然而，如今被否定的，正是他惟一自信的革命堅定性！他對秘書說："到底我是左派，還是右派，他們說了不算，我說了也不算，還是要曆史來做結論！善有善報，惡有惡報，事情最終會弄清楚！"
"九大"如期在北京召開。按照大會的嚴格規定，陳毅不帶秘書，一人住進了京西賓館。
不知是曆史的巧合，還是有意的安排，會議期間，陳毅被安排在上海小組討論。早在開會之前，由張春橋、姚文元把持的上海市委為了肅清陳毅在上海的影響，特地炮製了一個《陳毅黑話》分發給上海市參加"九大"的每一位代表。
陳毅第一天參加會議就受到了批判。那天，當他走進會議室時，有幾位代表站了起來，親熱地與他握手、問好，陳毅微笑著一一還禮。再往前走，有人故意當著他的麵不打招呼，假裝沒有看見；有的還指指點點，像觀賞一個什麼怪物似的。陳毅並不知道，剛才握手的那幾位，都是代表團的"右"派代表。市委編印的《陳毅黑話》沒有發給他們。
陳毅剛坐下，徐景賢突然領頭呼喊："打倒陳毅！陳毅罪該萬死！"整個會場的氣氛頓時緊張了起來。
陳毅有點氣憤，但他並不驚慌，他緩緩地站起身來，麵對周圍冰冷、生疏的麵孔，語調緩重地說："諸位代表，各位同誌，我在'文化大革命'中，犯有嚴重的錯誤。承蒙上海黨選我為九大代表，我一定要。"
"陳毅！"陳毅的話還沒有說完，一個人就站起來惡狠狠地說，"在黨的會議上，你竟敢繼續反黨！"頓時，口號聲震耳欲聾。黨的代表大會一下子變成了對陳毅的批判會。
陳毅十分心寒。
多少年來，陳毅對毛澤東有著深厚的感情，對他老人家也是無限忠誠。對於毛澤東親自發動和領導的這場"文化大革命"，陳毅開始就很不理解。但是，他還是要緊跟毛澤東，積極地參加到這場讓他不理解的"文化大革命"之中去。因為在他的心目中，毛澤東在每一次的政治鬥爭中總是正確的。
他曾經說過："偉大的毛澤東思想，我們永遠跟不上的，但我們要盡量地跟。我經常在估計形勢。我是靠這個吃飯的，這場'文化大革命'我是完全沒有估計（到）的，是很不自覺，很不理解。"這就是陳毅在"文化大革命"初期的心態。因此，在這一時期，陳毅不僅自己積極參加"文化大革命"，而且還要求身邊的同誌和自己的子女也要這樣做。一次，他在七機部工作的兒子回家，當他得知七機部正開群眾大會時，便催促兒子趕快回去參加大會。他說：你應積極參加群眾運動，不要自己跑回來，應參加大家的鬥爭。運動剛開始不久，當華東某省委書記來找他，向他訴說心中的苦悶時，他還勸這位省委書記要接近群眾，采納正確意見。
在"文化大革命"初期，陳毅為了能緊跟毛澤東，他對"文化大革命"還是盡量往好的方麵去理解。1966年9月下旬，在一次國務院工作會議上，陳毅從曆史與發展的角度，談了自己對"文化大革命"的認識。他說，"文化大革命"與過去曆次政治運動一樣，目的是為了弄清思想，改革不合理的製度，以達富國強兵之宏圖。不久，他又說，為什麼要開展一個"文化大革命"，我在考慮這個問題。我考慮的結果，不搞這場"文化大革命"危險性很大。搞這場"文化大革命"我們的政權才能鞏固。"文化大革命"中，各種思想、各種組織的出現，合乎"文化大革命"的邏輯、世界革命的邏輯。"毛澤東同誌有偉大的革命氣魄，敢幹，敢搞這場無產階級文化大革命。我讚成這種革命造反精神。"同年11月13日，陳毅在接見軍事院校師生大會上又說，在路線鬥爭問題上，毛澤東主席一直是正確的，而且最會作路線鬥爭，我們最佩服的也是他。
