第六，不管魏征自己願意與否，他都無法與李世民陣營聯係在一起。一方麵是由於魏征沒有任何關係和渠道進入秦王的圈子，另一方麵是秦王府沒有用他的必要性。李世民各方麵的人才都很多，而且質量均很高，關係又極深厚可靠。且不說完全令秦王放心的長孫無忌、高士廉等人，他們分別是李世民的妻兄和舅父，當然是最可信賴的人。即使沒有這層親緣人際關係的其他文士武將，也個個與李世民的關係非同一般，像房玄齡、杜如晦、尉遲敬德，程知節、段誌玄、侯君集等，說他們是李世民的“死黨”，一點也不誇張和過分。人才濟濟而且淵源深久的秦王集團，也就根本不會用也用不著魏征這種既陌生又平凡的普通文人。
魏征就這樣身不由己地卷入了唐朝最高權力鬥爭的漩渦之中。這場鬥爭由唐高祖武德四年（621年）拉開序幕，到後來愈演愈烈，直至武德九年（626年）發展成為宮門喋血的武裝政變，長達5年之久。
魏征進入太子東宮之後，按照他的性格和為人處世原則，開始了他兢兢業業的本職工作，而且他不怨不尤，在宮中的司經局裏，將太子的所有圖書典籍整理收拾得有條不紊，隨時恭候著太子的閱讀和查詢。短短的幾個月後，宮中圖籍一掃封塵，燦然可觀。李建成對魏征的勤勉和能力，十分欣賞，由於魏征的吸引，原來並不很愛看書的太子，也喜歡上了這窗明幾淨的圖書室，喜歡上室內寧靜雅致的氣氛，更喜歡上魏征的淵涵睿智的風度和使人深刻明智的談吐。魏征自知官微位小，在太子府地位上不可能經常陪侍太子左右，更難以參加太子府的重大決策。但“士為知己者用，女為悅己者容”，如今太子將我招至麾下，他就是我服侍和擁護的主人，為他服務，為他操心，為他出謀劃策，就是我們當文臣的分內職責。所以，隻要太子來到司經局，魏征總是調整精神，全身心投入地接待他。日理萬機而且憂心忡忡的李建成，當然不是來這裏優哉遊哉閑翻古書的，他是想從魏征這裏獲得一些應付和操縱當前政局的方略和技能，滿腹韜略、博通經史的魏征當然不會令太子失望，況且他年已40，老成持重，嚴謹真誠的性格和知無不言、言無不盡的作風，更使太子大生好感，日益信任。魏征的學問很深，思謀也很豐富，但他發言說話從不漫無邊際地一味炫博誇飾，而永遠是針對現實麵臨的矛盾主題，進行分析論證，然後得出明確的結論。魏征為建成獻計獻策，盡心竭力，堪稱至誠。魏征為建成做了兩件大事，均具重要意義，直接關係建成的成敗乃至存亡。
第一，答情勢之問。
武德四年（611年）十月，李淵以李世民戰功顯赫，曆代所設置的官職都不足與他功績相稱，特以李世民為天策上將並兼陝東道大行台尚書令、司徒。天策上將位在王公上，陝東道大行台管轄山東行台、總管府及各州，李世民便是陝西以東河南、河北（這是唐代經濟、文化最繁榮的地區）的最高軍政長官，地位接近太子，實際權力則遠遠過之。不僅如此，李淵又特許秦王李世民、齊王李元吉成立護軍府（左、右各三，凡六府）、左右親事府、帳內府。親事府、帳內府掌儀仗、陪從，諸王均有，而護軍府是戰鬥部隊，僅世民、元吉有之，這對建成構成直接威脅。這時河北又發生了劉黑闥起兵之事，又為世民、元吉帶來再立戰功的機會。
