盡管獲得了包括最佳影片之內的4項奧斯卡提名，但漢克斯卻沒能憑借《綠色英裏》再度入圍奧斯卡影帝的競選行列。該片在美國票房排行榜冠軍位置上僅待了一周，取代它的是漢克斯的另一部電影《玩具總動員》續集。他依然為伍迪配音，並幫助該片拿下了近6000萬的首映周末票房，以至於有人會驚呼：“漢克斯票房號召力已經超出了人類的範疇！”
《綠色英裏》的拍攝超期隻是一次演練而已，漢克斯的下一部電影堪稱電影史上拍攝周期安排最奇特的例子，而這樣的結果並非出於什麼意外，而是漢克斯與導演羅伯特·澤米基斯的一次合謀。
這部名叫《荒島餘生》的電影創意來自漢克斯本人。他偶然在電視上看到一段采訪，被訪者是二戰期間一場海難的幸存者。“他爬上了一座珊瑚島，在等待救援的漫長日子裏，他吃光了島上所有能吃的東西，不止一次地想到自己會死，”漢克斯說，“采訪者認為這是一段冒險的經曆，問他是否想回去看一看當年的那座小島。這個人回答說，‘這不是冒險，這是地獄，我再也不希望看到那個地方。’他的話令我產生了強烈的興趣，我開始設想人在失去了所有社會聯係的情況下會怎樣？在這種情況下人會有怎樣的心理活動？其複雜性和戲劇性也許遠遠超出了我的想象。”
超出漢克斯想象的還有昂貴的付出。《荒島餘生》是他與《阿甘正傳》導演羅伯特·澤米基斯的第二次合作——影片還沒拍到一半，其成本已經高達8000萬美元。造成這一局麵的原因之一就是漢克斯為使他的表演更加真實而要求了一年的準備期。
在片中，漢克斯扮演的查克·諾蘭是聯邦快遞公司的業務工程師，在帶著牙痛回家的途中，他乘坐的飛機墜落在一個荒島上。諾蘭是唯一的幸存者，處在一個簡直難以想象的遠離塵世的環境中，他的忙忙碌碌的生活也一下了結束了，不僅失去了每天生活中慣用的東西，也失去了與外界的聯係。
當他再次出現在銀幕時已經是幾個月之後，孤獨無助的荒島生活使他在身體和情感上都發生了顯著的改變，他不得不努力地試圖活下去。
盡管電影發展到今天，運用化裝和特技完全可以使一個人變得消瘦憔悴，但是漢克斯和澤米基斯卻決定借助古老的方式，通過減肥和鍛煉達到這樣的效果。於是，在1999年1月至2月間，他們先用了8周時間拍攝諾蘭開始荒島生活前的所有鏡頭。此後，接力棒便交到漢克斯手中，他要用最短的時間強行減重23公斤。在此期間，澤米基斯將帶領原班人馬拍攝另一部電影，即由哈裏森·福特與米歇爾·法伊佛聯袂主演的超自然電影《危機四伏》（WhatItiesBeneat|。）。
漢克斯帶著為這部電影蓄起的胡須出席了1999年的奧斯卡頒獎典禮。5月初，當他出現在美國活動影像博物館的年度頒獎活動上時，他已經比以往消瘦了許多，但他還必須在秋天結束時再減去18公斤的體重。當時他開玩笑地對記者說：“我還沒有減肥，我還在吃光所有放在盤子裏的東西，我總是說——明天我將正式開始。”
2000年初，漢克斯用了將近一年的時間達到了他的減肥目標，瘦得像一根麻稈兒的他乘機飛往斐濟，與等候在那裏的導演和劇組會合。
這場千萬美元的賭博取決於漢克斯是否有毅力堅持到底，也取決於大部分劇組人員必須在不拿薪水的情況下等待漢克斯的成功歸來。
事情在開始時並非一帆風順，早在電影開拍之際，漢克斯的右膝就在斐濟感染了細菌，差點讓他取消了奧斯卡之行。加州聖塔莫尼卡聖約翰醫院的大夫起初無法解釋漢克斯為什麼會感覺右膝疼痛，直到做了病理切片後才發現他感染上的是一種並不多見的細菌。
連續幾小時地在斐濟溫暖的海水中拍戲，漢克斯的全身腫起了水泡，他不得不返回洛杉磯醫治。為了不引起恐慌，他用了假名字在醫院登記。
因為病情嚴重，他錯過了奧斯卡頒獎典禮前獲提名者的宴會。好在接下來的手術做得很成功，他才最終得以在頒獎之夜亮相。
澤米基斯對《紐約時報》說：“漢克斯的角色獨自一人在荒島上生活了4年，用以果腹的隻有生魚和椰子。我們必須這樣做，我們沒有其他辦法來掩飾演員肉體上所發生的變化。當漢克斯讀到劇本時，他說，‘這是一個了不起的故事，但是我們怎麼如何能把它真實地表現出來？你怎麼能讓一個現代人演出角色的生理感受和變化？看來，我們隻有身體力行地去經曆同樣的磨難。”’