漂洗外種皮時，注意不要使汙水流進溝河、水井，以免汙染環境。
可將汙水潑到地裏和銀杏樹下，亦可埋在銀杏樹周圍，既可殺死地下害蟲，抑製一些病菌的繁衍，又能對白果樹起到鬆土施肥的效果。隨著科學的進步，有關科研單位正在對銀杏外種皮利用進行研究，開發生物農藥，變廢為寶，造福人類。
在種實脫皮的過程中，由於多種原因，部分種核不很潔白，影響種核的商品價值，需進行漂白處理。常用的漂白方法有兩種：
①漂白粉清液浸洗：配製1％的漂白粉清液，將除去外種皮的白果倒入配製好的漂白粉清液中，立即攪動5～6分鍾，骨質中種皮變為白色即可撈出，然後用清水衝洗，至不留藥跡味為止，立即攤放在陰涼通風處晾幹。每千克漂白粉可漂白100kg白果。白果撈出後再加0.5kg漂白粉，可再漂白100kg白果，這樣連續5～6次後即需換水，重新配製溶液。
②熏蒸：將洗淨後的銀杏種核攤放在涼席上，晾幹附著水，再放入缸中，數量約占缸容積的2／3。在白果中間點燃一酒盎硫黃，封住缸口，密閉30～40分鍾後打開封口，中種皮即會潔白如玉。
3.貯藏
貯藏的目的是使上市供應的時間延長，又不會因種子的生命活動而降低種子的商品質量，不降低種子的發芽率。貯藏的方法有：
（1）室內地麵貯藏
選擇在陰涼的室內，最好是泥地，其次是水泥地。地麵先鋪10cm厚的種子，再鋪10cm厚的沙子，這樣一層沙一層白果地鋪（後邊用沙，每層隻需5cm厚）。也可以一份白果10份沙（重量比）的比例混合堆放，總高度以不超過60cm為宜。此法一般用於播種育苗。
（2）水藏
將白果浸入清水池或水缸中，並經常注意換水。此法貯藏期可達4～5個月，隻適宜少量種子保存使用。
（3）冷藏
將百果裝入麻袋和竹籮中，放在冷庫內，溫度保持在1～3℃，每隔10～15天根據幹濕情況噴一次水。此法貯藏期可達6個月，適用於大批量貯存。