（1）改變管理組織
隨著數字化時代的來臨，因特網從根本上改變了傳統消費者與生產廠家之間的關係，因此，一種新型的企業組織形式——電子公司應運而生。這是一種因信息技術的進步給全球經營活動帶來深刻而迅速變化而形成的新型組織。電子公司利用因特網進入市場和接觸客戶，還把計算機、因特網和十分複雜的企業軟件程序結合起來，用於公司的一切運營活動。因特網電子商務將以更為深刻的方式改變消費者與生產廠家之間的關係。因此有人說，電子公司正在建立一種新的商務秩序。
電子商務和縱橫交錯的計算機網絡改革了信息傳遞方式，使其由階層型變為水平型，最重要的改變和發展將體現在企業經營和管理方式上，由原來從上至下的垂直結構，即由中央到地方、從董事長到班長級方式，正在向水平型的開放式結構轉變，與信息傳遞方式緊密相依的管理組織結構也從金字塔型變成矩陣型。原來起上傳下達重要作用的中層組織逐漸消失，高層決策者可以與基層執行者直接聯係，基層執行者也可以根據實際情況及時進行決策。分工細化的管理組織已不能適應電子商務發展的需要，把相互關聯的管理組織加以整合已成為大勢所趨。
（2）增強管理功能
電子商務正在成為企業管理和政府管理的戰略手段。現代計算機信息網絡的功能已不隻是簡單地提高管理效率，而且還將通過管理的科學化和民主化，全麵增強管理功能。由於它是積極地促進管理業務的合理重組，進一步綜合集成各種聯係的管理職能，從而使管理工作的麵目得到了根本的改觀。電子商務把報關、審單、征稅、核銷、查驗、放行等進出口貿易通過海關的各個環節整合在一起，從管理模式上加以革新。
（3）革新管理思想
電子商務時代盛行多種新的管理思想。如“企業再造工程”的思想主張重新設計管理業務流程；開展電子商務的“虛擬企業”的思想主張為順應日益動蕩的市場形勢，應盡快抓住市場機遇，由不同企業為某一特定任務組織靈活的聯合性企業；“學習型組織”的思想主張企業需進行自我調整和改造，以適應調整、變化的環境，求得有效的生存和發展……這些管理思想都同電子商務的出現和發展相聯係。
（4）完善管理方法
管理方法以管理目標為轉移，而管理目標由社會和經濟發展的需要所決定。現代電子商務的發展，將促進政府與企業革新管理方法，如政府管理會越來越把重點放在跨部門、跨地區、關係到社會經濟發展全局的重大工作上，逐步減少企業向政府填送報表的負擔；企業管理會更注重於職工的培訓和學習，以協調職工的整體行動。
（5）大幅度降低企業管理成本
企業開展電子商務可以大大降低企業管理成本，而且更為有效。尤其當企業不斷發展壯大時，企業管理成本降低的幅度就更為明顯。
（6）實施安全、準確、高效的企業管理
企業開展電子商務可以使企業的管理更加安全、準確和高效，充分適應激烈的市場競爭需要。通過網絡，企業的領導人可以隨時了解各部門、各分公司的經營彙總全貌，運籌帷幄，並迅速把有關指示和工作安排下發到下屬各部門、各分公司。各部門、各分公司每天的經營情況，包括財務、物資報表（例如出庫單、入庫單）等，通過網絡準確、自動地彙總到總公司的數據庫中（無需總公司財務、物資部門人員手工再次輸入），實現企業內部數據彙總的自動化。各部門、各分公司也可通過因特網隨時查詢總公司的相應數據庫（例如了解產品的生產、庫存等情況），而無需另外通過電話、傳真方式詢問，從而可以提高整個企業的辦公效率。