為了將"文化大革命"健康地開展下去，陳毅還向毛澤東提出了"教會娃娃們搞路線鬥爭"的建議。那是在1966年8月31日的天安門城樓上，陳毅見到了毛澤東，他對毛澤東說："主席，現在年輕娃娃沒有參加過路線鬥爭，也不懂什麼叫路線鬥爭。我想，應該給他們講講曆史，用我自己的經驗教訓，教會娃娃們搞路線鬥爭。你看行不行？"
"好嘛！"毛澤東吸了口煙，欣然應允。
於是，陳毅便利用一切機會從自己在過去的路線鬥爭中的經驗教訓出發，針對當時的情況大講特講"要學會搞路線鬥爭"的問題。
但是，隨著"文化大革命"運動的發展，陳毅對這場運動越來越感到不理解了，他開始陷入深深的迷惘和困惑之中。
1967年曾被周恩來稱為"最不平靜的一年"。這一年，由"文化大革命"造成的混亂局麵在全國有了進一步蔓延。年初，在所謂"一月風暴"的狂飆中，全國到處掀起"奪權"的浪潮，各級黨政機關很快陷入了癱瘓狀態；在不到一個月的時間裏，一個個領導幹部挨批鬥、被整死。林彪、江青這一夥陰謀家、野心家為了達到他們的罪惡目的，惟恐天下還亂得不夠，他們亂了我們的國家，亂了我們的黨，還要亂我們的軍隊。這一切使人們對林彪、江青這一夥陰謀家的野心有了越來越清楚的認識，從而對他們的各種罪惡活動不能不引起極大的憤慨，胸中積滿了怒火。"文化大革命"以來，陳毅為了顧全大局，曾一忍再忍，一退再退，現在他已經不能再忍，不能再退了，他要和老帥們起來抗爭。他說："我死了也不服氣，我拚了老命也要鬥爭，我也要造他們的反！""大是大非問題不能哼哼哈哈，要人順順從從，我不幹！我的講話可能觸犯一些人，我個人可能慘遭不幸，但是，如果我因此不敢講自己的意見，我這個共產黨員就一錢不值！"又說："我知道，隻要我講話，就會有人說我陳毅又跳出來了。對！快要亡黨亡國了，這時不跳，更待何時！"
2月中旬，一場公開的抗爭終於在懷仁堂爆發了。
2月11日下午，由周恩來主持召開的中央政治局碰頭會在懷仁堂舉行。在這次會上，葉劍英對陳伯達說："你們把黨搞亂了，把政府搞亂了，把工廠農村搞亂了，你們還嫌不夠，還一定要把軍隊搞亂。這樣搞，你們想幹什麼？"徐向前拍著桌子說："軍隊是無產階級專政的支柱，你們這樣把軍隊亂下去，還要不要這個支柱！難道我們這些人都不行啦？要蒯大富這類人來指揮軍隊嗎？"這時康生蠻不講理地說："軍隊不是你徐向前的，你有什麼了不起？"葉劍英責問："上海奪權，改名為上海公社。這樣大的問題，涉及到國家體製，不經政治局討論，就擅自改名稱，又是想幹什麼？"他問陳伯達："我們不看書，不看報，也不懂得什麼是巴黎公社的原則。請你解釋一下，什麼是巴黎公社的原則？革命，能沒有黨的領導嗎？能不要軍隊嗎？"會後，陳毅小聲地對葉劍英說："劍公，你真勇敢！"
這次會議是小試鋒芒，大的抗爭還在後頭。2月16日下午，陳毅夾著皮包，邁著緩慢沉穩的步子又走進懷仁堂會議室。周恩來總理和李富春、譚震林、李先念幾位副總理也來了。葉劍英、徐向前、聶榮臻以及肖華、楊成武等一身戎裝，邁著軍人特有的莊嚴步伐也來了。過一會兒，江青、張春橋、姚文元、康生、陳伯達等也慢騰騰地走了進來。
一場激烈的抗爭開始了。
請看當時由張春橋、姚文元、王力"集體整理和核對"的這次會議記錄。
