南梟盧循
盧循，孫恩妹夫，參加孫恩起義。元興元年三月，孫恩投海自盡後，盧循率義軍餘部數千人繼續堅持鬥爭。桓玄攻進建康執掌東晉朝權後，為安撫浙東，以盧循為永嘉太守。盧表麵受令，暗自擴展勢力。五月，盧循入東陽（今浙江金華），被劉裕擊敗（參見劉裕擊桓玄之戰）。元興二年，盧循派徐道覆率軍進攻東陽、永嘉（今浙江溫州），被東晉建武將軍劉裕擊敗，由海道南撤。三年十月，盧循攻克番禺（今廣州市）、始興（今廣東韶關西南），自稱平南將軍，攝廣州事。劉裕平桓玄之亂後控扼東晉朝政，於義熙元年(405年）四月，任命盧循為廣州刺史，盧循姐夫徐道覆為始興相。義熙六年(410年）春，盧循和徐道覆乘劉裕北伐南燕，後方空虛之機，實施北征。率軍在始興會合，然後分東西二路北上，進入湘州（治今長沙）與江州（治尋陽，今江西九江西南）諸郡，一路勢如破竹，擒斬鎮南將軍何無忌，大敗荊州刺史劉道規和豫州刺史劉毅等。義軍10餘萬，聲威大震。徐道覆力主東進，盧循猶豫數日才勉強同意，遂自桑落洲（今江西九江東北）進抵淮口（今江蘇南京西北秦淮河口），逼近兵力不過數千的建康，城內人心震恐，內外戒嚴。劉裕聞訊，自北伐前線急返京師，部署防衛。盧循優柔寡斷，貽誤戰機，義軍兵臨建康近兩月，兵疲糧乏；被迫於七月初南還尋陽。十二月，被劉裕追及，大破於大雷（今安徽望江）、左裏（今江西都昌西北左蠡山下），被迫轉而南向始興、番禺撤退。義熙七年二月，晉將孟懷玉攻破始興，義軍驍將徐道覆戰死。盧循率餘部至番禺，但該城已為劉裕部將孫處由海道襲取，遂於四月退至交州（今越南北寧省仙遊東），遭火攻兵敗，投水自殺，起義失敗。義熙七年(411年），劉裕派兵擊殺徐道覆，盧循久攻番禺不下，轉往交州。此時交州刺史杜瑗病亡，朝廷有詔令其子杜慧度襲職，慧度尚未接詔，盧循已襲破合浦，徑向交州搗入。慧度悉散家財，號召中州文武六千人於石埼應戰，一舉擊敗盧循，盧循見大勢已去，以酒毒死妻子，再殺死不願殉死的美妾，投水自殺。杜慧度得勝後，殺盧父，尋得盧循屍身，把首級割下，再加上李脫等人頭顱共七人，用小箱子精致包裝，送往建康。廣州等大部分地區收複。
滅劉毅
劉毅[東晉]（？～412)中國東晉北府兵將領。字希樂，小字盤龍。彭城沛（今屬江蘇沛縣）人。曾為桓弘中兵參軍。元興二年(403)桓玄代晉建楚國，劉毅與孟昶、劉道規等在廣陵起兵反對，斬青州刺史桓弘，與劉裕攻入建康，為冠軍將軍。義熙六年(410)，與農民起義軍首領盧循戰於桑落洲（今江西九江東北長江中），大敗，降為後將軍。旋又為荊州刺史，據長江中遊。他與劉裕協同討平桓玄，而功居其次，意常怏怏，求與裕抗衡。後劉裕受詔討伐，劉毅兵敗，自縊於江陵，劉裕遂率軍攻克江陵。
滅司馬休之
司馬休之(?～約417年）東晉大臣。字季豫，河內溫（今溫縣）人。晉天興五年(404年），任荊州刺史。後被桓玄逼迫，投奔慕容德。桓玄被殺後，休之又回晉，仍任荊州刺史，在任為吏民所擁護。其子文思謀殺劉裕，被劉裕發覺，劉裕將文思交給休之，讓他處置。休之上表請廢文思，並寫書信給劉裕以謝罪。神瑞中，裕殺休之子文寶、休之兄子文祖，並率軍進攻休之。休之舉兵反抗，兵敗率眾投奔後秦。義熙十一年（415年）四月，劉裕擊敗司馬休之四萬軍隊，攻克江陵，直搗襄陽。休之父子、魯宗之等逃往後秦依附姚興。義熙十三年(417年）劉裕滅姚泓，後秦亡，司馬休之等數百人向司徒長孫嵩請降，月餘，卒於軍隊中。追贈征西大將軍、右光祿大夫，諡始平聲公。
總結
劉裕自平定桓玄之亂後，從義熙五年（公元409年）開始，帶兵征討，進行了消滅割據勢力的統一戰爭。他先後攻破南燕（今豫、魯一帶），殺了南燕王慕容超，收複青州；南下擊潰盧循，收複廣州；攻克江陵，殺了割據者劉毅；力取成都，滅了割據者譙縱；直搗襄陽，趕跑了割據者司馬休之。義熙十一年（公元415年），至此，自桓玄作亂以來，南方各大割據勢力，全部滅亡，南方歸為一統。東晉境內，全由劉裕勢力統治了。東晉王朝早已名存實亡。