131I的治療量對男女生殖器官影響很小，所以甲亢經131I治療後不會影響生育能力，所生育的後代早產兒、死胎及先天畸形的發生率也未見增加，不育症的發生率與正常人群無顯著差異。
盡管一次131I治療量的放射損害不及一次胃腸透視放射損傷大，有些學者還是進行了深入的研究，有人觀察131I治療的患者染色體有變異，但可以逐漸恢複正常。
因此，131I治療後增加基因突變和染色體畸形的危險性很低。但考慮到電離輻射的遠期效應及遺傳效應，須長期隨訪觀察才能得出正確結論。為了保障下一代和隔代子女的健康，臨床仍將妊娠期列為131I治療的禁忌症。