“啊~，這可怎麼辦”，小智也隨後慌亂的喊道。
“不要慌，把3D龍放出來”，小霞則是稍微有點震驚的說道，畢竟在下落，是個人也會害怕的。
“哦，3D龍，出來吧”，小智反應過來後立刻就派出了3D龍。
“這是……”，而後就看到3D龍開始發出白光，小智吃驚的說道。
“是進化”，小剛在一旁也看著說道。
“這是3D龍II，假想神奇寶貝，是3D龍的進化型，而且這可是關東地區沒有的神奇寶貝哦”，小霞看到白光散去的3D龍II，隨後變大，接住了她們，這才解釋說。
“太好了，3D龍你進化了”，而小智聽完後高興的和3D龍聯絡感情去了，而小剛則是一臉的遲疑，看來已經想到小霞在門口給3D龍帶的升級卡片和現在進化的聯係了，不過他也知道小霞是不會害他們的，而且小霞的秘密也不止這一個，所以也就沒有深問，而小霞當然也不會說自己知道這裏會被傳送，才給3D龍攜帶升級卡片來通信進化的，小智這個已經高興的已經不能再高興的孩子更就不可能問了。
“那些就是網絡高速公路，順著這些傳送神奇寶貝的路線，我們就可以找到火箭隊了”，隨後就在3D龍II背上，大家沿著一些路線開始前進，而小剛也說道。
“為了防止世界被破壞”，“為了保護世界的和平”，就在小智他們找到火箭隊的時候，他們正在高興的念開場白呢。
“喂，火箭隊，就是因為你們神奇寶貝中心才陷入一片混亂的，現在立刻出去”，而小智這時則是大聲喊道。
“又是這些家夥喵”，喵喵看到後立刻開始慌亂了。
“交給我們吧，去吧，阿柏怪、雙彈瓦斯”，而武藏和小次郎則是立刻派出了阿柏怪和雙彈瓦斯。
“在網絡世界了展現你們的勇氣吧喵”，喵喵很有氣勢的喊道，然後阿柏怪和雙彈瓦斯就向這邊衝了過來。
“那是什麼？”不過3D龍II立刻放出了一個絕招，就把衝過來的阿柏怪和雙彈瓦斯打了回去，而小智則是不認識這個絕招。
“是三角攻擊，普通係的絕招，而且還有幾率是對手灼傷、冰凍或麻痹”，小霞解釋說，她也沒想到3D龍進化後學會了三角攻擊，看來可能是絕招已經都換了。
“我們用3D龍來打吧喵”，喵喵這時看著小智他們則是說道，而後武藏就派出了偷來的3D龍零號機。
“去吧，3D龍II”，而小智也讓3D龍II上場了，然後就看到3D龍零號機使用了衝擊向這邊撞來，不過3D龍II使用了高速移動躲開了攻擊，隨後一道藍紫色的射線打向了3D龍，原來是信號光束，而小智也在一旁激動的看著，畢竟3D龍II學會了新的招數。
“小剛，我們趁這個時候修一下線路，是神奇寶貝傳送可以正常吧”，小霞知道時間緊迫，要不然可能會被電腦疫苗消滅，所以就和小剛開始修理線路，小智則是和3D龍II拖住火箭隊，就在小霞和小剛修好線路後3D龍II也把3D龍打趴了。
“好了，我們趕緊回去吧”，而後小霞就立刻說道，她實在是不想在這裏待下去了，誰知道喬伊小姐會不是使用電腦疫苗呢。
“不好了，你們趕緊出來吧，喬伊小姐請來了專家，使用了強力的疫苗，你們在不出來就要被消滅了”，這時從3D龍零號機裏出來了秋原博士的影像，並且說道，而這次因為處理的比較順利，而火箭隊也聽了後非常的害怕，所以和小智他們一起乘著3D龍II立刻就逃出了網絡世界。
“你們給我記住，這不是火箭隊的真實實力，但是，今天，謝謝你們……”，火箭隊在出來後撂下這句話就跑了，而小智、小霞和小剛也懶得理他們，就由他們去了。
隨後大家回到了神奇寶貝中心，傳送裝置又可以正常運作了，而喬伊小姐他們也不知道小智、小霞和小剛的冒險，而是以為是疫苗的作用。
而後小智在小霞的建議下，用3D龍II交換來了小磁怪，而大木博士在接到3D龍II後，立刻就吃驚的說不出話來了，立刻掛斷了電話，看來是去研究3D龍II，隨後大家就踏上了旅途。