對於20個樣本縣32個指標的聚類，方法上采用類間平均連鎖法（Between-groups linkage），在選擇距離測量技術上，采用相關係數距離（Pearson correlation）。
共有20例樣本進入聚類分析，采用相關係數測量技術。列出了各變量間的相關係數，這對於後麵選擇典型變量是十分有用的。類間平均連鎖法的合並進程。
可以看出類間平均連鎖法的合並進程。第一步，X28與X30被合並，它們之間的相關係數最大，為1．00，是完全相關關係，這因為在本課題中X28參合者住院實際補償比和X30大病補償額占住院費用總支出的比例實際是一個指標，故隻保留參合者住院實際補償比。第二步，X2與X3合並，其間相關係數為0．959。第三步，X26與X32合並，它們之間的相關係數為0．866，X26參合者住院受益率與X32參合者平均每百人住院人次是一個指標，二者分母都是參合總人數，分子分別是住院補償人次和住院總人次，實際上，隻要是住院的就是補償的，所以隻保留參合者住院受益率。第四步，X25與X31合並，其間相關係數為0．818，X25參合者門診受益率和X31參合者年人均門診人次合並為一個指標，實際調查證明，我們隻能得到門診補償總人次，而得不到參合者門診總人次，那些隻看門診而沒有補償的參合農民無法統計，因此隻保留參合者門診受益率。第五步，X20與X21，相關係數為0．757，反映了參合者對衛生資源的利用情況。第六步，X15與第五步的合並項被合並，其間相關係數為0．703。第七步，X4和X16，它們之間相關係數為0．676。第八步，X5和X6，X5人均籌資標準和X6個人籌資標準可歸為人均籌資標準一個指標……依次類推，第三十一步，X1與X7合並，這個相關係數最小，為-0．197。
從樹狀可以看出，指標X13，X18，X9和X23聚合成一類後再與其它類相合並，可從這4個指標中選擇一個典型指標做代表；指標X4、X16、X12和X17聚合成一類，可從這4個指標中選擇一個典型指標做代表。按下式計算每一變量與其餘變量的相關指數（即相關係數的平方），把該值最大的變量作為典型指標。
綜合3種方法篩選的結果，得到最終13項指標，並組成評價體係。其中，專家谘詢法是在論述指標重要性和可操作性基礎上從主觀經驗角度篩選出指標18個，離散趨勢法是從敏感性角度考慮能否將指標區分開，篩選指標28個，而指標聚類分析法從代表性方麵將指標收斂為23個；同時考慮到樣本量大小、指標較多和指標間內在相關性，為保證計算過程能夠收斂，在篩選指標時，每方麵單獨篩選後聯合篩選，都用專家谘詢法、離散趨勢法和指標聚類分析法3種方法從不同角度進行篩選，篩選出三種方法共有的指標15個。需要進一步闡釋的是，合作醫療統籌基金支付比與結存率是同一個指標兩個方麵，所以隻保留基金結存率，大病補償額占住院費用總支出的比例實際就是參合者住院實際補償比，故隻保留參合者住院實際補償比。結合合作醫療具體情況和專家谘詢意見，考慮到受益率與補償比之間關係，對於參合者受益率、參合者門診受益率和參合者住院受益率3個指標以參合者受益率來代表，所以最終確定的指標是13項。
根據權重得分，利用兩組均數等效檢驗法來驗證13項指標對34項指標的代表性。兩組均數等效性檢驗的原理是一組為對照組，另一組為試驗組，假定其總體均數分別為UT和UC，兩組比較的等效臨界值為。在進行等效性檢驗之前，首先肯定的是，經過大量的文獻複習和上述三種方法的聯合篩選，13項指標和34項指標對評價合作醫療都有意義。然後進行差值與0的差異性檢驗，P＜0．001，統計學檢驗亦認為13項指標和34項指標對評價合作醫療都意義。在此基礎上考慮進行等效性檢驗。其中，標準誤，根據上式計算合並方差和標準誤，S=4980．21，=15748．81，取=S/2=2490．11，=0．05，進行等效性檢驗。t=12．36，P＜0．05，以=S/2=2490．11作為等效臨界值，認為兩法等效。也就是說，13項指標和34項指標對評價合作醫療都有代表性意義，13項指標能夠代表34項指標信息。
第六節 合作醫療代表性指標的分析
本次調查，對於原有的34個指標，從指標的可操作性、敏感性、獨立性、相關性和代表性等方麵考慮，應用專家谘詢法、離散趨勢法和指標聚類分析法篩選出了最終指標13個。表10是某省20個試點縣中首批7個試點縣的13項指標的調查結果。
1．基金籌集與使用
基金籌集與使用共4個指標，籌資率、各級財政補助占總籌資的比例、人均籌資標準和合作醫療基金結存率。充足適量的基金是保證合作醫療實施的基礎。新型農村合作醫療其中一個顯著的特點是增加了各級財政的投入，而參合農民的心理，很大程度上看國家投入多少，他們個人才投入多少，他們很大程度是在和國家這塊蛋糕做比較，因此必須用各級財政投入的比例來保證農民加入合作醫療的可靠性，同時，使用籌資率指標也衡量出了參合農民個人上繳基金的情況；人均籌資標準反映出了各級政府和參合農民的經濟承擔能力；基金的結存率反映了資金的整體運營情況，這一指標更敏感的反映了資金的結餘情況。