整編軍議的一開始，就宣布了汝寧軍各支軍團的組成和主官的任命。汝寧軍的武裝力量分為了戰兵、民團和護莊、護路、護礦隊。吳世恭將成為武裝力量的最高指揮。
薛永利將為整支汝寧軍戰兵的正統領，周巡為副統領。但是他們在平時隻能夠指揮戰兵軍團，用現代的話來說，就是隻能夠指揮野戰部隊。隻有在戰時，在吳世恭的授權或者緊急狀態下，他們才可以指揮就近的汝寧軍其他武裝力量。
而在這裏，戰兵將是全脫產、拿軍餉的兵丁組成，武器裝備也是最好，他們將是未來作戰的主力。而這次汝寧軍的戰兵將增至一萬五千人；
民團也升格為二線部隊，也是全脫產，不過武器裝備差一些，軍餉也低一些。民團的主要任務就是防禦要塞和維持地方的作用，還有在作戰時起到運輸和輔助的作用。形象地形容一下，就象是現代的武警部隊一樣。這次最終商議，民團建立了十二個，每個民團五百人，共六千人。
但其中有一個民團將比較特殊，就是餘子璉為知縣的那個民團。這個民團如何處置將由吳世恭和張學斌與姚員外這些歸德當地士紳商議以後再做決定；
而護莊、護路和護礦隊，就是半脫產的民兵組成了。他們將由退役的老兵率領，使用著汝寧軍淘汰的武器和簡陋的武器，為汝寧軍控製地方起到作用。當然，在作戰的時候，也能夠輔助作戰的。
由於吳世恭收容的難民增多，汝寧軍將會讓所有的適齡男丁共五萬三千多人全部參加軍訓，並且規定每人在護莊、護路和護礦隊每年服役一個月。因此在平時，這支民兵隊伍將有四千五百人左右。但戰時甚至可以總動員。
此外，還有薛強率領的一千五百人的內務司部隊，他們平時將起到維持地方治安和剿匪的工作。當然，在剿匪的過程中，當獲得授權以後，內務司可以讓汝寧軍的其他武裝力量配合。
還有薛誌農的山川司行動隊和外圍打行成員近五百人。這次吳世恭也將把這支武裝力量正式歸入汝寧軍的管理。
至於歸德衛趙銘指揮的那些軍戶，吳世恭準備讓俞繼這些原歸德衛的軍戶通過關係滲透進去，爭取盡可能多的歸德衛軍戶支持。
還有就是盟軍了，不過現在說得上歸於汝寧軍指揮的盟軍，也隻有南陽守備李祿率領的三百多名親兵和南陽私鐵礦礦主私募的一千一百多名家丁了。
但是這種同盟是相當鬆散的。隻有在共同利益下，這些盟軍才會歸汝寧軍指揮。而且除了李祿的親兵以外，其他的那些盟友的戰鬥力，也就是比欺壓百姓好上一些，根本就是靠不住。
汝寧軍戰兵的五大軍團不變。吳世恭在軍議上宣布了正副軍團長和主要部隊軍官名單：
教導軍團正軍團長：李三河；副軍團長：俞繼；
南陽軍團正軍團長：赫飛；副軍團長：楚格、吳書墨；
這兩個是全編軍團。
歸德軍團正軍團長：薛強；副軍團長：錢綺；
汝寧軍團正軍團長：楊如鬆；副軍團長：梁輝；
這兩個是半編軍團。
騎兵軍團正軍團長：張彪；副軍團長：薛存壯（原薛府護衛。提拔任命）；
直屬炮隊團長：熊正恩；副團長：鞏本實；
熊正恩是原炮隊副統領。而鞏本實是原炮隊技術最好的炮長，這次是破格提拔。
直屬工兵團團長：薛存義（原薛府護衛。提拔任命。是薛存壯的堂弟）；副團長：郭明（原千戶所堡壘軍戶，提拔任命）；
而陶辛被任命為親兵大隊大隊長。
以下軍官的任命也不細表了。不過這次整編，基本上所有的軍官都升了一級。不過升遷最快的就是周巡、錢綺等四人，還有梁輝炮隊的這些人。
這也可以看出，汝寧軍中，多參加戰鬥的軍官升遷就快。騎兵和炮兵的軍官升遷也快。當然最高興的就是這時候旁聽的楊狗蛋，他是兒子、女婿雙豐收。
南陽軍團之所以設立倆位副軍團長，主要是因為書墨還要主持龍眼寨和羅家鎮大營的建造，還要為汝寧軍組建起有效的前沿防線。所以暫時還是留任。
而岡薩雷斯這些葡萄牙的軍官，除了幾位造炮和造彈藥的工匠調任到了工坊司以外，還留下了近二十名。他們暫時先作為顧問幫助此次整編，不授實職。
這次任命，還空餘了副連長以上的軍官五十幾位左右，等此次整編結束以後，汝寧軍中包括葡萄牙軍官在內的優秀軍官，才會提拔任命。