開會前，譚震林提出要張春橋保陳丕顯，張說，我們要回去同群眾商量一下。譚震林打斷了話，大發雷霆說：什麼群眾，老是群眾群眾，還有黨的領導嗎！不要黨的領導，一天到晚老是群眾自己解放自己，自己教育自己，自己鬧革命，這是什麼東西？這是形而上學！你們的目的，就是要整掉老幹部。你們把老幹部一個個打光，把老幹部都打光。老幹部一個一個被整，40年的革命，落得家破人亡，妻離子散。這一次，是黨的曆史上鬥爭最殘酷的一次，超過曆史上任何一次。江青把我整成反革命，她是當著我的麵說的。（謝富治插話：江青和小組的同誌多次保留林同誌，從來沒有說過什麼反革命。）我就是不要她保！我是為黨工作，不是為她個人工作！
譚震林說到這裏，站起來拿衣服要走，說：讓你們這些人幹，我不幹了！砍腦袋，坐監牢，開除黨籍，也要鬥爭到底！
陳毅說：不要走，要留在這裏跟他們鬥爭！這些家夥上台，就是他們搞修正主義。曆史不是證明了到底誰是反對毛主席嗎？以後還要看，還會證明。斯大林不是把班交給了赫魯曉夫，搞了修正主義了嗎？
餘秋裏拍桌子發言：這樣對老幹部，怎麼行？
譚震林說：我從井岡山到現在，你們檢查一下，哪裏有一點反毛主席？（謝富治說：不要從個人出發，要從全局出發。）我不是為了自己，是為了整個的老幹部，是為了整個黨。
從這個經過整理的記錄來看，陳毅當時講的這些話，觸及了三個重要的"痛點"問題：一是斯大林，二是赫魯曉夫，三是延安整風中的內部問題。這三個問題對毛澤東來說都是十分敏感的問題。因為"晚年斯大林"的意思或暗示，是毛澤東最忌諱的話題；而現在毛澤東把班交給了誰，誰相當於赫魯曉夫，是路人皆知；至於延安整風，運動本身是偉大的，但其中有些問題，頗為重要和敏感，從來心照不宣。如今陳毅真是"哪壺不開偏提哪壺"了。
這就是所謂的老帥們"大鬧懷仁堂"。
陳毅在行將告別人世的最後幾個年頭裏，他對毛澤東的真摯情感是十分動人的，盡管這種動人的感情帶著苦澀和悲愴的味道
陳毅在"二月逆流"中的表現引起了毛澤東的怒火。但是，毛澤東並不像林彪、江青一夥那樣要乘機把陳毅等老帥們統統打倒，而是他對親自發動和領導的"文化大革命"太熱心了，容不得人有半點的反對。正如鄧小平所說："誰不聽他的話，他就想整一下，但是整到什麼程度，他還是有考慮的。"陳毅挨了整，但他對毛澤東幾十年的情感，並沒有因此而有所減弱，相反，在行將告別人世的最後幾個年頭裏，陳毅對毛澤東的真摯情感是十分動人的，盡管這種動人的感情帶著苦澀和悲愴的味道。
1969年10月，中央決定：10月20日之前，在京老同誌全部戰備疏散。陳毅原定去開封，徐向前考慮自己身體比陳毅好些，石家莊醫療條件較開封好，便向周恩來提出，讓陳毅去石家莊，他自己去了開封。
陳毅到石家莊後不久，就經常感到腹部隱痛並伴有腹瀉。張茜為陳毅的身體深感不安，她同陳毅商量："還是回北京去檢查一下吧？"
陳毅執拗地搖了搖頭。後來，張茜見陳毅的身體日漸消瘦，疼痛不斷加劇，便給周恩來寫了一封信，請求批準返京治病。周恩來接信後立即同意。
1970年10月21日，在石家莊已經生活了一年的陳毅和張茜回到了北京。由於黃永勝、李作鵬、邱會作等人的阻撓，陳毅的病在301醫院一直沒有得到正常的治療。
1971年來到了，陳毅的病又發生了變化，住進了醫院，經外科主任檢查，摸到他腹部右側有一個很大的硬塊，按上去痛區明顯，由此診斷是"亞急性闌尾炎"，須立即開刀。
