植物園中的植物養護所需水源來自於三個方麵。
一、自然降水
該區域的年平均降水量為737毫米，年平均相對濕度71％，基本能滿足大部分植物的生長需求。
二、乳子湖與思源湖的蓄水
兩湖的蓄水可為植物園提供豐富的灌溉用水及其他園務管理用水。建設給水管道將水運送到植物園的蓄水池中。
三、校園中水
校園中水以給水管道沿杏壇南路運送至植物園上部蓄水池中。
通過三方麵供水，滿足植物園區需要。
植物園中排水以自然排水與暗渠排水相結合為主的方式，充分利用現狀地形中的衝溝，加設必要的排水管道，減少水土流失，並在保障乳子湖與思源湖水位的基礎上，滿足正常的排水泄洪要求。