上午10時28分31秒：世界貿易中心北樓從上到下坍塌，在撞擊點以上的樓層無人生還。北樓之所以要比南樓晚倒塌，主要有三個原因：撞擊點較高、飛機速度較慢，受影響樓層的防火係統已經被部分更新；位於雙塔附近的萬豪酒店、美國海關、希爾頓酒店等建築也遭到破壞。
上午10時35分：警方接到報告，稱華盛頓美國國務院門外的一輛汽車中裝有炸彈，後被證實並未發生任何意外。
上午10時39分：美國總統布什發布命令，在緊急情況下，空軍可以擊落任何有可能進行襲擊的飛機。
上午10時45分：CNN報導華盛頓與紐約市已經開始進行全麵疏散工作。聯合國總部已經清空。幾分鍾後，紐約市長下令疏散曼哈頓地區。
上午10時53分：紐約市暫時取消市長選舉活動。
上午11時16分：美國航空公司證實該公司的兩架飛機失事。
上午11時17分：聯合航空公司證實93次航班失蹤，並表示“非常關注”175次航班。上午11時53分：聯合航空公司證實該公司的兩架飛機失事。
上午11時55分：美國與墨西哥的邊境處高度戒備狀態。
大約中午12時00分：美國總統喬治·布什抵達位於路易斯安那州的巴克斯達爾空軍基地（BarksdaleAirForceBase）。他原本訪問佛羅裏達州薩拉索市（Sarasota）討論有關教育政策問題，按原計劃此時應已經返回華盛頓。他發表了一個簡短的非正式聲明，稱無法容忍在美國本土的恐怖襲擊事件，又說“自由已經遭到襲擊，但它會最終得到保護”。
中午12時02分：阿富汗塔利班政權發表聲明譴責襲擊事件。
中午12時04分：洛杉磯國際機場關閉。
中午12時15分：舊金山國際機場關閉。
中午12時16分：美國48個州的機場停止所有商業與私人航班。
下午1時04分：美國總統布什在巴克斯達爾空軍基地宣布全球美軍進入高度戒備狀態，隨後前往位於內布拉斯加州的戰略空軍指揮部（StrategicAirCommand,SAC）。後來有多名政治評論員批評總統看似毫無目的的漫遊。
下午1時27分：哥倫比亞特區宣布進入緊急狀態。
下午1時44分：2艘航空母艦開進紐約港，5艘軍艦駛入東海岸。
下午4時00分：媒體引述聯邦情報機構高級官員的分析認為本·**是最有可能發動襲擊的人。
下午4時25分：紐約證券交易所以及美國證券交易所宣布9月12日星期三閉市一天。下午5時30分：此前報導發生火災的47層高樓世貿中心7號樓（WTC7）倒塌。大樓內設有專門負責應變類似911的緊急狀況的紐約市特殊緊急中心。大樓的倒塌也輕度破壞了附近的紐約電話大樓等建築。
下午6時00分：CNN（美國有線電視新聞網）和BBC（英國廣播公司）分別報導阿富汗首都喀布爾發生連串爆炸與交火事件。後來報導顯示阿富汗北方聯盟用直升機襲擊了喀布爾機場。
下午6時00分：伊拉克政府在國營的電視台發表官方聲明，稱事件是對“美國反人類罪行”的報應。
下午6時54分：美國總統布什抵達白宮。
下午7時30分：美國政府否認對喀布爾爆炸事件負責。
下午8時30分：美國總統布什在白宮向全國發表電視講話。他在演說中稱，“恐怖主義攻擊可以動搖我們最大建築物的地基，但無法觸及美國的基礎。這些恐怖行動摧毀了鋼鐵，但不能絲毫削弱美國鋼鐵般的堅強決心。這個電視講話也使小布什總統的民眾支持率達到他8年任期的最高峰，高達百分之八十九點五八。
下午9時00分：美國總統布什會見國家安全會議全體成員，半小時後又與高級顧問們會麵。布什與同僚們認定本·**是事件的幕後主使。
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