可船隻已被沒收，海盜又十分猖獗，加之官府出於外交政策對日僧隨時照管，繼續東渡又談何容易呢？鑒真似乎早已有了主意，他接著又對日僧說：“從現在起，你們就不要在官府安排的地方住了，擺脫與官府的聯係，然後我再籌資購船，重新組織東渡人員。”
“大師慈悲無邊，不愧菩薩再世！”榮睿和普照跪倒在鑒真麵前，不住地叩拜。
第二次東渡計劃開始了。鑒真拿出全部積蓄，作為籌備舟、糧的費用，其中用八十貫錢購買了嶺南道（治所在今廣州）采訪使劉巨鱗的一艘軍船，並雇船員十八名。同時，他還采辦了必須的糧食、藥品、用具和文物、書籍等。考慮到在日本建築佛寺等方麵的需要，鑒真還招聘了八十五名工匠。手下弟子經過再次動員，祥彥、思托、道興、德清等十五人發誓與大師同行。
一切準備就緒。天寶二年臘月，一個月明星稀的夜晚，鑒真率眾弟子及各位工匠悄悄地登上停泊在運河上的軍船，然後乘著夜色揚帆東渡。
同船東渡的人除鑒真師徒外，還有畫師、繡師、玉雕師、刻鏤、鑄寫、修文等工匠共一百八十五人。船上裝載的物品有：落脂紅綠米一百石，甜豆三十石、牛蘇一百八十斤，麵五十石，幹胡餅二車，幹蒸餅一車，幹薄餅一萬，番撚頭一車半。除以上各種海糧外，還有漆合子一盤三十具，各類佛菩薩畫像、塑像以及金字《華嚴經》一部、金字《大品經》一部、金字《大集經》一部，金字《大涅槃經》一部，雜經章疏等一百部，還有障、幡、玉環、經函、銅瓶、花氈、大銅盤、中銅盤、小銅盤、大銅盂、竹葉盂、一尺銅疊、小銅疊等各數十件或上百件，袈裟、裙衫、坐具各一千件，另外還有麝香劑、沉香、甲香、甘鬆香、青木香、薰陸香共六百餘斤，畢缽、訶黎勒、胡椒、阿魏、石蜜、蔗糖等五百餘斤，蜂蜜十斛，甘蔗八十束……
軍船緩緩地開出大運河進入長江。鑒真稍微鬆了口氣。其他人員各自準備休息。
忽然，狂風大作，軍船猛烈搖晃。鑒真跌跌撞撞地跑到甲板上，隻見月光下麵，江麵寬闊，白浪滔滔，江水伴著陣陣濤聲向軍船不停地撞擊。
船員們竭盡全力與風浪作鬥爭。可是船卻被猛浪撞破，江水漏了進來，形勢越來越危險。鑒真鎮定自若，傳令大家立即全部下船，站在江灘上，等天亮後搶修海船。
大家扶著鑒真，找到江灘上一塊不大的蘆葦，讓大師坐下。誰知過了不久，潮水不斷上漲，江灘逐漸被淹沒下去，水位越來越高，大家隻好泡在齊腰深的水裏。
隆冬臘月，寒風凜冽，銀光下麵，江水滔滔。大家不但忍受著刺骨之寒，更麵臨著隨時被江水吞沒的危險。
鑒真雙手合十，口念觀音，鼓勵大家團結一致，和死神作鬥爭。
東方天際透出一絲微弱的晨光，漫漫寒夜總算熬了過來。江水逐漸回落，船員修好船，然後拖著疲憊麻木的身軀，再次爬上甲板。
早霞的光輝照得江麵一片金黃，一隻孤帆伴隨著東去的晨風，向長江口飄去。
那時，從長江口到日本的航道通常有三條：一是北上山東半島，渡黃海，沿朝鮮半島西海岸南下，到達九州；二是南行至浙江舟山群島，然後一直東航；三是經大盤山直指日本。三條航道，北路最安全，但航程較遠，當時來往船隻多取第二條航線。鑒真等人由於渡海心切，準備選擇路程最短但風浪較大的第三條航線。
鑒真一行乘坐的軍船很快便開出長江口，一望無際的大海呈現在眼前。眾人忘記了昨夜的遭遇，情緒又都高漲起來。
誰知船行到大板山附近，忽然又刮起了大風，海浪翻騰，船無法行進，又難以靠岸，不得不返航至大嶼山暫住。
那時，行船主要靠風力，所以一旦遇到逆風，就不能前進。鑒真他們在大嶼山等了一個月，才盼到順風，於是又揚帆東渡。一路上，風向不變，船行迅速。鑒真的臉上又露出了笑顏。普照、榮睿二人更是激情難耐，他們站在船頭，遙望祖國所在的東方，想著大唐高僧即將踏上那片土地，內心充滿喜悅。
“轟！”一聲巨響，船身猛烈震動，鑒真等人均倒在甲板上。
“不好了！船觸礁了！”船員大聲叫道。