1.猝倒病、立枯病
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蔬果病蟲害的防治，按照其應用技術和作用原則的不同，可歸納為植物檢疫、農業防治、生物防治、物理防治和化學防治等五個方麵。
猝倒病和立枯病為西瓜苗期的主要病害。猝倒病：苗期根頸部呈水漬狀病斑，而後病部變褐色，幼苗近地麵處明顯縊縮而倒伏。土壤溫度低、濕度大時有利於病菌生長繁殖，所以一般夜晚涼爽、白天光照不足，苗床濕度大時發病重。立枯病：早春苗床內與猝倒病相伴發生。
防治方法：發病初期，可選用綠乳銅乳油600～800倍液噴霧，或用1:500倍敵克鬆灌溉，控製發病中心。
2.枯萎病
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選用抗病品種是無公害西瓜生產中的關鍵措施。
典型症狀是萎蔫，一般在西瓜開花結果期即在田間陸續出現。發病嚴重的莖蔓基部出現縱裂，表麵產生粉紅色的膠狀物和白色菌絲層，葉片表現萎蔫後即在1～2日內整株死亡。死亡時葉片仍保持綠色不發黃，呈青枯狀。將病莖基部切開檢視，其維管束變褐色。
防治方法：①輪作，與非瓜類作物實行3年以上的輪作。②嫁接栽培防病，方法見西瓜嫁接栽培技術。③增施腐熟有機肥料，生育期避免傷根和傷蔓，並注意防治線蟲。④發現病株，要在病株根周圍撒石灰消毒，對重病株要及時拔除深埋。⑤發病初期用多菌靈、治萎靈、絡氨銅水劑、抗枯靈等藥500～800倍液，綠亨一號3 000倍液灌根2～3次。
3.疫病
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綜合防治的策略有：重視生態係統本身的自然規律；強調防治措施的選擇和協調；提倡學會與有害生物共存；強調綜合效益，反對片麵追求經濟效益。
在西瓜植株的各個生長期和各個部位都有發生。被害幼苗初期莖基部呈暗綠色水漬狀，逐漸縊縮，生長點及嫩葉迅速萎蔫，不久幼苗呈青枯狀。果實發病多從花蒂開始，初期發病部位呈暗綠色水漬狀凹陷，潮濕時病部長滿白黴，病果皺縮，隨之腐爛並伴有腥味。
防治方法：可用70%可殺得1 000倍液，或72%克露可濕性粉劑700倍液，或72.2%普力克水劑800倍液，或64%殺毒礬可濕性粉劑500倍液噴霧，隔7～10天1次，連續防治3～4次。必要時采用噴灑與灌根同時進行，防效明顯提高。
4.炭疽病
在西瓜植株的葉、蔓、果實等部位均可發生，以葉片和瓜蔓為主。主要症狀為：葉片和果實初為水漬狀病斑，後病斑變黑，嚴重時病斑連片以致腐爛。
防治方法：可選用75%百菌清可濕性粉劑500倍液、65%代森鋅可濕性粉劑600倍液噴霧防治。
5.葉枯病
主要危害葉片，多發生在葉緣或葉脈間。初為水漬狀小點，在高濕下迅速合並、滲透，使葉片失水青枯。天氣潮濕時，可合並成大褐斑，病斑變薄，嚴重時引起葉枯。
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防治方法：①采用種子消毒，輪作，合理密植，加強通風透光，增施磷鉀肥和有機肥料等綜合措施。②藥劑防治。可噴施50%撲海因1 000倍液，或70%甲霜靈錳鋅或70%乙磷鋁錳鋅可濕性粉劑500倍液，或72%克露可濕性粉劑或72.2%普力克水劑800倍液，或1:1：200波爾多液；或用5%百菌清粉塵劑或5%萬黴靈粉塵劑每50米長的溫室500克噴粉；或用25%百菌清煙霧劑或20%速克靈煙霧劑，每50米溫室150～200克，點燃熏蒸7～8小時。