洪武二年（公元1369）奉元、鳳翔、臨兆相繼下，李思齊降。常遇春克開平，元帝奔和林。常遇春卒於軍。元軍攻大同，李文忠敗之。徐達下慶陽。元璋定內侍官製，編《祖訓錄》，定諸王封建之製。
洪武三年（公元1370）命徐達李文忠等分道北征。李文忠獲順帝孫以歸，元嗣君北遁。元璋分封諸王，賜爵功臣。
洪武四年（公元1371）命湯和、廖永忠率舟師由東路入川，傅友德率步騎由秦隴取蜀。傅軍連下階州、文州、隆州、綿州。廖永忠克夔州，明升出降，夏亡。元平章劉益以遼東降。
洪武五年（公元1372）命徐達為征虜大將軍，出雁門，趨和林，李文忠趨應昌，馮勝取甘肅，征擴廓帖木爾。徐達為擴廓所敗。命鄧愈征土蕃。詔以農桑，學校課有司。
洪武六年（公元1373）頒《昭鑒錄》，訓誡諸王。擴廓犯大同，徐達遣將敗之。頒定《大明律》。
洪武七年（公元1374）李文忠藍玉大敗元兵。遣元順帝孫北歸。
洪武八年（公元1375）詔天下立社學。
洪武十年（公元1377）以羽林等衛軍益秦、晉、燕三府護衛。鄧愈、沐英討吐藩，大破之。命大小政事先啟太子裁決。
洪武十三年（公元1380）左丞相胡惟庸以擅權誅，坐其黨，死者甚眾。廢中書省及丞相等官，提高六部官秩。改大都督府為中左右前後五軍都督府。燕王棣到封國北平就王。安置宋濂於茂州，死於道。
洪武十四年（公元1381）命傅友德、沐英、藍玉征雲南。傅友德敗元兵於白石江，遂下曲靖，元梁王自殺，雲南平。
洪武十五年（公元1382）藍玉沐英克大理，分兵攻鶴慶、麗江、金鹵俱下。馬皇後卒。置殿閣大學士。空印案發，株連死者數萬。
洪武十六年（公元1383）召征南師回京，沐英留守雲南。
洪武十七年（公元1384）曹國公李文忠被毒死。禁內官預政，敕戒諸司不得與內官公文往來。
洪武十八年（公元1385）魏國公徐達中毒死。戶部侍郎郭桓坐盜官糧被誅，死者數萬。
洪武二十年（公元1387）馮勝、傅友、德藍玉同征納哈出。馮率師出鬆亭關，下大寧寬河會州富峪四城，納哈出降，東北平。
洪武廿三年（公元1390）晉王棢、燕王棣率師征元，穎國公傅友德等皆從其節製。齊王率師從征，燕王師次迤都，元丞相咬柱等降。韓國公李善長因胡惟庸案發，坐誅，牽連死者甚眾。作《昭示奸黨錄》，布告天下。
洪武廿四年（公元1391）天下郡縣賦役黃冊成。八月皇太子巡撫陝西，十一月還京師。
洪武廿五年（公元1392）皇太子標死，立長孫允炆為皇太孫。沐英卒於雲南。子沐春襲封西平侯，鎮雲南。
洪武廿六年（公元1393）涼國公藍玉被殺，功臣死者甚眾。馮勝、傅友德備邊北平。其屬衛將校悉聽晉王燕王節製。詔二王軍務大者始以聞。
洪武廿七年（公元1394）穎國公傅友德坐誅。
洪武廿八年（公元1395）諭群臣茲後不得法外用刑；嗣居不許置丞相；皇親唯謀逆不赦，餘罪宗親會議取上裁，法司隻許舉奏，不得擅逮，勒諸典章，永為遵守。八月，秦王樉死。頒皇明祖訓條章，後世有言更祖製者以奸臣論。
洪武卅一年（公元1398）二月晉王棢死。閏五月，元璋卒，終年七十一歲。太孫允炆繼位。