1月16日下午5時，周恩來接到301醫院要為陳毅動手術的報告，立即批準了手術，並派自己的保健醫生陪張茜一起前往醫院。
晚6點15分，手術開始了。
剛過幾分鍾，手術室裏突然慌亂起來。原來，腹腔被打開後，醫生才發現，陳毅的闌尾是好的，真正的病因是靠近肝區處的結腸癌，並已有局部淋巴結轉移，侵及附近肝髒。由於病發部位較高，隻得將開闌尾的切口向上延長為丁字形，盡目力所及，把已經轉移的癌細胞盡力切除幹淨。因為手術室根本沒有做大手術的準備，手術隻能做做停停，原先預定半小時的手術，整整做了5個多小時。
手術後，陳毅連續發燒。不久，又因身體受損過度，並發心肌梗塞，經治療，兩周後才慢慢恢複。
這一年的"五一"國際勞動節的夜晚，天安門廣場燈火通明，五彩繽紛的禮花騰空而起，與廣場上身穿各民族盛裝、載歌載舞的歡慶人群交相輝映。
天安門城樓的休息廳裏，毛澤東在周恩來的陪同下，正會見西哈努克親王和其他外賓。
一向工作全神貫注的周恩來，今天似乎心緒不寧，顯得有些心不在焉。他不時地向外張望。他在找誰呢？
"主席，您看，今天陳毅同誌來了！"周恩來異常激動地招呼著。
"主席，您好！"身穿軍裝的陳毅笑容滿麵地加快腳步走到毛澤東麵前，尊敬地行了個軍禮。
毛澤東興奮地站起身，伸出大手握著陳毅的手，關切地詢問他的健康情況。
這是陳毅重病後第一次見到毛澤東。"主席，好了，好了！"陳毅高興地答複。
這幾個月，瞧著陳毅的身體逐漸恢複，陳毅身邊的工作人員臉上都有了笑容，就連大半年來一直憂心忡忡的張茜，也舒展開了緊鎖的眉頭。
不久，"九·一三"事件發生，林彪、葉群等出逃，摔死在蒙古溫都爾汗荒原上。陳毅知道這一消息後，十分激動。他仿佛忘記了自己是一個重病人，忘記了時間，全身心投入到了批判林彪的鬥爭中去。在中央召集的老同誌座談會上，他帶著病痛兩次作長篇發言，滿腔義憤地將紅軍創建初期林彪的曆史真麵目作了係統、全麵的揭發。
經過這次竭盡生命全力的殊死搏鬥，陳毅又病倒了。這一病倒就再也沒有起來。
1971年12月26日清晨5點鍾，大地還在黑夜中沉睡，經常處於昏迷狀態的陳毅突然睜開了雙眼，他握著一直守護在病床邊的女兒珊珊的手，虛弱地說："我要吃麵條。"
在幾個孩子中，由於珊珊最小，陳毅也就最疼愛這個寶貝女兒，珊珊也最愛自己的爸爸。聽到陳毅要吃麵條，珊珊連忙說："爸爸您等一會兒，我就去端來！"珊珊興衝衝地走出病房，心裏甜滋滋的：這些天爸爸總不能吃東西，今天想吃，恐怕是病情緩解了。但願蒼天有眼哪！
陳毅已多天不能進食了。當珊珊把麵條端來喂他時，他吞咽非常緩慢、困難，每吞一口，額頭上都冒出豆大的汗珠。但陳毅仍然堅持吃了幾根麵條。今天，陳毅為什麼想起吃麵條呢？
直到7點鍾，醫生進屋查房，這個謎才揭開。當陳毅看到醫生時，他費力地說："今天是12月26日，毛主席的生日，我早上吃了麵條，我要爭取年底下床走一走。"
聽了陳毅的話，醫生和護士們的眼睛潮濕了，站在一旁的珊珊這才恍然大悟，淚如泉湧。陳毅從10月底臥床，到今天已經有兩個多月了，屋子裏既沒有掛日曆，也沒有任何人提醒他，他又是怎麼知道今天是毛澤東的生日的呢？他是每天在心裏算著這個日子啊！在生命之火即將熄滅之時，陳毅想的不是自己，也不是家人，而是毛澤東。如果陳毅對毛澤東沒有深厚的感情，又怎麼能做到這一點呢！