海盜的“母艦”外形像普通的漁船，這樣很容易迷惑打擊海盜的海軍力量，它們完全避開索馬裏海岸，前往其他國家的海港停靠和補給。聯合國秘書長潘基文在發布的一份報告中不得不承認，從軍事能力和資源供給方麵看，這些海盜組織已成為索馬裏當局的勁敵。
索馬裏海盜不僅組織嚴密，而且事實證明，他們對於戰略環境的改變有相當強的適應能力。海盜並沒有被國際社會派往該海域的海軍力量所嚇倒，相反，他們改變了自己的行動策略，將活動區域轉移到海軍巡邏較少的地方，在越來越遠離海岸的地方發動襲擊。像美國籍貨船“馬士基亞拉巴馬”號就是在索馬裏海岸東南約240海裏的地方遭到襲擊的。
從曆史上看，海盜曾是一種投機的犯罪，自從索馬裏中央政府1991年崩潰以來，索馬裏長期處於無政府狀態，這給海盜的猖獗提供了良好條件。在這個國家裏，形形色色的人都成為海盜政治經濟的利益相關者。為了能在最終的贖金中分得一杯羹，索馬裏富有的商人們不僅為海盜購買裝備和艦船提供資金，還幫助他們招募人員。
在各港口，探子傳來商船的船員、貨物、路線和防禦手段等信息，海盜們從中挑選目標並製定攔截方案。
一旦某艘船被劫持並帶到海盜基地，海盜就會和船主代表及保險公司代表展開談判，最終就贖金達成一致。目前一般的贖金金額是大約100萬美元，這些贖金必須由雙方認可的調解人直接送到被劫持的船上，調解人一般是專業的安全顧問。
如果能找到證據，海盜的資助人將是法律懲罰的首要目標。船主和保險公司也負有一定的責任，因為他們支付的贖金刺激了越來越多的索馬裏人開始從事職業海盜犯罪。
其他一些幕後受益者包括索馬裏北部的自治地區邦特蘭政府和伊斯蘭武裝組織青年會，該組織與基地組織有關聯，後來被美國國務院正式列為“外國恐怖主義組織”。這兩個受益者放縱海盜在他們的控製範圍內活動，以此為交換條件，獲取海盜的一部分收益。這也許能作為打擊海盜的一個絕佳機會，因為在《國際法》（比如《聯合國反腐敗公約》）以及美國國內立法（比如《反海外腐敗法》）或者其他有關支持恐怖主義罪行的法律規定下，交付或接受贖金都是被禁止的。
打擊海盜集團需要加強當地的政治和安全力量建設，這樣才能遏製海盜橫行的區域的擴大。具體策略是，或許可以在非洲聯盟或區域性組織的牽頭下，發展海岸警衛力量，加強海岸巡邏力度。經過一段時間後，海岸警衛也許能掌握打擊海盜網絡有用的信息和手段。畢竟，當地的海岸巡邏比世界各國派遣軍艦來此更具有持續性的作用。
當然，毫無疑問，要應對仍在發展的海盜活動和遏製潛在的海上搶劫事件，像美國營救菲利普斯船長時出動的強大軍事力量是必不可少的。此外，各國派往此地的海軍還需要更好地協作。
說到底，海盜現象遠比任何海軍巡邏複雜得多，徹底將海盜從索馬裏根除需要的也不僅僅是申請派遣更多軍隊。
目前，國際輿論已就反海盜達成一致：若想讓海洋航線安全的話，必須摧毀索馬裏海盜的內陸支持。那麼，美軍為何沒采取進一步行動呢？美國官員對於進入索馬裏內陸的任何方案都十分謹慎。因為若想要行動順利，必須得到索馬裏人民的支持，而現在當地人顯然不希望別國軍隊來幹涉內政。再加上自1991年以來，索馬裏一直處於武裝割據狀態，目前國內情況也比較複雜。
還有一個現實情況是：索馬裏海盜不是一個簡單的目標，他們絕不會像薩達姆的軍隊那樣正麵應戰。