謝裏曼發現的公開，頓時引起一場軒然大波。土耳其政府極其憤怒地要求歸還這批藏寶；全世界的考古學家瑟學者強烈要求展覽這個稀世發現；在普通人心目中，謝裏曼這位尋寶人一夜間成了大英雄。然而，普裏阿摩斯寶藏卻給謝裏曼帶來了麻煩。他沒有向土耳其道歉，沒有請他們原諒他沒有履行給土耳其“一半”的諾言。因為在那個時期，歐洲的考古學家也在埃及與近東大肆掠奪地下寶藏，這已成了一種司空見慣的作法。許多考古學家還因這樣做成了百萬富翁而沾沾自喜。但是令謝裏曼感到失望的是，希臘政府在土耳其人壓力下，拒絕接受這批藏寶。最後，謝裏曼隻有把它們送到德國，存放在柏林一家國立博物館中。土耳其政府發誓要找他算賬，他也不想受到嚴厲懲罰，因而賠償了土耳其政府要求得到的五倍罰金。
特洛伊黃金寶藏的發現，雖然舉世矚目，但也僅僅是謝裏曼考古生涯中的一個片段。他一直在指導西沙裏克的發掘，直到1890年去世。19世紀70年代中期，他還開掘了一個稱為邁錫尼的古希臘遺址——傳說是征服特洛伊的希臘聯軍統帥阿伽農國王的故鄉。在那裏，謝裏曼發現了又一個，甚至是更有價值的寶藏——“皇家墓地”，其中有金飾點綴的遺骸，有男有女、有老有少，許許多多的遺骸！其中一個男性骷髏還戴著一付黃金麵罩。謝裏曼帶著自豪而又敬畏的心情寫道：“我凝視著阿伽門農的那張臉，許久！許久！”
現在看來：謝裏曼是錯認了阿伽門農。在邁錫尼發現的墓地可追溯到公元前1600年。而如果確有阿伽門農這位國王，則他所處的年代要遠遠靠後，即特洛伊戰爭年代，大約公元前1250年前後。然而，謝裏曼在邁錫尼的發現卻是古希臘文明興起之前數世紀頂峰文化的首例確切證據。正如學者們在讚揚謝裏曼考古發掘時所指出的那樣：邁錫尼文化從大約公元前1600年至1050年，一直主宰著愛琴海地區，公元前14世紀和13世紀，在邁錫尼人的全盛時期，他們居住和往來貿易的足跡遍及希臘、克裏特、愛琴海諸島、土耳其沿岸，以及意大利南部。大約公元前11世紀，邁錫尼帝國瓦解。當地人與來自北方的部落混合而建立了希臘文明，在8世紀時，處於全盛時期。古希臘的語言、文學和宗教保存了邁錫尼文化的許多成分，包括關於戰爭和國王的傳奇，這些都成為特洛伊戰爭傳奇故事的素材。
謝裏曼也誤認了特洛伊。“普裏阿摩斯主藏”發掘的地層，據現代考古學家推斷，形成於公元前2500年至前2200年；這比傳奇中的特洛伊戰爭年代要早1000年。匆匆忙忙一下挖到遺址的最底層——謝裏曼認為的特洛伊所在地——勢必大大超過了荷馬史詩中的特洛伊的真正所在地層。這可真是太傻了！
推算各地層所屬年代的主要權威，是威廉.多樸菲爾德，他在1882年被謝裏曼雇用來監督發掘工程進展。據他斷言：從最下層的最古老的特洛伊Ⅰ，向上數到最上層的新近地層特洛伊Ⅰ，整個廢墟遺址由9個不同地層構成。其中特洛伊Ⅱ就是謝裏曼認為是荷馬史詩中提到的特洛伊所在的地層。但威廉認為，真正的遺址比謝裏曼在此之前估計的要古老的多；而且，荷馬史詩中早已描述過的特洛伊，即公元前13世紀的特洛伊，會在新近得多的地層，即特洛伊Ⅵ中找到，雖然謝裏曼大為吃驚，但他最後還是接受了威廉耐心收集的證據，認為有這樣的可能性，即他所發現的寶藏可能不屬於普裏阿摩斯國王。在他去世之前，他承認：他所發現的藝術珍品可能比普裏阿摩斯在位的年代要早1000年。
在謝裏曼去世後，威廉在西沙裏克遺址上繼續探察，並成功定位了特洛伊Ⅵ的部分遺跡。這是謝裏曼的民工尚未破壞掉的部分。
他發現了一堵大型石牆，找到了特洛伊Ⅵ早已被燒毀的證據。威廉宣告，這才是“真正的”特洛伊。現代考古學家已經證實了他對年代的推算，即：特洛伊Ⅰ可追溯到大約公元前3000年；特洛伊Ⅱ（謝裏曼認為的特洛伊），公元前2500年至前2200年；特洛伊Ⅵ，公元前13世紀（《伊裏亞特》史詩中所描述的年代）；特洛伊Ⅷ，亞曆山大大帝在公元前4世紀所來到的這座希臘城市；特洛伊Ⅸ，最上地層，是古羅馬的新特洛伊（新伊利昂）城。