至正二十八年八月二十日，明軍進城，淮王帖木兒不花、左丞相慶童、右丞相張康伯、平章政事迭兒必失、樸賽因不花、禦史中丞滿川、都路總管郭允中全部戰死，元朝滅亡。元朝從太祖開國到順帝北逃，共一百六十二年。從元世祖統一中原到順帝亡國，隻有八十九年。
徐達指揮明軍進城後，禁止士兵施暴搶劫，封住國庫以及圖籍、寶物，命令指揮張勝監守宮門，任何人不得擅入。百姓安然無恙，城內秩序井然。徐達報捷，太祖傳旨獎賞，並命他率軍向西進發。徐達又率領常遇春等人進入山西，擊敗擴廓帖木兒，順道殺奔關中，收降李思齊等人。不久聽說元兵還在塞外出沒，又返回燕京準備北伐。洪武二年，出師拔掉開平，元順帝逃奔和林。洪武三年又再次北伐，元順帝又逃到應昌。不久，元順帝逝世，諡號為惠宗。明太祖因為順帝順天退位，追封諡號為順帝。
明軍又進軍攻克應昌，元太子愛猷識理達臘倉促北逃，他的兒子買的裏八剌以及後妃、親王等人來不及隨行，都被抓獲，被送到應天。明太祖下詔特赦，並且封買的裏八剌為崇禮侯。元朝的參政劉益在遼陽投降，漠北又平定了，明太祖遂詔告天下。洪武四年，又派湯和、傅友德進軍四川，這時明玉珍已經去世，兒子明升繼位，發兵抵抗明軍，屢戰屢敗，沒辦法隻得投降。明太祖封他為歸義侯。於是華夏大地全部歸入大明。
先前西域分封時共有四國，自從察合台可汗也先不花吞並窩闊台可汗的封地後，就成了三足鼎立之勢。也先不花死後，國勢逐漸衰落。到元順帝至正十九年，察合台的後裔特庫爾克繼位，又重新檢閱兵馬，征服叛亂。部下有個首領叫帖木兒，是蒙古疏族人，驍勇善戰，所向無敵，立下赫赫戰功。特庫爾克死後，兒子愛裏阿司繼位，同帖木兒不合。於是帖木兒占據了中央亞細亞，自己建國，定都撤馬兒罕。不久他又趕走愛裏阿司，吞並了察合台汗國全境。當時伊兒國可汗亞爾巴孔軟弱不振，部下大多割據獨立，互相爭鬥不止，帖木兒又出兵掃平，然後乘勢占領，兩國合並為一。最後隻剩下一個欽察汗國同他抗衡。
欽察可汗統轄俄羅斯各部，威震西方，拔都的後代月即別可汗和兒子劄尼別可汗二代統治俄羅斯諸侯，氣焰囂張。莫斯科大公宜萬一世最得欽察可汗的信任，他借機發展，後來俄羅斯的興盛，其實就是從那個時候開始的。劄尼別死後，國家大亂，俄羅斯諸侯紛紛獨立。帖木兒帶兵討伐，安定全境，扶立脫克達米昔為欽察可汗。等到帖木兒回軍，脫克達米昔又拓展土地，反而入侵帖木兒境內。帖木兒怎肯善罷甘休，立即親自率領大軍前去討伐，趕走脫克達米昔，另立一位可汗名叫可裏的克，表麵上讓他管轄，實際上仍歸自己節製。
帖木兒吞並西域後，又向南進攻印度，入侵母兒坦，攻陷疊爾黑。不久，因為突厥遺種阿斯曼國部長巴賈塞脫勾結阿非利加洲的埃及國，夾擊帖木兒的屬地，帖木兒隻好回軍拒敵。一戰就打敗埃及軍隊，再戰就活捉了巴賈塞脫，平定了小亞細亞全境，聲威大震，於是招集蒙古各個王族大舉向東，竟想恢複中原，統一天下，複興元世祖的偉業。無奈天意難違，元朝氣數已盡，這位大名鼎鼎的帖木兒竟然中途病死，沒有損傷明朝一片土地，元朝至此徹底滅亡。
有人曾作詩四首以紀念元朝的興衰成敗，今記錄如下，作為全書的結束：
開疆容易守疆難，文治無聞運已殘；
八十九年元社稷，徒留戰史付人看！
累朝佞佛太無知，釋子居然作帝師；
果有如來應一笑，百年幻夢被僧欺。
到底華夷俗不同，上烝下亂竟成風；
濠梁幸有真人出，才把腥羶一掃空。
大好江山付劫灰，前車已覆後車來；
須知殷鑒原非遠，試看全書六十回。