貞觀十四年（公元640年），已經是四十一歲中年人的玄奘回那爛陀寺。這次出遊曆時整整四年。
本來在離開中國之前，玄奘在中國就已經是頂尖高僧了，西行這十四五年以來，他不恥下問，兼收並蓄，再加上數萬裏雲遊之中的旁搜博探，可以說，此時的玄奘精通經、律、論三藏，學兼大小乘二教，橫洞百家，佛學知識已經超越了當時印度水平最高的兩位大師——戒賢大師和勝軍居士，達到了無人企及的高度。玄奘又有了一個響亮的稱號——唐三藏。精通經、律、論三藏的法師會被稱為三藏法師，因玄奘來自大唐，故特稱為“唐三藏”。玄奘也是史上第一個被稱為“三藏法師”的中國人。
玄奘回到那爛陀寺後，本計劃馬上準備回國。戒賢大師卻請他出任教授師，為僧眾開講《攝大乘論》及《唯識抉擇論》。因而，玄奘也就成為那爛陀寺所聘請的第一位中國教授。
那爛陀寺所傳授的學說，雖以無著、世親為中心，但同時也網羅了當時大小乘學者以及世俗的各類學者在這裏講學，形成了各抒己見、百家爭鳴的自由風氣。那爛陀寺不是以對峙的態度來處理各派學術，而是把它們作為一個全體來分科。這樣，講學的規模日趨完整，學者們都從全體著眼而不拘於一家之言。
在玄奘講學於那爛陀寺之前，師子光在寺中開講《中論》、《百論》，並有意地與瑜伽行派相對峙，批斥《瑜伽師地論》。在玄奘入寺之前，師子光就已經是著名的三藏法師了，他敢於在瑜伽行派的根據地——那爛陀寺公開挑戰，自有其非凡的才智與學識。一時間，那爛陀寺的眾多瑜伽派論師，竟然無人能與之抗衡。
身為那爛陀寺住持的戒賢大師，寬宏慈悲，他老人家不是將“異類”的師子光強行趕出寺門，而是讓自己最得意的弟子、當時瑜伽行派學識最淵博的論師——玄奘出馬，在師子光的講壇旁邊同時再開一壇，宣講瑜伽派教義。兩位著名論師在同一時間、同一地點，弘揚中觀、瑜伽兩種爭論了上百年的學說，這是多麼有趣又何等壯觀的學術勝景！
玄奘對《中論》、《百論》和《瑜伽師地論》都有很深的研究與心得，知道兩者有同一法源，決不會互相抵觸。之所以會產生誤解，是研究者本身無法融會貫通而造成的，絕不是那一種法本身的缺陷。為了讓大家能了解兩者其實不相違背的道理，玄奘專門用梵文撰寫了相當於漢文八萬四千字的《會宗論》三千誦。論著寫成之後，呈予戒賢大師與寺內大眾評閱，讀過的人無不稱許讚歎。玄奘據此與師子光數次論戰，也無往而不利。師子光辯不過玄奘，敗下陣來。於是，原來聽他講課的那些學僧，漸漸都跑到了玄奘的講壇。從此，玄奘在印度的聲望越發如日中天。
(本章完)