小販能混到今天這一步，腦子裏畢竟也不全是棉花，漸漸地也看出了段祺瑞的最終目的是消滅所有不服從北京皖係政權的軍閥，為了自己和派係的利益，他隻有首先自保，然而實力上皖係最大，直係難以匹敵。怎麼辦？和徐樹錚一樣，曹錕也想到了奉係張作霖。
1919年秋冬時節，張作霖、李純、陳光遠、王占元等在曹錕的串聯下組成了包括直、蘇、鄂、贛、奉、吉、黑在內的七省反皖同盟，現在又加入了一個豫督趙倜，成為八省反皖同盟。1920年3月底，張作霖在沈陽以做壽的名義召集八省反皖同盟代表秘密會議；4月初，曹錕在保定借追悼直軍在湘陣亡將士的名義又召開了一次秘密會議，兩會都是商討對付皖係的辦法，最後八省同盟一致決定抵製徐樹錚、解散安福係、支持吳佩孚北撤。直奉聯合共同反皖的局麵已明朗化。
在政府內部，因為國務總理靳雲鵬不願聽從安福係的擺布引起安福係的極大不滿，他們處處刁難靳雲鵬，並在段祺瑞那兒告靳的“黑狀”。俗話說“眾口鑠金，積毀銷骨”，再幹淨的人也架不住天天身上被潑汙水，在安福係的挑唆下，段祺瑞對靳雲鵬越來越不滿，甚至當麵斥責“你如此無用，如何能配做總理！”遭此羞辱，怒火中燒的靳雲鵬再也忍耐不下去，立刻遞了辭呈。但因為直、奉兩係始終都支持靳雲鵬，安福係又拿不出自己的總理人選，於是靳雲鵬的總理還得接著幹下去。
然而，靳雲鵬的日子因為他對安福係不能徹底妥協而越來越難過了。就段祺瑞個人而言，靳是他的舊部，在總理位子上能得到其他各派係的支持，也是難得，於自己並無太大壞處，所以他仍舊支持靳內閣，但他管不住積極倒閣的一幫安福分子，因為這些人實際上是受到徐樹錚的指使。靳、徐相爭愈演愈烈，最後把老段氣得跑到團河休息去了，聲稱“不管閑事”。
徐樹錚仍不肯就此罷休，他甚至親自動手捏造了一封北洋係同人聯合署名的致靳雲鵬的信，指責靳雲鵬忘恩負義，自己受段祺瑞提拔之恩，現在竟然逼得段祺瑞出走了。靳雲鵬接到信後就又向徐世昌辭職，徐世昌對他多加撫慰，並調侃說： “見怪不怪，其怪自敗，你理睬他幹什麼？”
靳雲鵬辭職的消息傳出，張作霖還親自寫信給段祺瑞，請他約束徐樹錚，不要讓他胡作非為而累及自己的聲名。有鑒於各派勢力對靳雲鵬內閣的擁護，段祺瑞對靳雲鵬也表示支持，希望他不要辭職。
5月9日，曹錕致電徐世昌，明確提出不能更換靳閣的理由，同時他致電靳雲鵬，要他堅持住。張作霖得到消息，趕緊致電段祺瑞，要他出麵設法留住靳，同時他也致電徐世昌，要求徐果斷行動，挽救這次內閣危機。