當潛水員浮上水麵時，偶然碰翻了一塊浮塊，這一被弄翻的浮冰塊卻使在場的全體考察人員大吃一驚：他們發現這塊30厘米厚的浮冰下半部分呈鮮豔的綠寶石顏色。接著，研究人員又連續翻開幾塊浮冰，結果它們的下半部都呈鮮豔的綠寶石顏色。可是，當研究人員把湖麵其他地方的冰砸碎幾塊後，卻沒有發現這種顏色。
於是，研究人員把幾塊“綠寶石”冰塊運到聖彼德堡一個實驗室進行研究，專家們對其化驗和分析後得出結論：這些融化的“綠寶石”冰水中所含的某些成分是無法解釋它們為什麼具有這種綠色的。
然而，這還並不是未解之謎的全部。潛水員確認，散落到湖底的泥土量遠遠少於挖成此坑應有的土方量。況且，無論在大土坑周圍還是在冰洞周圍，連一點兒泥土也沒發現，那麼，從坑裏取出的絕大部分泥土到哪裏去了呢？難道它們不翼而飛【不翼而飛：比喻東西突然不見了。】了？
關於大土坑是隕石留下的推斷遭遇到聖彼德堡天文學家的駁【駁：bó。】斥。為此，專家們又重返出事地點進行第二次考察和研究，終於得出無可置疑的結論：這個撞擊地麵的不明飛行物不可能是隕石。其理由是，第一，假如是墜落的隕石，它必然隕落後在地上留下隕石坑，這個長寬尺寸規整的長方形溝塹無論如何也不能說成是隕石坑吧！而且，其形成角度更加排除了與隕星有關的可能；第二，隕石墜落後的地上形成的隕石坑約是其隕石大小的2～5倍，甚至連1千克重的隕石對天文學家來說都是一次矚目事件。假定這個大土坑是隕石墜落後形成的，那麼在現代化觀測技術和手段十分發達和完善的今天，如此之大的隕石隕落都發現不了——這怎麼可能呢？然而，科學家對那個大土坑的多次仔細和研究證明，那裏絲毫沒有隕石隕落後留下的熔化痕跡。況且，隕星隕落時，絕對應產生易辨的視聽效應。然而，發生這次事件時，卻絲毫沒有聽見隕星隕落時產生的那種視聽效應。因此，對這一事件徹底排除了隕星的可能性。
還有人推斷，這是美國製造的一種專門用於超低空飛行的間諜【間諜（dié）：被敵方或外國派遣、收買，從事刺探軍事情報、國家機密或進行顛覆活動的人。】飛機，由於它超低空飛行，所以不能被雷達發現。然而，這一推斷更引起人們的嘲笑，因為航空專家認為，到目前為止，地球上還沒有這樣先進的飛行器——能以如此神奇的巨大力量“轟”地一下撞到凍土地上，然後還能繼續飛行，而且任何部件都完好無損。
那麼，這究竟是什麼東西造成的大土坑呢？俄羅斯著名超自然現象專家弗·基澤爾認為，這是一個來自地外的探測器，它完成正常考察——取完地球土樣後便悄然離去。
後來，又有幾個考察隊先後考察了這個大土坑。在1979年的一次考察中，研究人員對這個地方進行了磁強測定等考察，但毫無新結果，而考察隊員們的惟一新發現是，那個大土坑裏竟長出繁茂的植物，盡管大土坑周圍幾乎沒有任何植物。另外，在離大土坑100米處還發現了另一個土坑，奇怪的是，還從未發現有人為了某種用途在這裏從事這種土方作業。這一新發現的土坑周圍也是什麼植物也沒有，而坑裏卻長出了一小叢茂密的小樹。
俄羅斯科爾普湖之謎迄今懸而未解【懸而未解：沒有被解開。】。