老驥伏櫪，壯心不已。我想再研究10年，一係法超級稻肯定能成功，我還要為這個目標奮鬥。——袁隆平
袁隆平是“雜交水稻之父”，他在遺傳育種方麵開展的卓有成效的研究，使得中國雜交水稻在產業上形成了很強的優勢，解決了我國的糧食生產安全問題，不僅中國人民受益，外國人民也受益，特別是發展中國家的人民受益匪淺。中國科學院基因組生物信息學中心開展的中國水稻（秈稻）基因組研究，則是在分子水平開展工作，且要在整體上破譯水稻的生命信息，為今後提高水稻的產量，特別是改善水稻的品質，奠定一個良好的基礎。——（中國科學院副院長）陳竺
超級稻的技術路線
早在1980年，日本最先提出了“超級雜交水稻”的計劃。1989年，國際水稻研究所也提出了“超級稻”的概念。他們經過十多年的摸索，在實驗中沒能取得突破。袁隆平認為，那是技術路線失當，他想找到一條新的超級稻育種途徑和理想模式。
實際上，從1985年開始，袁隆平已經在思考和尋找“超級稻”的育種辦法了。1998年，他提出了中國超級稻的具體實施計劃，分為兩個階段進行。第一期目標是2000年實現大麵積試種達到平均畝產700公斤。第二期目標計劃在2005年實現，使大麵積水稻試種畝產達到800公斤。超級稻計劃完成後，中國每年將增產稻穀3000多萬噸。
袁隆平充分發揮了自己田間實驗積累的豐富經驗，選取培矮64S/E32為實例，提出了增源為核心，選育葉片長、直、窄、凹、厚，冠層高而重心低的超級稻優良株葉形態模式。這個模式抓住了水稻植株的葉片，用袁隆平的話來說是“葉裏藏金”。
他選擇的技術路線是“三個利用”，即：利用亞種間雜種優勢；利用野生稻中的增產基因；利用新株型超級稻配組。
利用野生稻的增產基因，必須通過基因轉移的分子生物工程技術。但是，建立一個生物分子實驗室需要將近4000萬元人民幣，這是一筆巨大的資金。
為了盡快地啟動這項研究，袁隆平采用了“借雞下蛋”的辦法。他讓在國外留學的學生帶著課題任務，充分利用外國先進的科研設備，進行實驗和研究。1995年，他的學生肖金華、李繼明在美國康乃爾大學坦科裏斯實驗室，從馬來西亞野生稻中發現了兩個重要的QTL基因位點，據測定，每個基因位點具有比三係高產雜交組合威優64增產18%的效應。
所謂QTL基因，就是數量性狀基因。它是有利的增產基因，也包含著某些不利基因，性狀不夠穩定。
肖金華、李繼明發現的兩個基因位點送回國內後，需要采用分子生物工程技術把不利基因剝離去掉，再把純有利的基因定位、克隆出來，轉入到其他水稻中去，從而達到增產的目的。這些工作步驟不便在國外進行，所以要籌措巨額資金，用來購置高技術設備，完成後麵的工作。
受到這次“借雞下蛋”的啟發，袁隆平將開展更大範圍的高技術合作。
田間實驗和示範種植在緊張地同步進行，形勢喜人——
2000年，湖南湘西龍山縣千畝超級雜交稻示範田突破平均畝產700公斤大關，達到超級雜交稻第一期目標，標誌著我國在這一領域的研究走在了世界前列。
2001年，浙江金華市武義縣種植超級稻3.2萬畝，畝產超過700公斤，與其他同熟期晚稻相比每畝增產150公斤以上。
這年，湖南郴州超級雜交稻百畝示範田的141.5畝示範田，平均畝產達到777.8公斤。
收割季節，袁隆平來到武義縣南湖畈村，隻見千畝超級稻示範田裏稻浪翻滾，一派豐收景象。他信手摘了一個稻穗數了數：337粒。他指了指一塊已收割完的田，問一個正在幹活的農民：“這塊田收了多少稻穀？”這個農民回答說：“這塊田麵積是0.8畝，實收畝產721.8公斤。”袁隆平聽後，露出了滿意的笑容。
中國超級雜交稻的成果引起了國外的廣泛關注，美國《科學》雜誌發表文章說，超級雜交稻在中國獲得成功，是解決未來世界糧食問題的有效途徑。
袁隆平對在2005年完成的第二期目標，即實現大麵積試種平均畝產達到800公斤充滿信心。第二期目標計劃進展順利，雲南永勝縣小麵積示範栽培創造了畝產1138公斤的超高產紀錄。在他的構想中，超級稻計劃不僅要實現水稻單產量的大幅度提高，還要做到水稻品質的優化，實現高產與優質的結合。
破解超級稻的基因秘密
袁隆平與楊煥明、於軍、汪建、劉思奇等人領導的中科院遺傳所人類基因組中心進行合作，於2000年啟動了超級稻計劃的“姊妹計劃”——水稻基因組測序和重要農藝性狀功能基因組研究，將在完成中國的超級水稻基因組測序的基礎上，全麵開展超級雜交稻的基因研究，在分子層麵探索超級稻的秘密，確保中國水稻高產、優質、持續創新的能力。
中科院為什麼選擇袁隆平先生的超級水稻作為研究目標呢？2000年4月初，美國最大的基因工程公司孟山都公司宣布，他們做完了水稻的基因組測序，但他們做的是粳稻。日本有一個多國參加的國際水稻基因總計劃，做的也是粳稻。而袁隆平的超級水稻是秈稻，是雜交出來的。
粳稻和秈稻的差別是很大的，從粳稻與秈稻來比較，秈稻表現出更多的雜交優勢，而且本身也是中國的一個特色，是真正的中國特色。