我國的改革開放之於林繼宗，猶如東風催駿馬。他審時度勢，勇於開拓，建章立製，創造性地開展工作，探索加強黨的建設和思想政治工作新路子。他結合港口實際，與有關部門一起製訂了《紀委會工作製度》、《工會工作製度》、《組織處工作製度》、《宣傳處工作製度》等9個政治工作製度，規範了每個政工人員的崗位職責，建立了從黨委書記到黨小組長、從處長到基層專兼職幹事的政工網絡機製；協助黨委製訂了汕頭港務局思想政治工作製度、中心組學習製度、“一幫一”製度等二十多項關於黨的建設和精神文明建設的製度和規定，使各項工作有章可循、相互配套，提高了黨的建設和思想政治工作係統化、規範化、製度化水平。
他力促在全港範圍內弘揚“勤奮高效，實幹興港”創業精神，把思想政治工作落實到三個支點（職工綜合素質的提高，良好企業形象的樹立，為船方貨主提供優質服務）、四個層次（決策層、管理層、執行層、操作層）、五個環節（規劃、機製、網絡、活動、硬件）上。並提出了在市場經濟條件下堅持“六抓”的思想政治工作新視野，即“上抓班子，下抓班組；內抓現場，外抓市場；先抓穩定，後抓發展”。推行以人為本與以製度為基礎相結合的教育管理活動，倡導開展港情教育、素質教育、管理教育活動，結合企業各個時期工作目標和任務，每年研究提出具體內容，編寫港情教育資料，有針對性地開展思想政治工作。他參與製定了《汕頭港務集團公司精神文明建設“十五”規劃》等精神文明建設長遠規劃，同時每季度又製訂黨建和宣傳工作意見，每月召開一次政工例會，檢查各項工作落實情況，部署下個月工作，使思想政治工作做到長規劃、短安排、嚴考核、抓落實，他推行P（計劃）、D（實施）、C（檢查）、A（改進）工作程序與方法，取得了顯著效果。把創建文明港口、“三學”（單位學青島港、集體學華銅海、個人學包起帆）活動日常化，並根據不同時期的要求，每年開展一個主題係列活動，1994至2004年分別開展了“個人學包起帆、單位學青島港”、“三愛”（愛國、愛港、愛崗）、弘揚“勤奮高效、實幹興港”創業精神、“滿意在港口”、“文明優質，服務一流”、“增創新優勢、迎接新世紀”、“唯實、唯新、唯優、唯信”、“自信、自立、自強”、“依法治港與以德治港相結合”、“務實創新，與時俱進”、“深化改革，開源節流”係列活動，使思想政治工作載體化、係統化、寓教於樂。使全年黨的工作和精神文明建設工作由一條主線串聯起來，突出一個主題，有條不紊，有效開展。
潛心改革發展港口
1992年，林繼宗擔任黨委副書記，此時港務局由於曆史的種種原因，起步慢，基礎設施差，全局8個生產單位，竟有5個單位虧損。職工收入低，住房也非常困難，加之港風不正，管理不善，職工隊伍不穩定，服務質量、企業形象較差，港口千頭萬緒，關係要理順，港風要整治，結構要優化。林繼宗為之憂心忡忡，塊壘在胸，但他沒有因此而沮喪。相反，憑著滿腔熱血大幹一場。