劉黑闥原是竇建德部將，以善觀時變、作戰勇猛著稱。他常潛入敵陣偵察虛實，或出敵不意，趁機奮擊，多次取勝並有所繳獲，故在軍中號為神勇。竇建德失敗後，他躲藏在漳南（今河北故城東南）老家，閉門不出。後竇建德被押回長安斬首，接著李淵又下令召竇建德舊部範願、董康買、高雅賢等進京，引起他們震驚恐懼，互相商量說：“王世充投降唐朝，他的將相都被消滅，我們到長安，也定不會有活路。近十年來，我們身經百戰，早當死了，現在又何必吝惜這僥幸保全的生命，何不用它來幹番事業呢？再說夏王（竇建德）戰擒淮安王李神通，待以客禮，唐得夏王即將其殺害。我們都是深為夏王器重的，如果不替他報仇，也無臉見天下的英雄好漢。”於是決定擁戴劉黑闥，起兵漳南。霎時間，竇建德舊部群起響應，李淵以淮安王李神通為山東道行台右仆射（行台副長官）率兵討伐，反遭大敗，兵馬軍資損失三分之二。劉黑闥攻城略地，數月之間便全部恢複了竇建德原來控製的地區。
武德四年（621年）十月，世民授天策上將，即奉命與元吉出征，同月，世民兼任左、右十二衛大將軍，又完全掌握了禁軍。武德五年（622年）正月，世民、元吉率軍到達河北，攻下洺水縣城（今河北曲周東北），與劉黑闥軍在洺水河對峙。李世民再次運用對付竇建德的戰略戰術，先按兵不動。兩軍相持60餘日，黑闥糧盡，被迫決戰。李世民事前派人在洺水上遊築堰阻水，待黑闥來攻，決堰放水。黑闥突遭水淹，潰不成軍，溺死數千人，黑闥與範願等率300騎兵逃往突厥，山東又重新回到唐朝管轄之下。
李世民再建功勳，使建成越發不安，他問魏征：山東能安定下來嗎？這一發問意味深長，反映了這時建成矛盾、焦慮的複雜心態。建成當然希望山東盡快安定、永遠安定，畢竟他是太子，國家未來的主人。然而，地方無事，世民就會回到朝廷，他再三立功，位高權重，野心勃勃，部屬躍躍欲試，僅他一人就是嚴重威脅，又有元吉時常跟隨他出征，關係非同一般。世民、元吉聯合，自己的儲君位置會不會被人取而代之，自己該怎麼辦呢？任其自然，聽天由命。不！他不甘心，他要抓世民的把柄，主動出擊。建成暗暗思忖，世民作戰勇猛，戰功赫赫，無可求疵，但殺戮過分，未免殘暴。往日屠夏縣（今屬山西）；去年殺王世充已降將佐，處死竇建德，引起驚懼，逼反劉黑闥等；今又獨斷專行，對劉黑闥部將大肆鎮壓，這能成功嗎？如果不成，這豈不是打擊世民的絕好依據？所以他才這樣問魏征。魏征自然清楚建成所問的真正意圖，他的回答既明確又肯定而且聰明。他說：劉黑闥雖然失敗，但殺傷太過分，黑闥將領凡逃亡的都被公布姓名，宣布處死，他們的妻兒也被俘虜，這些人想投誠都不可能。盡管有赦令，也還是一經抓獲便遭殺戮，現在看來，如果不是大量饒恕寬容，恐怕黑闥餘黨重新嘯聚在所難免，山東的老百姓不可能得到安寧。魏征答問，表麵上隻講情況，不及其他，而實際上卻正中要害。事實表明，李世民妄自尊大，無視皇上詔令，大肆殺戮，必將引發強烈反抗，這正好給建成提供了絕好材料，可以據此打擊世民。看來建成確實將世民的所作所為及時上告了，所以當世民擊敗黑闥後正引軍南下進攻響應劉黑闥起事的兗州（今山東兗州市）刺史徐圓朗時，被李淵緊急召回京師，待他親自作了解釋才令他再去山東。徐圓朗尚未完全平定，李淵就讓他班師，這個中微妙，當與建成的動作有了成效有關。從此之後，一直到玄武門之變，4年之間，世民就很少領兵出征了，也就再無新功，其契機或由此開始吧！